નાના આરએનએ સિક્વન્સિંગ-ઇલ્યુમિના
સેવા લાભો
● 5' છેડે પ્રથમ આધાર ચોક્કસ RNA મેળવવા માટે U માટે મજબૂત પસંદગી ધરાવે છે
● miRNA લક્ષ્ય જનીન અનુમાન
● ડેટાનો ઉપયોગ mRNA સાથે સંયુક્ત વિશ્લેષણ કરવા માટે થાય છે
● miRNA વિભેદક અભિવ્યક્તિ
● miRNA લક્ષ્ય જનીન અનુમાન
● BMKCloud-આધારિત પરિણામ વિતરણ: પ્લેટફોર્મ પર કસ્ટમાઇઝ્ડ ડેટા-માઇનિંગ ઉપલબ્ધ છે
● વેચાણ પછીની સેવાઓ પ્રોજેક્ટ પૂર્ણ થયા પછી 3 મહિના માટે માન્ય છે
નમૂના જરૂરિયાતો અને ડિલિવરી
| પુસ્તકાલય | પ્લેટફોર્મ | ભલામણ કરેલ ડેટા | ડેટા QC |
| sRNA | ઇલુમિના SE50 | 10M/20M વાંચે છે | Q30≥85% |
નમૂના જરૂરીયાતો:
ન્યુક્લિયોટાઇડ્સ:
| કોન્ક.(ng/μl) | રકમ (μg) | શુદ્ધતા | અખંડિતતા |
| ≥ 80 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 જેલ પર દર્શાવેલ મર્યાદિત અથવા કોઈ પ્રોટીન અથવા ડીએનએ દૂષણ નથી. | છોડ માટે: RIN≥7.5; પ્રાણીઓ માટે: RIN≥8.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; મર્યાદિત અથવા કોઈ આધારરેખા એલિવેશન નથી |
*5 મિલિગ્રામથી નાની પેશી માટે, અમે ફ્રોઝન (પ્રવાહી નાઇટ્રોજનમાં) પેશીના નમૂના મોકલવાની ભલામણ કરીએ છીએ.
સેલ સસ્પેન્શન: સેલ કાઉન્ટ = 3×107
*અમે ફ્રોઝન સેલ લિસેટ મોકલવાની ભલામણ કરીએ છીએ.જો તે કોષની ગણતરી 5×10 કરતા ઓછી હોય5, ફ્લૅશને પ્રવાહી નાઇટ્રોજનમાં સ્થિર કરવાની ભલામણ કરવામાં આવે છે.
લોહીના નમૂનાઓ:
PA×geneBloodRNATube;
6mLTRIzol અને 2mL રક્ત(TRIzol:Blood=3:1)
ભલામણ કરેલ નમૂના ડિલિવરી
કન્ટેનર:
2 મિલી સેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબ (ટીન ફોઇલની ભલામણ કરવામાં આવતી નથી)
નમૂના લેબલીંગ: જૂથ+પ્રતિકૃતિ દા.ત. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
શિપમેન્ટ:
1.ડ્રાય આઈસ: સેમ્પલને બેગમાં પેક કરીને ડ્રાય આઈસમાં દાટી દેવાની જરૂર છે.
2.RNAstable ટ્યુબ: RNA સેમ્પલને RNA સ્ટેબિલાઈઝેશન ટ્યુબમાં સૂકવી શકાય છે (દા.ત. RNAstable®) અને ઓરડાના તાપમાને મોકલી શકાય છે.
સેવા કાર્ય પ્રવાહ
પ્રયોગ ડિઝાઇન
નમૂના વિતરણ
આરએનએ નિષ્કર્ષણ
પુસ્તકાલય બાંધકામ
સિક્વન્સિંગ
માહિતી વિશ્લેષણ
વેચાણ પછીની સેવાઓ
બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ
1.miRNA ઓળખ
miRDeep2 દ્વારા અનુમાનિત નવલકથા miRNAs ના દરેક ઉમેદવાર પુરોગામી પાસે તેની રચના અને અનુક્રમની ઊંડાઈ દર્શાવતી પીડીએફ આકૃતિ છે.
