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पादप/पशु डी नोवो जीनोम अनुक्रमण
डे नोवोअनुक्रमण एक संदर्भ जीनोम की अनुपस्थिति में अनुक्रमण तकनीकों, जैसे PacBio, Nanopore, NGS, आदि का उपयोग करके एक प्रजाति के पूरे जीनोम के निर्माण को संदर्भित करता है।तीसरी पीढ़ी की अनुक्रमण तकनीकों की रीड लेंथ में उल्लेखनीय सुधार ने जटिल जीनोम को इकट्ठा करने में नए अवसर लाए हैं, जैसे कि उच्च विषमयुग्मजीता वाले, दोहराव वाले क्षेत्रों का उच्च अनुपात, पॉलीप्लॉइड, आदि। दसियों किलोबेस स्तर पर पढ़ने की लंबाई के साथ, ये अनुक्रमण सक्षम बनाता है दोहराए जाने वाले तत्वों, असामान्य जीसी सामग्री वाले क्षेत्रों और अन्य अत्यधिक जटिल क्षेत्रों का समाधान।
प्लेटफार्म: PacBio सीक्वल II / नैनोपोर प्रोमेथियन P48 / Illumina NovaSeq6000
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हाई-सी आधारित जीनोम असेंबली
हाय-सी एक विधि है जिसे प्रोबिंग निकटता-आधारित इंटरैक्शन और उच्च-थ्रूपुट अनुक्रमण के संयोजन से गुणसूत्र विन्यास को पकड़ने के लिए डिज़ाइन किया गया है।माना जाता है कि इन अंतःक्रियाओं की तीव्रता गुणसूत्रों पर भौतिक दूरी के साथ नकारात्मक रूप से सहसंबद्ध होती है।इसलिए, हाय-सी डेटा एक ड्राफ्ट जीनोम में इकट्ठे अनुक्रमों के क्लस्टरिंग, ऑर्डरिंग और उन्मुखीकरण का मार्गदर्शन कर सकता है और निश्चित संख्या में गुणसूत्रों पर एंकरिंग कर सकता है।यह तकनीक जनसंख्या-आधारित आनुवंशिक मानचित्र के अभाव में गुणसूत्र-स्तरीय जीनोम असेंबली को सशक्त बनाती है।हर एक जीनोम को हाई-सी की जरूरत होती है।
प्लेटफार्म: इलुमिना नोवासेक6000 / डीएनबीएसईक्यू
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विकासवादी आनुवंशिकी
इवोल्यूशनरी जेनेटिक्स एक पैक्ड सीक्वेंसिंग सेवा है जिसे एसएनपी, इनडेल्स, एसवी और सीएनवी सहित आनुवंशिक विविधताओं के आधार पर दी गई सामग्री की विकास संबंधी जानकारी पर व्यापक व्याख्या प्रदान करने के लिए डिज़ाइन किया गया है।यह विकासवादी परिवर्तनों और जनसंख्या की आनुवंशिक विशेषताओं, जैसे जनसंख्या संरचना, आनुवंशिक विविधता, फ़ाइलोजेनी संबंध आदि का वर्णन करने के लिए आवश्यक सभी मौलिक विश्लेषण प्रदान करता है। इसमें जीन प्रवाह पर अध्ययन भी शामिल है, जो प्रभावी जनसंख्या आकार, विचलन समय के अनुमान को सशक्त बनाता है।
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तुलनात्मक जीनोमिक्स
तुलनात्मक जीनोमिक्स का शाब्दिक अर्थ है विभिन्न प्रजातियों के संपूर्ण जीनोम अनुक्रमों और संरचनाओं की तुलना करना।इस अनुशासन का उद्देश्य विभिन्न प्रजातियों में संरक्षित या विभेदित अनुक्रम संरचनाओं और तत्वों की पहचान करके जीनोम स्तर पर प्रजातियों के विकास, जीन कार्य, जीन नियामक तंत्र को प्रकट करना है।विशिष्ट तुलनात्मक जीनोमिक्स अध्ययन में जीन परिवार में विश्लेषण, विकासवादी विकास, संपूर्ण जीनोम दोहराव, चयनात्मक दबाव आदि शामिल हैं।
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थोक पृथक विश्लेषण
बल्क्ड सेग्रेंट एनालिसिस (बीएसए) एक ऐसी तकनीक है जिसका उपयोग फेनोटाइप से जुड़े आनुवंशिक मार्करों की शीघ्रता से पहचान करने के लिए किया जाता है।बीएसए के मुख्य कार्यप्रवाह में अत्यंत विरोधी फेनोटाइप वाले व्यक्तियों के दो समूहों का चयन करना शामिल है, सभी व्यक्तियों के डीएनए को पूल करके दो थोक डीएनए बनाने के लिए, दो पूलों के बीच अंतर अनुक्रमों की पहचान करना।इस तकनीक का व्यापक रूप से पौधे/पशु जीनोम में लक्षित जीनों द्वारा दृढ़ता से जुड़े आनुवंशिक मार्करों की पहचान करने में उपयोग किया गया है।
