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एकल-नाभिक आरएनए अनुक्रमण
उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण के साथ संयोजन में एकल कोशिका कैप्चरिंग और व्यक्तिगत पुस्तकालय निर्माण तकनीक में प्रगति कोशिका-दर-कोशिका आधार पर जीन अभिव्यक्ति अध्ययन की अनुमति देती है।यह जटिल कोशिका आबादी पर एक गहन और संपूर्ण सिस्टम विश्लेषण को सक्षम बनाता है, जिसमें यह सभी कोशिकाओं का औसत लेकर उनकी विविधता को छुपाने से काफी हद तक बचाता है।
हालाँकि, कुछ कोशिकाएँ एकल-कोशिका निलंबन में बनाने के लिए उपयुक्त नहीं हैं, इसलिए अन्य नमूना तैयार करने के तरीकों - ऊतकों से नाभिक निष्कर्षण की आवश्यकता होती है, अर्थात, नाभिक को सीधे ऊतकों या कोशिका से निकाला जाता है और एकल-नाभिक निलंबन में तैयार किया जाता है। कोशिका अनुक्रमण.
बीएमके 10× जीनोमिक्स क्रोमियम™ आधारित एकल-सेल आरएनए अनुक्रमण सेवा प्रदान करता है।इस सेवा का व्यापक रूप से रोग संबंधी अध्ययनों में उपयोग किया गया है, जैसे प्रतिरक्षा कोशिका विभेदन, ट्यूमर विविधता, ऊतक विकास, आदि।
स्थानिक प्रतिलेख चिप: 10× जीनोमिक्स
प्लेटफ़ॉर्म: इलुमिना नोवासेक प्लेटफ़ॉर्म
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पौधे/पशु संपूर्ण जीनोम अनुक्रमण
संपूर्ण जीनोम पुन: अनुक्रमण, जिसे डब्ल्यूजीएस के रूप में भी जाना जाता है, एकल न्यूक्लियोटाइड पॉलीमोर्फिज्म (एसएनपी), सम्मिलन विलोपन (इंडेल), संरचना भिन्नता (एसवी), और प्रतिलिपि संख्या भिन्नता (सीएनवी) सहित पूरे जीनोम पर सामान्य और दुर्लभ दोनों प्रकार के उत्परिवर्तन को प्रकट करने में सक्षम बनाता है। ).एसएनपी की तुलना में एसवी भिन्नता आधार का एक बड़ा हिस्सा बनाते हैं और जीनोम पर अधिक प्रभाव डालते हैं, जिसका जीवित जीवों पर महत्वपूर्ण प्रभाव पड़ता है।लंबे समय तक पढ़ा गया पुनरुत्पादन बड़े टुकड़ों और जटिल विविधताओं की अधिक सटीक पहचान की अनुमति देता है क्योंकि लंबे समय तक पढ़ने से टेंडेम दोहराव, जीसी/एटी-समृद्ध क्षेत्र और हाइपर-वेरिएबल क्षेत्रों जैसे जटिल क्षेत्रों पर क्रोमोसोमल क्रॉसिंग करना बहुत आसान हो जाता है।
प्लेटफ़ॉर्म: इलुमिना, पैकबियो, नैनोपोर
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BMKMANU S1000 स्थानिक प्रतिलेख
स्थानिक ट्रांसक्रिप्टोमिक्स वैज्ञानिक नवाचार में सबसे आगे है, जो शोधकर्ताओं को उनके स्थानिक संदर्भ को संरक्षित करते हुए ऊतकों के भीतर जटिल जीन अभिव्यक्ति पैटर्न में गहराई से जाने के लिए सशक्त बनाता है।विभिन्न प्लेटफार्मों के बीच, BMKGene ने BMKManu S1000 Spatial Transcriptome चिप विकसित की है, जो एक शानदार अनुभव प्रदान करती है।