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बीएसए
बल्क्ड सेग्रिगेंट एनालिसिस प्लेटफॉर्म में एक-चरणीय मानक विश्लेषण और अनुकूलित पैरामीटर सेटिंग के साथ उन्नत विश्लेषण शामिल है।बीएसए फेनोटाइप से जुड़े आनुवंशिक मार्करों की शीघ्र पहचान करने के लिए नियोजित एक तकनीक है।बीएसए के मुख्य कार्यप्रवाह में शामिल हैं: 1. बेहद विपरीत फेनोटाइप वाले व्यक्तियों के दो समूहों का चयन करना;2. डीएनए के दो बड़े हिस्से बनाने के लिए सभी व्यक्तियों के डीएनए, आरएनए या एसएलएएफ-सीक्यू (बायोमार्कर द्वारा विकसित) को एकत्रित करना;3. संदर्भ जीनोम के विरुद्ध या बीच में अंतर अनुक्रमों की पहचान करना, 4. ईडी और एसएनपी-सूचकांक एल्गोरिदम द्वारा उम्मीदवार से जुड़े क्षेत्रों की भविष्यवाणी करना;5. उम्मीदवार क्षेत्रों में जीन पर कार्यात्मक विश्लेषण और संवर्धन, आदि। आनुवंशिक मार्कर स्क्रीनिंग और प्राइमर डिजाइन सहित डेटा में अधिक उन्नत खनन भी उपलब्ध है।
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एम्प्लिकॉन (16एस/18एस/आईटीएस)
एम्प्लिकॉन (16एस/18एस/आईटीएस) प्लेटफॉर्म माइक्रोबियल विविधता परियोजना विश्लेषण में वर्षों के अनुभव के साथ विकसित किया गया है, जिसमें मानकीकृत बुनियादी विश्लेषण और वैयक्तिकृत विश्लेषण शामिल है: बुनियादी विश्लेषण वर्तमान माइक्रोबियल अनुसंधान की मुख्यधारा विश्लेषण सामग्री को कवर करता है, विश्लेषण सामग्री समृद्ध और व्यापक है, और विश्लेषण परिणाम परियोजना रिपोर्ट के रूप में प्रस्तुत किए जाते हैं;वैयक्तिकृत विश्लेषण की सामग्री विविध है।व्यक्तिगत आवश्यकताओं को साकार करने के लिए नमूनों का चयन किया जा सकता है और बुनियादी विश्लेषण रिपोर्ट और अनुसंधान उद्देश्य के अनुसार मापदंडों को लचीले ढंग से सेट किया जा सकता है।विंडोज़ ऑपरेटिंग सिस्टम, सरल और तेज़।
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विकासवादी आनुवंशिकी
इवोल्यूशनरी जेनेटिक्स एक पैक्ड अनुक्रमण सेवा है जिसे एसएनपी, इनडेल्स, एसवी और सीएनवी सहित आनुवंशिक विविधताओं के आधार पर दी गई सामग्रियों की विकास संबंधी जानकारी पर व्यापक व्याख्या प्रदान करने के लिए डिज़ाइन किया गया है।यह जनसंख्या के विकासवादी परिवर्तनों और आनुवंशिक विशेषताओं, जैसे जनसंख्या संरचना, आनुवंशिक विविधता, फ़ाइलोजेनी संबंध आदि का वर्णन करने के लिए आवश्यक सभी मौलिक विश्लेषण प्रदान करता है। इसमें जीन प्रवाह पर अध्ययन भी शामिल है, जो प्रभावी जनसंख्या आकार, विचलन समय के अनुमान को सशक्त बनाता है।
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तुलनात्मक जीनोमिक्स
तुलनात्मक जीनोमिक्स का शाब्दिक अर्थ विभिन्न प्रजातियों के संपूर्ण जीनोम अनुक्रमों और संरचनाओं की तुलना करना है।इस अनुशासन का उद्देश्य विभिन्न प्रजातियों में संरक्षित या विभेदित अनुक्रम संरचनाओं और तत्वों की पहचान करके जीनोम स्तर पर प्रजातियों के विकास, जीन कार्य, जीन नियामक तंत्र को प्रकट करना है।विशिष्ट तुलनात्मक जीनोमिक्स अध्ययन में जीन परिवार, विकासवादी विकास, संपूर्ण जीनोम दोहराव, चयनात्मक दबाव आदि का विश्लेषण शामिल है।
