Hoʻohana ʻo mRNA sequencing i ka ʻenehana sequencing hanauna hou (NGS) e hopu i ka messenger RNA(mRNA) form Eukaryote i ka manawa kikoʻī e hoʻāla ana kekahi mau hana kūikawā.ʻO ka transcript lōʻihi loa i hoʻopili ʻia ua kapa ʻia ʻo 'Unigene' a hoʻohana ʻia ma ke ʻano he kaʻina kuhikuhi no ka nānā ʻana ma hope, ʻo ia ke ala kūpono e aʻo ai i ka mīkini molekala a me ka ʻoihana hoʻoponopono o nā ʻano me ka ʻole o ka kuhikuhi.
Ma hope o ka hōʻuluʻulu ʻana o ka ʻikepili transcriptome a me ka annotation hana unigene
(1) E hoʻonohonoho mua ʻia ka ʻike SNP, ka nānā ʻana SSR, ka wānana CDS a me ka hoʻolālā gene.
(2) E hana ʻia ka helu o ka ʻōlelo unigene i kēlā me kēia laʻana.
(3) E ʻike ʻia nā unigenes i hōʻike ʻia ma waena o nā laʻana (a i ʻole nā hui) ma muli o ka ʻōlelo unigene.
(4) E hoʻokō ʻia ka Clustering, ka wehewehe hana a me ka hoʻonui ʻana i nā unigenes i hōʻike ʻia.