गर्मी के नक्शे
मैट्रिक्स डेटा फ़ाइल का उपयोग हीट मैप ड्राइंग के लिए किया जाता है, जो मैट्रिक्स डेटा को फ़िल्टर, सामान्य और क्लस्टर कर सकता है।इसका उपयोग अधिकतर विभिन्न नमूनों के बीच जीन अभिव्यक्ति स्तर के क्लस्टर विश्लेषण के लिए किया जाता है।
जीन एनोटेशन
जीन फ़ंक्शन एनोटेशन विभिन्न डेटाबेस के विरुद्ध FASTA फ़ाइल में अनुक्रमों को मैप करके किया जाता है।
जीन एनोटेशन
आधारभूत स्थानीय एलाइनमेन्ट सर्च टूल
सीडीएस_यूटीआर_भविष्यवाणी
यह उपकरण ज्ञात प्रोटीन डेटाबेस और ओआरएफ भविष्यवाणी के आधार पर दिए गए प्रतिलेख अनुक्रमों में कोडिंग क्षेत्रों (सीडीएस) और गैर-कोडिंग क्षेत्रों (यूटीआर) की भविष्यवाणी करने के लिए डिज़ाइन किया गया है।
मैनहट्टन प्लॉट
मैनहट्टन प्लॉट बड़ी संख्या में डेटा बिंदुओं के साथ डेटा प्रदर्शित करने में सक्षम बनाता है।इसका उपयोग आमतौर पर जीनोम-वाइड एसोसिएशन स्टडीज (जीडब्ल्यूएएस) में किया जाता है।
सरकोस
CIRCOS आरेख जीनोम पर SNP, InDeL, SV, CNV वितरण की प्रत्यक्ष प्रस्तुति को सक्षम बनाता है।
GO_संवर्धन
TopGO कार्यात्मक संवर्धन के लिए डिज़ाइन किया गया एक उपकरण है।टॉपजीओ-बायोकंडक्टर पैकेज में विभेदक अभिव्यक्ति विश्लेषण, जीओ संवर्धन विश्लेषण और परिणामों का विज़ुअलाइज़ेशन शामिल है।यह "ग्राफ़" नामक आउटपुट वाला एक फ़ोल्डर उत्पन्न करेगा, जिसमें टॉपजीओ_बीपी, टॉपजीओ_सीसी और टॉपजीओ_एमएफ के परिणाम होंगे।
डब्ल्यूजीसीएनए
WGCNA जीन सह-अभिव्यक्ति मॉड्यूल की खोज के लिए व्यापक रूप से उपयोग की जाने वाली डेटा खनन विधि है।यह अगली पीढ़ी के अनुक्रमण से उत्पन्न माइक्रोएरे डेटा और जीन अभिव्यक्ति डेटा सहित विभिन्न अभिव्यक्ति डेटासेट पर लागू होता है।
इंटरप्रोस्कैन
इंटरप्रो प्रोटीन अनुक्रम विश्लेषण और वर्गीकरण
GO_KEGG_संवर्धन
यह उपकरण प्रदान किए गए जीन सेट और संबंधित एनोटेशन के आधार पर जीओ संवर्धन हिस्टोग्राम, केईजीजी संवर्धन हिस्टोग्राम और केईजीजी संवर्धन मार्ग उत्पन्न करने के लिए डिज़ाइन किया गया है।