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PacBio-पूर्ण लंबाई 16S/18S/ITS एम्प्लिकॉन सीक्वेंसिंग
एम्प्लिकॉन (16एस/18एस/आईटीएस) प्लेटफॉर्म माइक्रोबियल विविधता परियोजना विश्लेषण में वर्षों के अनुभव के साथ विकसित किया गया है, जिसमें मानकीकृत बुनियादी विश्लेषण और वैयक्तिकृत विश्लेषण शामिल है: बुनियादी विश्लेषण वर्तमान माइक्रोबियल अनुसंधान की मुख्यधारा विश्लेषण सामग्री को कवर करता है, विश्लेषण सामग्री समृद्ध और व्यापक है, और विश्लेषण परिणाम परियोजना रिपोर्ट के रूप में प्रस्तुत किए जाते हैं;वैयक्तिकृत विश्लेषण की सामग्री विविध है।व्यक्तिगत आवश्यकताओं को साकार करने के लिए नमूनों का चयन किया जा सकता है और बुनियादी विश्लेषण रिपोर्ट और अनुसंधान उद्देश्य के अनुसार मापदंडों को लचीले ढंग से सेट किया जा सकता है।विंडोज़ ऑपरेटिंग सिस्टम, सरल और तेज़।
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PacBio-पूर्ण लंबाई प्रतिलेख (गैर-संदर्भ)
पैसिफिक बायोसाइंसेज (पैकबियो) आइसोफॉर्म अनुक्रमण डेटा को इनपुट के रूप में लेते हुए, यह ऐप पूर्ण-लंबाई ट्रांसक्रिप्ट अनुक्रम (असेंबली के बिना) की पहचान करने में सक्षम है।संदर्भ जीनोम के विरुद्ध पूर्ण-लंबाई अनुक्रमों को मैप करके, प्रतिलेखों को ज्ञात जीन, प्रतिलेख, कोडिंग क्षेत्रों आदि द्वारा अनुकूलित किया जा सकता है। इस मामले में, एमआरएनए संरचनाओं की अधिक सटीक पहचान, जैसे वैकल्पिक स्प्लिसिंग, आदि प्राप्त की जा सकती है।एनजीएस ट्रांसक्रिप्टोम अनुक्रमण डेटा के साथ संयुक्त विश्लेषण ट्रांसक्रिप्ट स्तर पर अभिव्यक्ति में अधिक व्यापक एनोटेशन और अधिक सटीक मात्रा का ठहराव सक्षम बनाता है, जो बड़े पैमाने पर डाउनस्ट्रीम अंतर अभिव्यक्ति और कार्यात्मक विश्लेषण को लाभ देता है।
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उपकरणकिटें
BMKCloud जीनोमिक कार्यक्रमों के लिए वन-स्टॉप समाधान प्रदान करने वाला एक अग्रणी जैव सूचनात्मक मंच है, जिस पर चिकित्सा, कृषि, पर्यावरण आदि सहित विभिन्न क्षेत्रों के शोधकर्ताओं द्वारा व्यापक रूप से भरोसा किया जाता है। BMKCloud जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण प्लेटफार्मों और उपकरणों सहित एकीकृत, विश्वसनीय और कुशल सेवाएं प्रदान करने के लिए प्रतिबद्ध है। , कंप्यूटिंग संसाधन, सार्वजनिक डेटाबेस, जैव सूचना विज्ञान ऑनलाइन पाठ्यक्रम, आदि। BMKCloud में जीन एनोटेशन, विकासवादी आनुवंशिक उपकरण, एनसीआरएनए, डेटा गुणवत्ता नियंत्रण, असेंबली, संरेखण, डेटा निष्कर्षण, उत्परिवर्तन, सांख्यिकी, आंकड़ा जनरेटर, अनुक्रम सहित कई बार उपयोग किए जाने वाले जैव सूचना उपकरण हैं। विश्लेषण, आदि
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छोटा आरएनए
