पौधे/पशु संपूर्ण जीनोम अनुक्रमण
1.सेवा लाभ
1000 से अधिक प्रजातियों के लिए जीनोम अनुक्रमण में व्यापक अनुभव।
4000 से अधिक के संचयी प्रभाव कारक के साथ 800 से अधिक प्रकाशित मामले।
विविधता कॉलिंग और फ़ंक्शन विश्लेषण पर व्यापक जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण।
2. सेवा विशिष्टताएँ
| प्लैटफ़ॉर्म | पुस्तकालय | अनुशंसित सीक गहराई | |
| Illumina | पीई 150 | एसएनपी, इनडेल कॉलिंग के लिए ≥ 10x एसवी, सीएनवाई कॉलिंग के लिए ≥ 30x
| |
| नैनोपोर
| 8 केबी | एसवी, सीएनवाई कॉलिंग के लिए ≥ 20x | |
| पचबियो | सीसीएस | 15 केबी | एसएनपी, इनडेल, एसवी, सीएनवाई कॉलिंग के लिए ≥ 10x |
3. नमूना आवश्यकताएँ
| प्लैटफ़ॉर्म | सांद्र(एनजी/μL)
| राशि (एनजी)
| पवित्रता
| अगारोज जेल
| ||
| ओडी260/280 | ओडी260/230 | 1. मुख्य बैंड को बिना या सीमित के साफ़ करेंजेल पर गिरावट देखी गई। 2. आरएनए या प्रोटीन संदूषण नहीं या सीमित
| ||||
| Illumina | ≥1 | ≥30
| - | - | ||
| नैनोपोर
| ≥30 | डेटा यील्ड पर निर्भर करता है 10μg/सेल | 1.7-2.2 | ≥1.5 | ||
| पचबियो | सीसीएस | ≥50 | 1.7-2.2 | 1.8-2.5 | ||
4. जैव सूचना विश्लेषण
5. सेवा कार्य प्रवाह
नमूना वितरण
डीएनए निष्कर्षण
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
डेटा विश्लेषण
डेटा वितरण
1) जीनोम मैपिंग के आँकड़े
तालिका 1 मैपिंग परिणाम के आँकड़े
चित्र 1 सम्मिलित आकार का वितरण और कवरेज पढ़ता है।
2) विभिन्नता का पता लगाना
चित्र 2 नमूनों के बीच एसएनपी/इंडेल/एसवी के आंकड़े और एनोटेशन
चित्र 3 विविधताओं का जीनोम-व्यापक वितरण
3) विविधताओं का कार्यात्मक एनोटेशन
| 2019 | प्रकृति संचार | संपूर्ण-जीनोम पुनरुत्पादन से ब्रैसिका नेपस मूल और इसके सुधार में शामिल आनुवंशिक लोकी का पता चलता है |
| 2020 | पीएनएएस | सुनहरीमछली (कैरासियस ऑराटस) की विकासवादी उत्पत्ति और पालतू बनाने का इतिहास |
| 2021 | प्लांट बायोटेक्नोलॉजी जर्नल | दो संवर्धित जूट प्रजातियों के संदर्भ जीनोम |
| 2021 | प्लांट बायोटेक्नोलॉजी जर्नल | वनस्पति और तिलहन एलोपॉलीप्लॉइड ब्रैसिकाजंशिया और आनुवंशिक लोकी के जीनोमिक हस्ताक्षर जो ग्लूकोसाइनोलेट्स के संचय को नियंत्रित करते हैं |
| 2019 | आण्विक पौधा | रेपसीड परिग्रहणों के विश्व-व्यापी संग्रह के संपूर्ण-जीनोम पुनरुत्पादन से उनके पारिस्थितिकी-प्रकार विचलन के आनुवंशिक आधार का पता चलता है |
| 2022 | बागवानी अनुसंधान | जीनोम-वाइड एसोसिएशन विश्लेषण तरबूज के बीज के आकार की प्राकृतिक भिन्नता में आणविक अंतर्दृष्टि प्रदान करता है |
| 2021 | प्रायोगिक वनस्पति विज्ञान जर्नल | जीनोम-वाइड एसोसिएशन अध्ययन कपास में ठंड सहनशीलता प्रदान करने वाले GhSAD1 के वेरिएंट की पहचान करता है |
| 2021 | प्रायोगिक वनस्पति विज्ञान जर्नल | जीनोम-वाइड एसोसिएशन अध्ययन और ट्रांस्क्रिप्टोम तुलना से उपन्यास क्यूटीएल और उम्मीदवार जीन का पता चलता है जो रेपसीड में पंखुड़ी के आकार को नियंत्रित करते हैं |
