હીટમેપ
મેટ્રિક્સ ડેટા ફાઇલનો ઉપયોગ હીટ મેપ ડ્રોઇંગ માટે થાય છે, જે મેટ્રિક્સ ડેટાને ફિલ્ટર, નોર્મલાઇઝ અને ક્લસ્ટર કરી શકે છે.તે મોટે ભાગે વિવિધ નમૂનાઓ વચ્ચે જનીન અભિવ્યક્તિ સ્તરના ક્લસ્ટર વિશ્લેષણ માટે વપરાય છે.
જીન એનોટેશન
જીન ફંક્શન એનોટેશન વિવિધ ડેટાબેઝ સામે FASTA ફાઇલમાં સિક્વન્સ મેપિંગ દ્વારા કરવામાં આવે છે.
જીન એનોટેશન
મૂળભૂત સ્થાનિક સંરેખણ શોધ સાધન
CDS_UTR_અનુમાન
આ ટૂલ જાણીતા પ્રોટીન ડેટાબેઝ અને ORF આગાહી સામે બ્લાસ્ટિંગના આધારે આપેલ ટ્રાન્સક્રિપ્ટ સિક્વન્સમાં કોડિંગ પ્રદેશો (CDS) અને નોન-કોડિંગ પ્રદેશો (UTR) ની આગાહી કરવા માટે રચાયેલ છે.
મેનહટન પ્લોટ
મેનહટન પ્લોટ મોટી સંખ્યામાં ડેટા પોઈન્ટ સાથે ડેટાના પ્રદર્શનને સક્ષમ કરે છે.તે સામાન્ય રીતે જીનોમ-વાઇડ એસોસિએશન સ્ટડીઝ (GWAS) માં વપરાય છે.
સર્કોસ
CIRCOS ડાયાગ્રામ જીનોમ પર SNP, InDeL, SV, CNV વિતરણની સીધી રજૂઆતને સક્ષમ કરે છે.
GO_Enrichment
TopGO એ કાર્યાત્મક સંવર્ધન માટે રચાયેલ સાધન છે.TopGO-Bioconductor પેકેજમાં વિભેદક અભિવ્યક્તિ વિશ્લેષણ, GO સંવર્ધન વિશ્લેષણ અને પરિણામોનું વિઝ્યુલાઇઝેશન શામેલ છે.તે "ગ્રાફ" નામના આઉટપુટ સાથે એક ફોલ્ડર જનરેટ કરશે, જેમાં topGO_BP, topGO_CC અને topGO_MF માટે પરિણામો હશે.
WGCNA
WGCNA એ જનીન સહ-અભિવ્યક્તિ મોડ્યુલો શોધવા માટે વ્યાપકપણે ઉપયોગમાં લેવાતી ડેટા માઇનિંગ પદ્ધતિ છે.તે માઇક્રોએરે ડેટા અને નેક્સ્ટ જનરેશન સિક્વન્સિંગમાંથી ઉદ્દભવેલા જીન એક્સપ્રેશન ડેટા સહિત વિવિધ એક્સપ્રેશન ડેટાસેટને લાગુ પડે છે.
ઇન્ટરપ્રોસ્કેન
ઇન્ટરપ્રો પ્રોટીન ક્રમ વિશ્લેષણ અને વર્ગીકરણ
GO_KEGG_સંવર્ધન
આ ટૂલ GO એનરિચમેન્ટ હિસ્ટોગ્રામ, KEGG એનરિચમેન્ટ હિસ્ટોગ્રામ અને KEGG એનરિચમેન્ટ પાથવેને પ્રદાન કરેલ જનીન સેટ અને અનુરૂપ એનોટેશનના આધારે જનરેટ કરવા માટે ડિઝાઇન કરવામાં આવ્યું છે.