छोटे आरएनए छोटे गैर-कोडिंग आरएनए के प्रकार होते हैं जिनकी औसत लंबाई 18-30 एनटी होती है, जिसमें miRNA, siRNA और piRNA शामिल हैं।इन छोटे आरएनए को बड़े पैमाने पर विभिन्न जैविक प्रक्रियाओं जैसे एमआरएनए गिरावट, अनुवाद अवरोध, हेटरोक्रोमैटिन गठन इत्यादि में शामिल होने की सूचना मिली है। स्मॉलआरएनए अनुक्रमण विश्लेषण को पशु/पौधे के विकास, बीमारी, वायरस इत्यादि पर अध्ययन में व्यापक रूप से लागू किया गया है। छोटे आरएनए अनुक्रमण विश्लेषण प्लेटफ़ॉर्म में मानक विश्लेषण और उन्नत डेटा खनन शामिल है।RNA-seq डेटा के आधार पर, मानक विश्लेषण miRNA पहचान और भविष्यवाणी, miRNA लक्ष्य जीन भविष्यवाणी, एनोटेशन और अभिव्यक्ति विश्लेषण प्राप्त कर सकता है।उन्नत विश्लेषण अनुकूलित miRNA खोज और निष्कर्षण, वेन आरेख निर्माण, miRNA और लक्ष्य जीन नेटवर्क निर्माण को सक्षम बनाता है।
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एनजीएस-डब्ल्यूजीएस (इलुमिना/बीजीआई)
एनजीएस-डब्ल्यूजीएस एक संपूर्ण जीनोम पुन: अनुक्रमण विश्लेषण मंच है, जिसे बायोमार्कर टेक्नोलॉजीज में समृद्ध अनुभव के आधार पर विकसित किया गया है।उपयोग में आसान यह प्लेटफ़ॉर्म केवल कुछ बुनियादी पैरामीटर सेट करके एक एकीकृत विश्लेषण वर्कफ़्लो को त्वरित रूप से प्रस्तुत करने की अनुमति देता है, जो इलुमिना प्लेटफ़ॉर्म और बीजीआई अनुक्रमण प्लेटफ़ॉर्म दोनों से उत्पन्न डीएनए अनुक्रमण डेटा के लिए फिट बैठता है।यह प्लेटफ़ॉर्म उच्च प्रदर्शन कंप्यूटिंग सर्वर पर तैनात किया गया है, जो बहुत ही सीमित समय में अत्यधिक कुशल डेटा विश्लेषण को सशक्त बनाता है।वैयक्तिकृत डेटा खनन मानक विश्लेषण के आधार पर उपलब्ध है, जिसमें उत्परिवर्तित जीन क्वेरी, पीसीआर प्राइमर डिज़ाइन आदि शामिल हैं।
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एमआरएनए (संदर्भ)
ट्रांस्क्रिप्टोम जीनोमिक आनुवंशिक जानकारी और जैविक कार्य के प्रोटिओम के बीच की कड़ी है।ट्रांसक्रिप्शनल स्तर विनियमन जीवों का सबसे महत्वपूर्ण और सबसे व्यापक रूप से अध्ययन किया जाने वाला विनियमन तरीका है।ट्रांसक्रिप्टोम अनुक्रमण किसी भी समय या किसी भी स्थिति में, एकल न्यूक्लियोटाइड के सटीक रिज़ॉल्यूशन के साथ ट्रांसक्रिप्टोम को अनुक्रमित कर सकता है। यह जीन ट्रांसक्रिप्शन के स्तर को गतिशील रूप से प्रतिबिंबित कर सकता है, साथ ही दुर्लभ और सामान्य ट्रांसक्रिप्ट की पहचान और मात्रा निर्धारित कर सकता है, और संरचनात्मक जानकारी प्रदान कर सकता है। नमूना विशिष्ट प्रतिलेख।
वर्तमान में, ट्रांसक्रिप्टोम अनुक्रमण तकनीक का व्यापक रूप से कृषि विज्ञान, चिकित्सा और अन्य अनुसंधान क्षेत्रों में उपयोग किया गया है, जिसमें पशु और पौधे विकास विनियमन, पर्यावरण अनुकूलन, प्रतिरक्षा संपर्क, जीन स्थानीयकरण, प्रजातियों के आनुवंशिक विकास और ट्यूमर और आनुवंशिक रोग का पता लगाना शामिल है।