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विकासवादी आनुवंशिकी
जनसंख्या और विकासवादी आनुवंशिक विश्लेषण मंच की स्थापना वर्षों से बीएमके आर एंड डी टीम के भीतर संचित व्यापक अनुभव के आधार पर की गई है।यह विशेष रूप से उन शोधकर्ताओं के लिए एक उपयोगकर्ता अनुकूल उपकरण है जो जैव सूचना विज्ञान में पढ़ाई नहीं कर रहे हैं।यह प्लेटफ़ॉर्म फ़ाइलोजेनेटिक वृक्ष निर्माण, लिंकेज डिसिपिलिब्रियम विश्लेषण, आनुवंशिक विविधता मूल्यांकन, चयनात्मक स्वीप विश्लेषण, रिश्तेदारी विश्लेषण, पीसीए, जनसंख्या संरचना विश्लेषण आदि सहित बुनियादी विकासवादी आनुवंशिकी से संबंधित बुनियादी विश्लेषण को सक्षम बनाता है।
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हाई-सी आधारित जीनोम असेंबली
हाई-सी एक ऐसी विधि है जिसे जांच निकटता-आधारित इंटरैक्शन और उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण के संयोजन से गुणसूत्र विन्यास को पकड़ने के लिए डिज़ाइन किया गया है।ऐसा माना जाता है कि इन अंतःक्रियाओं की तीव्रता का गुणसूत्रों पर भौतिक दूरी के साथ नकारात्मक संबंध होता है।इसलिए, हाई-सी डेटा एक ड्राफ्ट जीनोम में इकट्ठे अनुक्रमों के क्लस्टरिंग, ऑर्डरिंग और ओरिएंटेशन और उन्हें एक निश्चित संख्या में क्रोमोसोम पर एंकरिंग करने में मार्गदर्शन कर सकता है।यह तकनीक जनसंख्या-आधारित आनुवंशिक मानचित्र के अभाव में गुणसूत्र-स्तरीय जीनोम असेंबली को सशक्त बनाती है।प्रत्येक जीनोम को हाई-सी की आवश्यकता होती है।
प्लेटफार्म：इलुमिना नोवासेक प्लेटफार्म / डीएनबीएसईक्यू
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पौधे/पशु डी नोवो जीनोम अनुक्रमण
दे नोवोअनुक्रमण से तात्पर्य संदर्भ जीनोम की अनुपस्थिति में अनुक्रमण प्रौद्योगिकियों, जैसे पैकबियो, नैनोपोर, एनजीएस, आदि का उपयोग करके एक प्रजाति के पूरे जीनोम के निर्माण से है।तीसरी पीढ़ी की अनुक्रमण प्रौद्योगिकियों की पढ़ने की लंबाई में उल्लेखनीय सुधार ने जटिल जीनोम को इकट्ठा करने में नए अवसर लाए हैं, जैसे कि उच्च विषमयुग्मजीता, दोहराव वाले क्षेत्रों का उच्च अनुपात, पॉलीप्लोइड्स आदि। दसियों किलोबेस स्तर पर पढ़ने की लंबाई के साथ, ये अनुक्रमण पढ़ने में सक्षम होते हैं दोहराए जाने वाले तत्वों, असामान्य जीसी सामग्री वाले क्षेत्रों और अन्य अत्यधिक जटिल क्षेत्रों का समाधान।
प्लेटफार्म： पैकबायो सीक्वल II /नैनोपोर प्रोमेथियन पी48/इलुमिना नोवासेक प्लेटफार्म
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मानव संपूर्ण एक्सोम अनुक्रमण
रोग पैदा करने वाले उत्परिवर्तन की पहचान के लिए संपूर्ण एक्सोम अनुक्रमण (डब्ल्यूईएस) को एक लागत प्रभावी अनुक्रमण रणनीति माना जाता है।हालाँकि एक्सॉन पूरे जीनोम का लगभग 1.7% ही लेते हैं, यह सीधे तौर पर कुल प्रोटीन कार्यों की प्रोफ़ाइल का प्रतिनिधित्व करता है।मानव जीनोम में, यह बताया गया है कि 85% से अधिक रोग संबंधी उत्परिवर्तन प्रोटीन कोडिंग क्षेत्र में होते हैं।
