उच्च मार्कर खोज दक्षता- उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण तकनीक पूरे जीनोम के भीतर सैकड़ों हजारों टैग खोजने में SLAF-Seq की सहायता करती है।
जीनोम पर कम निर्भरता- इसे संदर्भ जीनोम के साथ या उसके बिना प्रजातियों पर लागू किया जा सकता है।
लचीली योजना डिजाइन- एकल-एंजाइम, दोहरे-एंजाइम, बहु-एंजाइम पाचन और विभिन्न प्रकार के एंजाइम, सभी को विभिन्न अनुसंधान लक्ष्य या प्रजातियों को पूरा करने के लिए चुना जा सकता है।सिलिको में पूर्व-मूल्यांकन का उपयोग इष्टतम एंजाइम डिज़ाइन को सुनिश्चित करने के लिए किया जाता है।
कुशल एंजाइमैटिक पाचन- स्थितियों को अनुकूलित करने के लिए पूर्व-प्रयोग किया गया, जो औपचारिक प्रयोग को स्थिर और विश्वसनीय बनाता है।खंड संग्रह दक्षता 95% से अधिक प्राप्त कर सकती है।
समान रूप से वितरित एसएलएएफ टैग- एसएलएएफ टैग सभी गुणसूत्रों में सबसे बड़ी सीमा तक समान रूप से वितरित होते हैं, जिससे औसतन 1 एसएलएएफ प्रति 4 केबी प्राप्त होता है।
पुनरावृत्ति से प्रभावी बचाव- SLAF-Seq डेटा में दोहराव अनुक्रम 5% से कम हो गया है, विशेष रूप से उच्च स्तर की दोहराव वाली प्रजातियों में, जैसे गेहूं, मक्का, आदि।
विस्तृत अनुभव-पौधों, स्तनधारियों, पक्षियों, कीड़ों, जलीय जीवों आदि को कवर करने वाली सैकड़ों प्रजातियों पर 2000 से अधिक बंद SLAF-Seq परियोजनाएं।
स्व-विकसित जैव सूचनात्मक वर्कफ़्लो- अंतिम आउटपुट की विश्वसनीयता और सटीकता सुनिश्चित करने के लिए BMKGENE द्वारा SLAF-Seq के लिए एक एकीकृत जैव सूचनात्मक वर्कफ़्लो विकसित किया गया था।
प्लैटफ़ॉर्म | सांद्र(एनजी/जीएल) | कुल (ug) | ओडी260/280 |
इलुमिना नोवासेक | >35 | >1.6(खंड>15μl) | 1.6-2.5 |
अनुक्रमण गहराई: 10X/टैग
जीनोम का आकार | अनुशंसित एसएलएएफ टैग |
<500 एमबी | 100K या WGS |
500 एमबी- 1 जीबी | 100 कि |
1 जीबी -2 जीबी | 200 कि |
विशाल या जटिल जीनोम | 300 - 400K |
अनुप्रयोग
| अनुशंसित जनसंख्या पैमाना
| अनुक्रमण रणनीति और गहराई
| |
गहराई
| टैग संख्या
| ||
जीडब्ल्यूएएस
| नमूना संख्या ≥ 200
| 10X
|
के अनुसार जीनोम का आकार
|
आनुवंशिक विकास
| प्रत्येक के व्यक्ति उपसमूह ≥ 10; कुल नमूने ≥ 30
| 10X
|
कंटेनर: 2 मिली सेंट्रीफ्यूज ट्यूब
अधिकांश नमूनों के लिए, हम इथेनॉल में संरक्षित न करने की सलाह देते हैं।
नमूना लेबलिंग: नमूनों को स्पष्ट रूप से लेबल किया जाना चाहिए और सबमिट किए गए नमूना सूचना प्रपत्र के समान होना चाहिए।
शिपमेंट: सूखी बर्फ: नमूनों को पहले बैग में पैक करना होगा और सूखी बर्फ में दबाना होगा।
1. मानचित्र परिणाम के आँकड़े
2. एसएलएएफ मार्कर विकास
3. विविधता एनोटेशन
वर्ष | पत्रिका | IF | शीर्षक | अनुप्रयोग |
2022 | प्रकृति संचार | 17.694 | वृक्ष चपरासी के गीगा-गुणसूत्र और गीगा-जीनोम का जीनोमिक आधार पेओनिया ओस्टी | SLAF-GWAS |
2015 | नये फाइटोलॉजिस्ट | 7.433 | घरेलूकरण के पदचिह्न कृषि संबंधी महत्व के जीनोमिक क्षेत्रों को स्थापित करते हैं सोयाबीन | SLAF-GWAS |
2022 | उन्नत अनुसंधान जर्नल | 12.822 | जी. हिर्सुटम में गॉसिपियम बार्बडेंस का जीनोम-व्यापी कृत्रिम अंतर्मुखीकरण कपास फाइबर की गुणवत्ता और उपज में एक साथ सुधार के लिए बेहतर लोकी को प्रकट करें लक्षण | एसएलएएफ-विकासवादी आनुवंशिकी |
2019 | आण्विक पौधा | 10.81 | जनसंख्या जीनोमिक विश्लेषण और डी नोवो असेंबली से वीडी की उत्पत्ति का पता चलता है चावल एक विकासवादी खेल के रूप में | एसएलएएफ-विकासवादी आनुवंशिकी |
2019 | प्रकृति आनुवंशिकी | 31.616 | सामान्य कार्प, साइप्रिनस कार्पियो का जीनोम अनुक्रम और आनुवंशिक विविधता | एसएलएएफ-लिंकेज मानचित्र |
2014 | प्रकृति आनुवंशिकी | 25.455 | खेती की गई मूंगफली का जीनोम फलियां कैरियोटाइप, पॉलीप्लोइड में अंतर्दृष्टि प्रदान करता है विकास और फसल वर्चस्व। | एसएलएएफ-लिंकेज मानचित्र |
2022 | प्लांट बायोटेक्नोलॉजी जर्नल | 9.803 | एसटी1 की पहचान से बीज आकृति विज्ञान के हिचहाइकिंग से जुड़े चयन का पता चलता है और सोयाबीन के घरेलू उपयोग के दौरान तेल की मात्रा | एसएलएएफ-मार्कर विकास |
2022 | आणविक विज्ञान के अंतर्राष्ट्रीय जर्नल | 6.208 | व्हीट-लेयमस मोलिस 2एन (2डी) के लिए पहचान और डीएनए मार्कर विकास डिसोमिक क्रोमोसोम प्रतिस्थापन | एसएलएएफ-मार्कर विकास |