प्लेटफ़ॉर्म: इलुमिना नोवासेक प्लेटफ़ॉर्म, PE150
लाइब्रेरी प्रकार: 350bp सम्मिलित सीडीएनए लाइब्रेरी (पीक वितरण पर निर्भर करता है)
अनुक्रमण रणनीति: युग्मित-अंत 150 बीपी
अनुशंसित डेटा मात्रा: 2 जीबी कच्चा डेटा/नमूना
(1) अनुक्रमण डेटा गुणवत्ता नियंत्रण: न्यूक्लियोटाइड वितरण, आधार गुणवत्ता वितरण, आरआरएनए अनुपात मूल्यांकन;
(2) अनुक्रम संरेखण विश्लेषण: संरेखण परिणाम आँकड़े, अनुक्रम की संतृप्ति, अनुक्रम की कवरेज;
(3) संदर्भ जीनोम एनोटेशन (एनआर, स्विस-प्रोट, पीएफएएम, सीओजी, जीओ, केईजीजी);
(4) अभिव्यक्ति विश्लेषण: अभिव्यक्ति वितरण (दो या अधिक नमूनों के साथ), नमूनों के बीच अभिव्यक्ति का विश्लेषण (वेन विश्लेषण, सहसंबंध विश्लेषण, पीसीए विश्लेषण);
(5) विभेदक अभिव्यक्ति विश्लेषण (दो या दो से अधिक नमूनों के साथ);
(6) जीन सेट विश्लेषण: वेन विश्लेषण, क्लस्टर विश्लेषण, फ़ंक्शन एनोटेशन विश्लेषण (सीओजी, जीओ, केईजीजी), फ़ंक्शन संवर्धन विश्लेषण (जीओ, केईजीजी), फ़ंक्शन संवर्धन कॉर्डल ग्राफ, आईपैथ विश्लेषण;
(7) एसआरएनए विश्लेषण: एसआरएनए भविष्यवाणी, एसआरएनए एनोटेशन (ब्लास्ट, एसआरएनएमैप, एसआरएनएटारबेस, एसआईपीएचटी, आरएफएएम), एसआरएनए माध्यमिक संरचना भविष्यवाणी, एसआरएनए लक्ष्य जीन भविष्यवाणी;
(8) ट्रांसक्रिप्ट संरचना विश्लेषण: ऑपेरॉन विश्लेषण, ट्रांसक्रिप्शन प्रारंभ और अंत साइट भविष्यवाणी, यूटीआर एनोटेशन और विश्लेषण, प्रमोटर अनुक्रम भविष्यवाणी, एसएनपी/इनडेल विश्लेषण (एसएनपी/इनडेल एनोटेशन, एसएनपी/इनडेल क्षेत्रीय वितरण, एसएनपी सांख्यिकी)।