उन्नत संकल्प5μM का, उपसेलुलर रेंज तक पहुंचना, और सक्षम करनाबहु-स्तरीय रिज़ॉल्यूशन सेटिंग्स.S1000 चिप, जिसमें लगभग 2 मिलियन स्पॉट हैं, स्थानिक रूप से बारकोडेड कैप्चर जांच के साथ लोड किए गए मोतियों के साथ स्तरित माइक्रोवेल्स को नियोजित करता है।स्थानिक बारकोड से समृद्ध एक सीडीएनए लाइब्रेरी, S1000 चिप से तैयार की जाती है और बाद में इलुमिना नोवासेक प्लेटफॉर्म पर अनुक्रमित की जाती है।स्थानिक रूप से बारकोड किए गए नमूनों और यूएमआई का संयोजन उत्पन्न डेटा की सटीकता और विशिष्टता सुनिश्चित करता है।BMKManu S1000 चिप की अनूठी विशेषता इसकी बहुमुखी प्रतिभा में निहित है, जो बहु-स्तरीय रिज़ॉल्यूशन सेटिंग्स की पेशकश करती है जिसे विभिन्न ऊतकों और विस्तार के स्तरों पर बारीकी से ट्यून किया जा सकता है।यह अनुकूलनशीलता चिप को विविध स्थानिक ट्रांसक्रिप्टोमिक्स अध्ययनों के लिए एक उत्कृष्ट विकल्प के रूप में स्थापित करती है, जो न्यूनतम शोर के साथ सटीक स्थानिक क्लस्टरिंग सुनिश्चित करती है।
BMKManu S1000 चिप और अन्य स्थानिक ट्रांसक्रिपटॉमिक्स प्रौद्योगिकियों का उपयोग करके, शोधकर्ता कोशिकाओं के स्थानिक संगठन और ऊतकों के भीतर होने वाली जटिल आणविक बातचीत की बेहतर समझ प्राप्त कर सकते हैं, जिसमें क्षेत्रों की एक विस्तृत श्रृंखला में जैविक प्रक्रियाओं के अंतर्निहित तंत्र में अमूल्य अंतर्दृष्टि प्रदान की जाती है। ऑन्कोलॉजी, तंत्रिका विज्ञान, विकासात्मक जीव विज्ञान, प्रतिरक्षा विज्ञान और वनस्पति अध्ययन।
प्लेटफ़ॉर्म: BMKManu S1000 चिप और इलुमिना नोवासेक
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10x जीनोमिक्स विसियम स्पैटियल ट्रांस्क्रिप्टोम
स्थानिक ट्रांसक्रिप्टोमिक्स एक अत्याधुनिक तकनीक है जो शोधकर्ताओं को उनके स्थानिक संदर्भ को संरक्षित करते हुए ऊतकों के भीतर जीन अभिव्यक्ति पैटर्न की जांच करने की अनुमति देती है।इस डोमेन में एक शक्तिशाली प्लेटफ़ॉर्म इलुमिना अनुक्रमण के साथ 10x जीनोमिक्स विसियम है।10X विसियम का सिद्धांत एक निर्दिष्ट कैप्चर क्षेत्र के साथ एक विशेष चिप पर आधारित है जहां ऊतक अनुभाग रखे जाते हैं।इस कैप्चर क्षेत्र में बारकोडेड स्पॉट होते हैं, जिनमें से प्रत्येक ऊतक के भीतर एक अद्वितीय स्थानिक स्थान से संबंधित होता है।ऊतक से कैप्चर किए गए आरएनए अणुओं को रिवर्स ट्रांसक्रिप्शन प्रक्रिया के दौरान अद्वितीय आणविक पहचानकर्ताओं (यूएमआई) के साथ लेबल किया जाता है।ये बारकोडेड स्पॉट और यूएमआई एकल-सेल रिज़ॉल्यूशन पर सटीक स्थानिक मानचित्रण और जीन अभिव्यक्ति की मात्रा का ठहराव सक्षम करते हैं।स्थानिक रूप से बारकोड किए गए नमूनों और यूएमआई का संयोजन उत्पन्न डेटा की सटीकता और विशिष्टता सुनिश्चित करता है।इस स्थानिक ट्रांसक्रिपटॉमिक्स तकनीक का उपयोग करके, शोधकर्ता कोशिकाओं के स्थानिक संगठन और ऊतकों के भीतर होने वाली जटिल आणविक अंतःक्रियाओं की गहरी समझ प्राप्त कर सकते हैं, जो ऑन्कोलॉजी, तंत्रिका विज्ञान, विकासात्मक जीव विज्ञान, इम्यूनोलॉजी सहित कई क्षेत्रों में जैविक प्रक्रियाओं के अंतर्निहित तंत्र में अमूल्य अंतर्दृष्टि प्रदान करते हैं। , और वनस्पति अध्ययन।
