ઉચ્ચ માર્કર શોધ કાર્યક્ષમતા- ઉચ્ચ-થ્રુપુટ સિક્વન્સિંગ ટેક્નોલોજી SLAF-Seq ને સમગ્ર જીનોમમાં હજારો ટૅગ્સ શોધવામાં મદદ કરે છે.
જીનોમ પર ઓછી અવલંબન- તે સંદર્ભ જીનોમ સાથે અથવા વગર જાતિઓ પર લાગુ કરી શકાય છે.
લવચીક યોજના ડિઝાઇન- સિંગલ-એન્ઝાઇમ, ડ્યુઅલ-એન્ઝાઇમ, મલ્ટિ-એન્ઝાઇમ પાચન અને વિવિધ પ્રકારના ઉત્સેચકો, બધાને વિવિધ સંશોધન ધ્યેય અથવા જાતિઓ પૂરી કરવા માટે પસંદ કરી શકાય છે.સિલિકોમાં પૂર્વ-મૂલ્યાંકનનો ઉપયોગ શ્રેષ્ઠ એન્ઝાઇમ ડિઝાઇનની ખાતરી કરવા માટે થાય છે.
કાર્યક્ષમ એન્ઝાઇમેટિક પાચન- પરિસ્થિતિઓને ઑપ્ટિમાઇઝ કરવા માટે પૂર્વ-પ્રયોગ હાથ ધરવામાં આવ્યો હતો, જે ઔપચારિક પ્રયોગને સ્થિર અને વિશ્વસનીય બનાવે છે.ફ્રેગમેન્ટ સંગ્રહ કાર્યક્ષમતા 95% થી વધુ હાંસલ કરી શકે છે.
સમાનરૂપે વિતરિત SLAF ટૅગ્સ- SLAF ટૅગ્સ તમામ રંગસૂત્રોમાં સમાનરૂપે વિતરિત કરવામાં આવે છે, જે 4 kb દીઠ સરેરાશ 1 SLAF હાંસલ કરે છે.
પુનરાવર્તનની અસરકારક નિવારણ- SLAF-Seq ડેટામાં પુનરાવર્તિત ક્રમ ઘટાડીને 5% કરતા ઓછો કરવામાં આવે છે, ખાસ કરીને ઉચ્ચ સ્તરના પુનરાવર્તન સાથેની પ્રજાતિઓમાં, જેમ કે ઘઉં, મકાઈ વગેરે.
વ્યાપક અનુભવ- છોડ, સસ્તન પ્રાણીઓ, પક્ષીઓ, જંતુઓ, એક્વા-જીવો વગેરેને આવરી લેતી સેંકડો પ્રજાતિઓ પર 2000 થી વધુ બંધ SLAF-Seq પ્રોજેક્ટ.
સ્વ-વિકસિત બાયોઇન્ફોર્મેટીક વર્કફ્લો- અંતિમ આઉટપુટની વિશ્વસનીયતા અને ચોકસાઈની ખાતરી કરવા BMKGENE દ્વારા SLAF-Seq માટે એક સંકલિત બાયોઇન્ફોર્મેટીક વર્કફ્લો વિકસાવવામાં આવ્યો હતો.
પ્લેટફોર્મ | કોન્સી.(ng/gl) | કુલ (ug) | OD260/280 |
ઈલુમિના નોવાસેક | >35 | >1.6(વોલમ>15μl) | 1.6-2.5 |
અનુક્રમ ઊંડાઈ: 10X/ટેગ
જીનોમ કદ | ભલામણ કરેલ SLAF ટૅગ્સ |
< 500 Mb | 100K અથવા WGS |
500 Mb- 1 Gb | 100 કે |
1 જીબી -2 જીબી | 200 કે |
વિશાળ અથવા જટિલ જીનોમ | 300 - 400K |
અરજીઓ
| ભલામણ કરેલ વસ્તી સ્કેલ
| સિક્વન્સિંગ વ્યૂહરચના અને ઊંડાઈ
| |
ઊંડાઈ
| ટેગ નંબર
| ||
GWAS
| નમૂના નંબર ≥ 200
| 10X
|
અનુસાર જીનોમ કદ
|
આનુવંશિક ઉત્ક્રાંતિ
| દરેકની વ્યક્તિઓ પેટાજૂથ ≥ 10; કુલ નમૂનાઓ ≥ 30
| 10X
|
કન્ટેનર: 2 મિલી સેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબ
મોટાભાગના નમૂનાઓ માટે, અમે ઇથેનોલમાં સાચવી ન રાખવાની ભલામણ કરીએ છીએ.
