हीटमैप ड्रॉअर का उपयोग हीट मैप ड्राइंग के लिए किया जाता है, जो मैट्रिक्स डेटा को फ़िल्टर, सामान्य और क्लस्टर कर सकता है। इसका उपयोग ज्यादातर विभिन्न नमूनों के बीच जीन अभिव्यक्ति स्तर के क्लस्टर विश्लेषण के लिए किया जाता है।
एनआर, केईजीजी, सीओजी, स्विसप्रोट, ट्रेमबीएल, केओजी, पीएफएएम सहित डेटाबेस में अनुक्रमों को संरेखित करके FASTA फ़ाइल में अनुक्रमों में जैविक कार्यों को संलग्न करना।
ब्लास्ट (बेसिक लोकल एलाइनमेंट सर्च टूल) समान जैविक अनुक्रम वाले क्षेत्रों को खोजने के लिए एक एल्गोरिदम और प्रोग्राम है।यह इन अनुक्रमों की तुलना अनुक्रम डेटाबेस से करता है और सांख्यिकीय महत्व की गणना करता है।ब्लास्ट में अनुक्रम प्रकार के आधार पर चार प्रकार के उपकरण होते हैं: ब्लास्टन, लास्टपी, ब्लास्टएक्स और टीब्लास्टन।