प्लेटफ़ॉर्म: 10X जीनोमिक्स विसियम और इलुमिना नोवासेक
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पूर्ण-लंबाई एमआरएनए अनुक्रमण-नैनोपोर
जबकि एनजीएस-आधारित एमआरएनए अनुक्रमण जीन अभिव्यक्ति परिमाणीकरण के लिए एक बहुमुखी उपकरण के रूप में कार्य करता है, छोटी रीडिंग पर इसकी निर्भरता जटिल ट्रांसक्रिप्टोमिक विश्लेषण में इसकी प्रभावकारिता को प्रतिबंधित करती है।दूसरी ओर, नैनोपोर अनुक्रमण, लंबे समय तक पढ़ी जाने वाली तकनीक को नियोजित करता है, जो पूर्ण-लंबाई वाले एमआरएनए प्रतिलेखों के अनुक्रमण को सक्षम बनाता है।यह दृष्टिकोण वैकल्पिक स्प्लिसिंग, जीन फ़्यूज़न, पॉली-एडिनाइलेशन और एमआरएनए आइसोफॉर्म की मात्रा का ठहराव की व्यापक खोज की सुविधा प्रदान करता है।
नैनोपोर अनुक्रमण नैनोपोर एकल-अणु वास्तविक समय विद्युत संकेतों पर निर्भर करता है।मोटर प्रोटीन द्वारा निर्देशित, डबल-स्ट्रैंडेड डीएनए एक बायोफिल्म में एम्बेडेड नैनोपोर प्रोटीन से जुड़ जाता है, वोल्टेज अंतर के तहत नैनोपोर चैनल से गुजरते समय खुल जाता है।डीएनए स्ट्रैंड पर विभिन्न आधारों द्वारा उत्पन्न विशिष्ट विद्युत संकेतों का वास्तविक समय में पता लगाया और वर्गीकृत किया जाता है, जिससे सटीक और निरंतर न्यूक्लियोटाइड अनुक्रमण की सुविधा मिलती है।यह नवोन्वेषी दृष्टिकोण अल्प-पठन सीमाओं को पार करता है और जटिल जीनोमिक विश्लेषण के लिए एक गतिशील मंच प्रदान करता है, जिसमें जटिल ट्रांसक्रिप्टोमिक अध्ययन शामिल हैं।
प्लेटफ़ॉर्म: नैनोपोर प्रोमेथियन P48
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पूर्ण-लंबाई एमआरएनए अनुक्रमण -पैकबियो
जबकि एनजीएस-आधारित एमआरएनए अनुक्रमण जीन अभिव्यक्ति की मात्रा निर्धारित करने के लिए एक बहुमुखी उपकरण है, छोटी रीडिंग पर इसकी निर्भरता जटिल ट्रांसक्रिप्टोमिक विश्लेषण में इसके उपयोग को प्रतिबंधित करती है।दूसरी ओर, PacBio अनुक्रमण (Iso-Seq), लंबे समय तक पढ़ी जाने वाली तकनीक का उपयोग करता है, जो पूर्ण-लंबाई वाले mRNA प्रतिलेखों के अनुक्रमण को सक्षम बनाता है।यह दृष्टिकोण वैकल्पिक स्प्लिसिंग, जीन फ़्यूज़न और पॉली-एडिनाइलेशन की व्यापक खोज की सुविधा प्रदान करता है, हालांकि आवश्यक डेटा की उच्च मात्रा के कारण यह जीन अभिव्यक्ति मात्रा निर्धारण के लिए प्राथमिक विकल्प नहीं है।
