जीनोम विकास
जीनोम डे नोवो
असेंबली|लिंग निर्धारण संपूर्ण अनुक्रमण कार्य और आंशिक जैव सूचनात्मक सेवाएं बायोमार्कर टेक्नोलोजी द्वारा प्रदान की गईं।
अमूर्त
“सीड्रैगन के प्रतिष्ठित फेनोटाइप में पत्ती जैसे उपांग, एक दांत रहित ट्यूबलर मुंह और एक खुले "ब्रूड पैच" पर निषेचित अंडे के ऊष्मायन से जुड़ी पुरुष गर्भावस्था शामिल है।हमने सामान्य सीड्रैगन (फिलोप्टेरिक्स टेनिओलेटस) और इसकी निकट संबंधी प्रजाति, एलीगेटर पाइपफिश (सिग्नैथोइड्स बायकुलिएटस) के नर और मादा जीनोम को नए सिरे से अनुक्रमित किया है।एक विकासवादी नवीनता, पत्ती जैसे उपांगों से प्रतिलेखन प्रोफाइल से पता चलता है कि आम तौर पर फिन विकास में शामिल जीनों के एक सेट को संभावित ऊतक मरम्मत और प्रतिरक्षा रक्षा जीन के लिए ट्रांस स्क्रिप्ट के संवर्धन के साथ-साथ सहयोजित किया गया है।एससीपीपी5 के लिए जेब्राफिश म्यूटेंट, जो सभी सिग्नैथिड्स में खो गया है, में ग्रसनी दांतों की कमी या विकृत पाया गया, जो इस परिकल्पना का समर्थन करता है कि एससीपी5 के नुकसान ने सिग्नैथिड्स में दांतों के नुकसान में योगदान दिया है।आम सीड्रैगन और एलीगेटर पाइपफ़िश द्वारा साझा किए गए पुरुष-विशिष्ट amhr2y जीन को एन्कोडिंग करने वाले एक अनुमानित लिंग-निर्धारण स्थान की पहचान की गई थी। ”
सामग्री और तरीके:
सामग्री
Fहमारा सामान्य समुद्री ड्रैगन (पी. टैनियोलाटस) और दो मगरमच्छ पाइपफ़िश (एस बायकुलिएटस) नमूने।दो सामान्य सीड्रैगन (एक नर और एक मादा) और दो एलीगेटर पाइपफिश (एक नर और एक मादा) व्यक्तियों का उपयोग संपूर्ण-जीनोम अनुक्रमण के लिए किया गया था, और दो अन्य नर सामान्य सीड्रैगन व्यक्तियों का उपयोग जीनोम पुनर्अनुक्रमण के लिए किया गया था।
जीनोम अनुक्रमण रणनीति
270/350 बीपी लाइब्रेरी (हाईसेक 2500) + पैकबियो 20 केबी (सीक्वल) या नैनोपोर 30 केबी (मिनियन) + हाय-सी (नोवासेक 6000)। अनुक्रमण, और दो अन्य पुरुष सामान्य सीड्रैगन व्यक्तियों का उपयोग जीनोम पुन: अनुक्रमण के लिए किया गया था।
प्रतिलेख अनुक्रमण
Fया सामान्य सीड्रैगन, मस्तिष्क, आंख, गिल, यकृत, हृदय, गुर्दे, मेसेंटरी, आंत, मांसपेशी, पंख, त्वचा, पत्ती जैसे उपांग, वृषण और अंडाशय एकत्र किए गए।
जीनोम डे नोवो असेंबली रणनीति
Cअनु (सुधार) + डब्ल्यूटीडीबीजी2 (असेंबली) + पिलोन (पोलिश) + लैकेसिस (हाई-सी)।
मुख्य परिणाम
चित्र 1. सामान्य सीड्रैगन (पी. टैनियोलाटस) और एलीगेटर पाइपफिश (एस. बायकुलिएटस) की मुख्य विशेषताएं और उनकी फ़ाइलोजेनेटिक स्थिति।
चित्र 2. सामान्य सीड्रैगन (पी. टैनीओलाटस) में पत्ती जैसे उपांगों की आकृति विज्ञान और आनुवंशिक संरचना।
चित्र 3. सामान्य सीड्रैगन (पी. टैनीओलाटस) और एलीगेटर पाइपफिश (एस. बायकुलिएटस) में अनुमानित लिंग निर्धारण जीन।
चित्र 4. जेब्राफिश एससीपी5 समयुग्मजी म्यूटेंट में ग्रसनी दांत फेनोटाइप।
पोस्ट समय: जनवरी-08-2022