BMKGENE विभिन्न अनुसंधान लक्ष्यों को पूरा करने के लिए उपलब्ध विभिन्न एक्सॉन कैप्चरिंग रणनीतियों के साथ व्यापक और लचीली मानव संपूर्ण एक्सोम अनुक्रमण सेवाएं प्रदान करता है।
प्लेटफ़ॉर्म: इलुमिना नोवासेक प्लेटफ़ॉर्म
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विशिष्ट-स्थान प्रवर्धित फ़्रैगमेंट अनुक्रमण (SLAF-Seq)
उच्च-थ्रूपुट जीनोटाइपिंग, विशेष रूप से बड़े पैमाने पर आबादी पर, आनुवंशिक संघ अध्ययन में एक मौलिक कदम है, जो कार्यात्मक जीन खोज, विकासवादी विश्लेषण आदि के लिए आनुवंशिक आधार प्रदान करता है। गहन संपूर्ण जीनोम पुन: अनुक्रमण के बजाय, कम प्रतिनिधित्व जीनोम अनुक्रमण (आरआरजीएस) ) आनुवंशिक मार्कर खोज पर उचित दक्षता बनाए रखते हुए, प्रति नमूना अनुक्रमण लागत को कम करने के लिए पेश किया गया है।यह आमतौर पर दिए गए आकार सीमा के भीतर प्रतिबंध खंड को निकालकर हासिल किया जाता है, जिसे कम प्रतिनिधित्व लाइब्रेरी (आरआरएल) नाम दिया गया है।विशिष्ट-स्थान प्रवर्धित खंड अनुक्रमण (SLAF-Seq) संदर्भ जीनोम के साथ या उसके बिना एसएनपी जीनोटाइपिंग के लिए एक स्व-विकसित रणनीति है।
प्लेटफ़ॉर्म: इलुमिना नोवासेक प्लेटफ़ॉर्म -
इलुमिना और बीजीआई
सिंथेसिस द्वारा सीक्वेंसिंग (एसबीएस) पर आधारित इलुमिना सीक्वेंसिंग तकनीक विश्व स्तर पर अपनाया गया एनजीएस नवाचार है, जो दुनिया के 90% से अधिक सीक्वेंसिंग डेटा उत्पन्न करने के लिए जिम्मेदार है।एसबीएस के सिद्धांत में प्रत्येक डीएनटीपी को जोड़ने पर फ्लोरोसेंटली लेबल वाले प्रतिवर्ती टर्मिनेटरों की इमेजिंग शामिल है, और बाद में अगले बेस को शामिल करने की अनुमति देने के लिए इसे क्लीयर किया जाता है।प्रत्येक अनुक्रमण चक्र में मौजूद सभी चार प्रतिवर्ती टर्मिनेटर-बाउंड डीएनटीपी के साथ, प्राकृतिक प्रतिस्पर्धा निगमन पूर्वाग्रह को कम करती है।यह बहुमुखी तकनीक जीनोमिक अनुप्रयोगों की एक श्रृंखला को पूरा करते हुए एकल-पढ़ने और युग्मित-अंत पुस्तकालयों दोनों का समर्थन करती है।इलुमिना अनुक्रमण की उच्च-थ्रूपुट क्षमताएं और परिशुद्धता इसे जीनोमिक्स अनुसंधान में आधारशिला के रूप में स्थापित करती है, जो वैज्ञानिकों को बेजोड़ विवरण और दक्षता के साथ जीनोम की जटिलताओं को सुलझाने में सशक्त बनाती है।
बीजीआई द्वारा विकसित डीएनबीएसईक्यू, एक और नवीन एनजीएस तकनीक है जो अनुक्रमण लागत को और कम करने और थ्रूपुट को बढ़ाने में कामयाब रही है।डीएनबीएसईक्यू पुस्तकालयों की तैयारी में डीएनए विखंडन, एसएसडीएनए की तैयारी और डीएनए नैनोबॉल (डीएनबी) प्राप्त करने के लिए रोलिंग सर्कल प्रवर्धन शामिल है।फिर इन्हें एक ठोस सतह पर लोड किया जाता है और बाद में कॉम्बिनेटरियल प्रोब-एंकर सिंथेसिस (सीपीएएस) द्वारा अनुक्रमित किया जाता है।
हमारी पूर्व-निर्मित लाइब्रेरी अनुक्रमण सेवा ग्राहकों को विभिन्न स्रोतों (एमआरएनए, संपूर्ण जीनोम, एम्प्लिकॉन, अन्य) से उनकी अनुक्रमण लाइब्रेरी तैयार करने में सुविधा प्रदान करती है।इसके बाद, इन पुस्तकालयों को इलुमिना या बीजीआई प्लेटफार्मों में गुणवत्ता नियंत्रण और अनुक्रमण के लिए हमारे अनुक्रमण केंद्रों पर भेजा जा सकता है।