PacBio अनुक्रमण तकनीक एकल-अणु, वास्तविक समय (SMRT) अनुक्रमण पर निर्भर करती है, जो पूर्ण-लंबाई mRNA प्रतिलेखों को कैप्चर करने में एक विशिष्ट लाभ प्रदान करती है।इस अभिनव दृष्टिकोण में शून्य-मोड वेवगाइड्स (ZMWs), माइक्रोफैब्रिकेटेड कुओं का उपयोग शामिल है जो अनुक्रमण के दौरान डीएनए पोलीमरेज़ गतिविधि के वास्तविक समय के अवलोकन को सक्षम बनाता है।इन ZMWs के भीतर, PacBio का डीएनए पोलीमरेज़ डीएनए के एक पूरक स्ट्रैंड को संश्लेषित करता है, जो लंबे समय तक पढ़ता है जो संपूर्ण mRNA प्रतिलेखों को फैलाता है।सर्कुलर कंसेंसस सीक्वेंसिंग (CCS) मोड में PacBio ऑपरेशन एक ही अणु को बार-बार अनुक्रमित करके सटीकता बढ़ाता है।जेनरेट की गई HiFi रीडिंग में NGS के बराबर सटीकता होती है, जो जटिल ट्रांसक्रिप्टोमिक विशेषताओं के व्यापक और विश्वसनीय विश्लेषण में योगदान देती है।प्लेटफ़ॉर्म: पैकबियो सीक्वल II
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यूकेरियोटिक एमआरएनए सीक्वेंसिंग-इलुमिना
एमआरएनए अनुक्रमण विशिष्ट परिस्थितियों में कोशिकाओं के भीतर सभी एमआरएनए प्रतिलेखों की व्यापक प्रोफाइलिंग को सशक्त बनाता है।यह अत्याधुनिक तकनीक एक शक्तिशाली उपकरण के रूप में कार्य करती है, जो जटिल जीन अभिव्यक्ति प्रोफाइल, जीन संरचनाओं और विविध जैविक प्रक्रियाओं से जुड़े आणविक तंत्र का अनावरण करती है।मौलिक अनुसंधान, नैदानिक निदान और दवा विकास में व्यापक रूप से अपनाया गया, एमआरएनए अनुक्रमण सेलुलर गतिशीलता और आनुवंशिक विनियमन की जटिलताओं में अंतर्दृष्टि प्रदान करता है।
प्लेटफ़ॉर्म: इलुमिना नोवासेक एक्स
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गैर-संदर्भ आधारित एमआरएनए अनुक्रमण-इलुमिना
एमआरएनए अनुक्रमण विशिष्ट परिस्थितियों में कोशिकाओं के भीतर सभी एमआरएनए प्रतिलेखों की व्यापक प्रोफाइलिंग को सशक्त बनाता है।यह अत्याधुनिक तकनीक एक शक्तिशाली उपकरण के रूप में कार्य करती है, जो जटिल जीन अभिव्यक्ति प्रोफाइल, जीन संरचनाओं और विविध जैविक प्रक्रियाओं से जुड़े आणविक तंत्र का अनावरण करती है।मौलिक अनुसंधान, नैदानिक निदान और दवा विकास में व्यापक रूप से अपनाया गया, एमआरएनए अनुक्रमण सेलुलर गतिशीलता और आनुवंशिक विनियमन की जटिलताओं में अंतर्दृष्टि प्रदान करता है।
प्लेटफ़ॉर्म: इलुमिना नोवासेक एक्स
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लंबी गैर-कोडिंग अनुक्रमण-इलुमिना
लंबे गैर-कोडिंग आरएनए (एलएनसीआरएनए) 200 न्यूक्लियोटाइड से अधिक लंबे आरएनए होते हैं जिनमें न्यूनतम कोडिंग क्षमता होती है और गैर-कोडिंग आरएनए के भीतर महत्वपूर्ण तत्व होते हैं।नाभिक और साइटोप्लाज्म में पाए जाने वाले, ये आरएनए एपिजेनेटिक, ट्रांसक्रिप्शनल और पोस्ट-ट्रांसक्रिप्शनल विनियमन में महत्वपूर्ण भूमिका निभाते हैं, जो सेलुलर और आणविक प्रक्रियाओं को आकार देने में उनके महत्व को रेखांकित करते हैं।LncRNA अनुक्रमण कोशिका विभेदन, ओटोजेनेसिस और मानव रोगों में एक शक्तिशाली उपकरण है।