સેમ્પલ લેબલીંગ: સેમ્પલને સબમિટ કરેલ સેમ્પલ માહિતી ફોર્મ માટે સ્પષ્ટપણે લેબલ અને સમાન હોવું જરૂરી છે.
શિપમેન્ટ: ડ્રાય-આઈસ: સેમ્પલને પહેલા બેગમાં પેક કરીને ડ્રાય-આઈસમાં દાટી દેવાની જરૂર છે.
1. નકશા પરિણામના આંકડા
2. SLAF માર્કર વિકાસ
3. ભિન્નતા એનોટેશન
વર્ષ | જર્નલ | IF | શીર્ષક | અરજીઓ |
2022 | પ્રકૃતિ સંચાર | 17.694 | ગીગા-રંગસૂત્રોનો જીનોમિક આધાર અને વૃક્ષ પીનીના ગીગા-જીનોમ પેઓનિયા ઓસ્ટી | SLAF-GWAS |
2015 | નવા ફાયટોલોજિસ્ટ | 7.433 | ડોમેસ્ટિકેશન ફૂટપ્રિન્ટ્સ એગ્રોનોમિક મહત્વના જીનોમિક પ્રદેશોને એન્કર કરે છે સોયાબીન | SLAF-GWAS |
2022 | જર્નલ ઓફ એડવાન્સ્ડ રિસર્ચ | 12.822 | જી. હિરસુટમમાં ગોસીપિયમ બાર્બાડેન્સના જીનોમ-વ્યાપી કૃત્રિમ પ્રવેશ કપાસના ફાઇબરની ગુણવત્તા અને ઉપજમાં એક સાથે સુધારણા માટે શ્રેષ્ઠ સ્થાન જાહેર કરો લક્ષણો | SLAF-ઇવોલ્યુશનરી જીનેટિક્સ |
2019 | મોલેક્યુલર પ્લાન્ટ | 10.81 | પોપ્યુલેશન જીનોમિક એનાલિસિસ અને ડી નોવો એસેમ્બલી વીડીના મૂળને જાહેર કરે છે એક ઉત્ક્રાંતિ રમત તરીકે ચોખા | SLAF-ઇવોલ્યુશનરી જીનેટિક્સ |
2019 | નેચર જિનેટિક્સ | 31.616 | સામાન્ય કાર્પ, સાયપ્રિનસ કાર્પિયોની જીનોમ સિક્વન્સ અને આનુવંશિક વિવિધતા | SLAF-લિંકેજ નકશો |
2014 | નેચર જિનેટિક્સ | 25.455 | ખેતી કરેલ મગફળીનો જીનોમ લીગ્યુમ કેરીયોટાઇપ્સ, પોલીપ્લોઇડની સમજ આપે છે ઉત્ક્રાંતિ અને પાક પાળવું. | SLAF-લિંકેજ નકશો |
2022 | પ્લાન્ટ બાયોટેકનોલોજી જર્નલ | 9.803 | ST1 ની ઓળખ બીજ મોર્ફોલોજીના હિચહાઈકિંગ સાથે સંકળાયેલી પસંદગી દર્શાવે છે અને સોયાબીન પાળતી વખતે તેલનું પ્રમાણ | SLAF-માર્કર વિકાસ |
2022 | ઇન્ટરનેશનલ જર્નલ ઓફ મોલેક્યુલર સાયન્સ | 6.208 | ઘઉં-લેમસ મોલીસ 2Ns (2D) માટે ઓળખ અને ડીએનએ માર્કર ડેવલપમેન્ટ ડિસોમિક રંગસૂત્ર અવેજી | SLAF-માર્કર વિકાસ |