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मेटागेनोमिक्स (एनजीएस)
यह विश्लेषण प्लेटफ़ॉर्म वर्षों के अनुभव के आधार पर शॉटगन मेटागेनोमिक डेटा विश्लेषण के लिए डिज़ाइन किया गया है।इसमें एकीकृत वर्कफ़्लो शामिल है जिसमें डेटा प्रोसेसिंग, प्रजाति-स्तर के अध्ययन, जीन फ़ंक्शन-स्तर के अध्ययन, मेटागेनोम बिनिंग आदि सहित सामान्य रूप से आवश्यक मेटागेनोमिक्स विश्लेषण शामिल हैं। इसके अलावा, जीन और प्रजाति क्वेरी सहित मानक विश्लेषण वर्कफ़्लो पर अनुकूलित डेटा खनन उपकरण उपलब्ध हैं। , पैरामीटर सेटिंग, वैयक्तिकृत आकृति निर्माण, आदि।
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एलएनसीआरएनए
लंबे गैर-कोडिंग आरएनए (एलएनसीआरएनए) 200 एनटी से अधिक लंबाई वाले एक प्रकार के प्रतिलेख हैं, जो प्रोटीन को कोड करने में असमर्थ हैं।संचयी साक्ष्य से पता चलता है कि अधिकांश एलएनसीआरएनए के कार्यात्मक होने की बहुत संभावना है।उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण प्रौद्योगिकियां और जैव सूचनात्मक विश्लेषण उपकरण हमें एलएनसीआरएनए अनुक्रमों और स्थिति जानकारी को अधिक कुशलता से प्रकट करने और महत्वपूर्ण नियामक कार्यों के साथ एलएनसीआरएनए की खोज करने के लिए सशक्त बनाते हैं।बीएमकेक्लाउड को अपने ग्राहकों को तेज, विश्वसनीय और लचीला एलएनसीआरएनए विश्लेषण प्राप्त करने के लिए एलएनसीआरएनए अनुक्रमण विश्लेषण मंच प्रदान करने पर गर्व है।
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जीडब्ल्यूएएस
जीनोम-वाइड एसोसिएशन अध्ययन (जीडब्ल्यूएएस) का उद्देश्य उन आनुवंशिक वेरिएंट (जीनोटाइप) की पहचान करना है जो विशिष्ट लक्षणों (फेनोटाइप) से जुड़े हैं।जीडब्ल्यूए अध्ययन बड़ी संख्या में व्यक्तियों के पूरे जीनोम को पार करने वाले आनुवंशिक मार्करों की जांच करता है और जनसंख्या स्तर पर सांख्यिकीय विश्लेषण द्वारा जीनोटाइप-फेनोटाइप संघों की भविष्यवाणी करता है।संपूर्ण-जीनोम पुनरुत्पादन संभावित रूप से सभी आनुवंशिक वेरिएंट की खोज कर सकता है।फेनोटाइपिक डेटा के साथ युग्मित होकर, जीडब्ल्यूएएस को फेनोटाइप से संबंधित एसएनपी, क्यूटीएल और उम्मीदवार जीन की पहचान करने के लिए संसाधित किया जा सकता है, जो आधुनिक पशु/पौधे प्रजनन का दृढ़ता से समर्थन करता है।एसएलएएफ एक स्व-विकसित सरलीकृत जीनोम अनुक्रमण रणनीति है, जो जीनोम-वाइड वितरित मार्कर, एसएनपी की खोज करती है।आणविक आनुवंशिक मार्करों के रूप में इन एसएनपी को लक्षित लक्षणों के साथ सहयोग अध्ययन के लिए संसाधित किया जा सकता है।यह आनुवंशिक विविधताओं से जुड़े जटिल लक्षणों की पहचान करने में एक लागत प्रभावी रणनीति है।