प्लेटफ़ॉर्म: इलुमिना नोवासेक
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लघु आरएनए अनुक्रमण-इलुमिना
छोटे आरएनए (एसआरएनए) अणु, जिनकी लंबाई आमतौर पर 200 न्यूक्लियोटाइड से कम होती है, में माइक्रोआरएनए (एमआईआरएनए), छोटे हस्तक्षेप करने वाले आरएनए (एसआईआरएनए), और पीवी-इंटरैक्टिंग आरएनए (पीआईआरएनए) शामिल होते हैं।इनमें से, लगभग 20-24 न्यूक्लियोटाइड लंबे एमआईआरएनए, विभिन्न सेलुलर प्रक्रियाओं में उनकी महत्वपूर्ण नियामक भूमिकाओं के लिए विशेष रूप से उल्लेखनीय हैं।ऊतक-विशिष्ट और चरण-विशिष्ट अभिव्यक्ति पैटर्न के साथ, miRNAs विभिन्न प्रजातियों में उच्च संरक्षण प्रदर्शित करते हैं।
प्लेटफ़ॉर्म: इलुमिना नोवासेक
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सर्आरएनए अनुक्रमण-इलुमिना
सर्कुलर आरएनए अनुक्रमण (circRNA-seq) सर्कुलर आरएनए को प्रोफाइल और विश्लेषण करना है, आरएनए अणुओं का एक वर्ग जो गैर-विहित स्प्लिसिंग घटनाओं के कारण बंद लूप बनाते हैं, इन आरएनए को बढ़ी हुई स्थिरता प्रदान करते हैं।जबकि कुछ circRNAs को माइक्रोआरएनए स्पंज के रूप में कार्य करते हुए दिखाया गया है, जो माइक्रोआरएनए को अलग करते हैं और उन्हें अपने लक्ष्य एमआरएनए को विनियमित करने से रोकते हैं, अन्य circRNAs प्रोटीन के साथ बातचीत कर सकते हैं, जीन अभिव्यक्ति को नियंत्रित कर सकते हैं, या सेलुलर प्रक्रियाओं में भूमिका निभा सकते हैं।सर्कैना अभिव्यक्ति विश्लेषण इन अणुओं की नियामक भूमिकाओं और विभिन्न सेलुलर प्रक्रियाओं, विकासात्मक चरणों और रोग स्थितियों में उनके महत्व के बारे में अंतर्दृष्टि प्रदान करता है, जो जीन अभिव्यक्ति के संदर्भ में आरएनए विनियमन की जटिलता की गहरी समझ में योगदान देता है।
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संपूर्ण प्रतिलेख अनुक्रम - इलुमिना
संपूर्ण ट्रांस्क्रिप्टोम अनुक्रमण विविध आरएनए अणुओं की प्रोफाइलिंग के लिए एक व्यापक दृष्टिकोण प्रदान करता है, जिसमें कोडिंग (एमआरएनए) और गैर-कोडिंग आरएनए (एलएनसीआरएनए, सर्कैना और एमआईआरएनए) दोनों शामिल हैं।यह तकनीक एक निश्चित समय पर विशिष्ट कोशिकाओं के पूर्ण प्रतिलेख को पकड़ लेती है, जिससे सेलुलर प्रक्रियाओं की समग्र समझ संभव हो जाती है।इसे "कुल आरएनए अनुक्रमण" के रूप में भी जाना जाता है, इसका उद्देश्य ट्रांसक्रिप्टोम स्तर पर जटिल नियामक नेटवर्क का अनावरण करना है, जो प्रतिस्पर्धी अंतर्जात आरएनए (सीईआरएनए) और संयुक्त आरएनए विश्लेषण जैसे गहन विश्लेषण को सक्षम बनाता है।यह कार्यात्मक लक्षण वर्णन की दिशा में प्रारंभिक कदम को चिह्नित करता है, विशेष रूप से circRNA-miRNA-mRNA-आधारित CeRNA इंटरैक्शन से जुड़े नियामक नेटवर्क को उजागर करने में।