miRNA પુરોગામી માળખું અને અનુક્રમની ઊંડાઈ
2. DE-miRNA લક્ષિત જનીનોનું KEGG સંવર્ધન
આ સત્રમાં, બાયોમાર્કરે સૌપ્રથમ તપાસ કરી કે શું માર્ગો DE-miRNA લક્ષિત જનીનો સાથે અતિશય પ્રસ્તુતિ છે.સંવર્ધનની ડિગ્રી અને માર્ગના મહત્વના નિર્ધારણમાં સંવર્ધન પરિબળો અને ફિશર ટેસ્ટ લાગુ કરવામાં આવ્યા હતા.સંવર્ધન ગણતરીનું સમીકરણ નીચે દર્શાવેલ છે.
DE-miRNA લક્ષિત જનીનો પર KEGG પાથવે સંવર્ધન
DE-miRNA લક્ષિત જનીનો પર GO સંવર્ધન વિશ્લેષણ
DE-miRNA લક્ષિત જનીનો પર GO સંવર્ધન વિશ્લેષણમાં ક્લસ્ટરપ્રોફાઈલરનો ઉપયોગ કરવામાં આવ્યો હતો.શબ્દોની અધિક્રમિક માળખું બતાવવા માટે સમૃદ્ધ શબ્દોનો નિર્દેશિત એસાયક્લિક ગ્રાફ બનાવવામાં આવ્યો હતો.આકૃતિમાં, તીરોની દિશા શબ્દો વચ્ચેના સમાવેશ સંબંધોને દર્શાવે છે, એટલે કે ગાંઠો તેમના ઉપલા ગાંઠો કરતાં વધુ વિશિષ્ટ છે.DE-miRNA લક્ષિત જનીનોનો નિર્દેશિત એસિલીક ગ્રાફ નીચેની આકૃતિમાં દર્શાવવામાં આવ્યો હતો.
TopGO એ DE-miRNA લક્ષિત જનીનોનો એસાયક્લિક ગ્રાફ નિર્દેશિત કર્યો
BMK કેસ
માંસની ગુણવત્તા સાથે સંકળાયેલ MiRNA અને જનીનોનું સંકલિત વિશ્લેષણ દર્શાવે છે કે Gga-MiR-140-5p મરઘીઓમાં ઇન્ટ્રામસ્ક્યુલર ચરબીના જથ્થાને અસર કરે છે
પ્રકાશિત:સેલ્યુલર ફિઝિયોલોજી અને બાયોકેમિસ્ટ્રી,2018
મુખ્ય પરિણામો
લેટ લેઇંગ-પીરિયડ મરઘીઓ કિશોર મરઘીઓ કરતાં miRNAsના નીચા વૈશ્વિક અભિવ્યક્તિ સ્તરનું પ્રદર્શન કરે છે.
મીરએનએ-એમઆરએનએનું એક નિયમનકારી નેટવર્ક કે જે માંસની ગુણવત્તાને અસર કરી શકે છે તે બનાવવામાં આવ્યું હતું
gga-miR-140-5p RXRG ને ડાઉન રેગ્યુલેટ કરીને એડિપોસાઇટ ભિન્નતાને પ્રોત્સાહન આપે છે.
 gga-miR-140-5p RXRG ના 3'UTR ને લક્ષ્ય બનાવીને ચિકન ઇન્સ્ટ્રામસ્ક્યુલર પ્રીડિપોસાઇટ ભિન્નતાને પ્રોત્સાહન આપે છે |
સંદર્ભ
ઝાંગ એમ , લી ડીએચ , લી એફ , એટ અલ.માંસની ગુણવત્તા સાથે સંકળાયેલ MiRNA અને જનીનોનું સંકલિત વિશ્લેષણ દર્શાવે છે કે Gga-MiR-140-5p ચિકન[J] માં ઇન્ટ્રામસ્ક્યુલર ફેટ ડિપોઝિશનને અસર કરે છે.સેલ્યુલર ફિઝિયોલોજી અને બાયોકેમિસ્ટ્રી, 2018:2421-2433.DOI: 10.1159/000489649