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नैनोपोर पूर्ण-लंबाई ट्रांसक्रिपटॉमिक्स
जीवों में जटिल और परिवर्तनशील वैकल्पिक आइसोफोर्म जीन अभिव्यक्ति और प्रोटीन विविधता को विनियमित करने के लिए महत्वपूर्ण आनुवंशिक तंत्र हैं।प्रतिलेख संरचनाओं की सटीक पहचान जीन अभिव्यक्ति विनियमन पैटर्न के गहन अध्ययन का आधार है।नैनोपोर अनुक्रमण प्लेटफ़ॉर्म ने सफलतापूर्वक ट्रांसक्रिप्टोमिक अध्ययन को आइसोफॉर्म-स्तर पर ला दिया है।यह विश्लेषण प्लेटफ़ॉर्म संदर्भ जीनोम के आधार पर नैनोपोर प्लेटफ़ॉर्म पर उत्पन्न आरएनए-सेक डेटा का विश्लेषण करने के लिए डिज़ाइन किया गया है, जो जीन स्तर और ट्रांसक्रिप्ट स्तर दोनों में गुणात्मक और मात्रात्मक विश्लेषण प्राप्त करता है।
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सर्क-आरएनए
सर्कुलर आरएनए (सर्कआरएनए) एक प्रकार का गैर-कोडिंग आरएनए है, जो हाल ही में विकास, पर्यावरणीय प्रतिरोध आदि में शामिल नियामक नेटवर्क में महत्वपूर्ण भूमिका निभाता पाया गया है। रैखिक आरएनए अणुओं से अलग, जैसे एमआरएनए, एलएनसीआरएनए, 3 'और 5' circRNA के सिरे एक गोलाकार संरचना बनाने के लिए एक साथ जुड़ जाते हैं, जो उन्हें एक्सोन्यूक्लिज़ के पाचन से बचाता है और अधिकांश रैखिक RNA की तुलना में अधिक स्थिर होता है।जीन अभिव्यक्ति को विनियमित करने में सर्आरएनए के विविध कार्य पाए गए हैं।सर्आरएनए सीईआरएनए के रूप में कार्य कर सकता है, जो प्रतिस्पर्धी रूप से एमआईआरएनए को बांधता है, जिसे एमआईआरएनए स्पंज के रूप में जाना जाता है।सर्कैना अनुक्रमण विश्लेषण मंच सर्कैना संरचना और अभिव्यक्ति विश्लेषण, लक्ष्य भविष्यवाणी और अन्य प्रकार के आरएनए अणुओं के साथ संयुक्त विश्लेषण को सशक्त बनाता है।
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बीएसए
बल्क्ड सेग्रिगेंट एनालिसिस प्लेटफॉर्म में एक-चरणीय मानक विश्लेषण और अनुकूलित पैरामीटर सेटिंग के साथ उन्नत विश्लेषण शामिल है।बीएसए फेनोटाइप से जुड़े आनुवंशिक मार्करों की शीघ्र पहचान करने के लिए नियोजित एक तकनीक है।बीएसए के मुख्य कार्यप्रवाह में शामिल हैं: 1. बेहद विपरीत फेनोटाइप वाले व्यक्तियों के दो समूहों का चयन करना;2. डीएनए के दो बड़े हिस्से बनाने के लिए सभी व्यक्तियों के डीएनए, आरएनए या एसएलएएफ-सीक्यू (बायोमार्कर द्वारा विकसित) को एकत्रित करना;3. संदर्भ जीनोम के विरुद्ध या बीच में अंतर अनुक्रमों की पहचान करना, 4. ईडी और एसएनपी-सूचकांक एल्गोरिदम द्वारा उम्मीदवार से जुड़े क्षेत्रों की भविष्यवाणी करना;5. उम्मीदवार क्षेत्रों में जीन पर कार्यात्मक विश्लेषण और संवर्धन, आदि। आनुवंशिक मार्कर स्क्रीनिंग और प्राइमर डिजाइन सहित डेटा में अधिक उन्नत खनन भी उपलब्ध है।
