છોડ/પ્રાણી સંપૂર્ણ જીનોમ સિક્વન્સિંગ
1.સેવા લાભો
1000 થી વધુ પ્રજાતિઓ માટે જીનોમ સિક્વન્સિંગનો વ્યાપક અનુભવ.
4000 થી વધુના સંચિત અસર પરિબળ સાથે 800 થી વધુ પ્રકાશિત કેસ.
વિવિધતા કૉલિંગ અને કાર્ય વિશ્લેષણ પર વ્યાપક બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ વિશ્લેષણ.
2. સેવા વિશિષ્ટતાઓ
| પ્લેટફોર્મ | પુસ્તકાલય | ભલામણ કરેલ seq ઊંડાઈ | |
| ઈલુમિના | PE 150 | SNP માટે, InDel કૉલિંગ ≥ 10x SV માટે, CNY કૉલિંગ ≥ 30x
| |
| નેનોપોર
| 8 kb | SV માટે, CNY કૉલિંગ ≥ 20x | |
| પેકબીઓ | સીસીએસ | 15 કેબી | SNP, InDel, SV, CNY કૉલિંગ ≥ 10x માટે |
3. નમૂના જરૂરીયાતો
| પ્લેટફોર્મ | કોન્સે.(ng/μL)
| રકમ (ng)
| શુદ્ધતા
| એગરોઝ જેલ
| ||
| OD260/280 | OD260/230 | 1. ના અથવા મર્યાદિત સાથે મુખ્ય બેન્ડ સાફ કરોજેલ પર અવલોકન થયેલ અધોગતિ. 2. ના અથવા મર્યાદિત આરએનએ અથવા પ્રોટીન દૂષણ
| ||||
| ઈલુમિના | ≥1 | ≥30
| - | - | ||
| નેનોપોર
| ≥30 | ડેટા ઉપજ પર આધાર રાખે છે 10μg/કોષ | 1.7-2.2 | ≥1.5 | ||
| પેકબીઓ | સીસીએસ | ≥50 | 1.7-2.2 | 1.8-2.5 | ||
4. બાયોઇન્ફોર્મેશન એનાલિસિસ
5. સેવા કાર્ય પ્રવાહ
નમૂના વિતરણ
ડીએનએ નિષ્કર્ષણ
પુસ્તકાલય બાંધકામ
સિક્વન્સિંગ
માહિતી વિશ્લેષણ
ડેટા ડિલિવરી
1) જીનોમ મેપિંગના આંકડા
કોષ્ટક 1 મેપિંગ પરિણામના આંકડા
આકૃતિ 1 ઇન્સર્ટ સાઇઝ અને રીડ કવરેજનું વિતરણ.
2) વિવિધતા શોધ
આકૃતિ 2 નમૂનાઓ વચ્ચે SNP/INDEL/SV ના આંકડા અને ટીકા
આકૃતિ 3 જીનોમ-વ્યાપક વેટિયેશનનું વિતરણ
3) વિવિધતાઓની કાર્યાત્મક ટીકા
| 2019 | પ્રકૃતિ સંચાર | સંપૂર્ણ-જીનોમ રિક્વેન્સિંગ તેના સુધારણામાં સામેલ બ્રાસિકા નેપસ મૂળ અને આનુવંશિક સ્થાનને દર્શાવે છે |
| 2020 | PNAS | ગોલ્ડફિશનો ઉત્ક્રાંતિ મૂળ અને પાળવાનો ઇતિહાસ (કેરાસિયસ ઓરેટસ) |
| 2021 | પ્લાન્ટ બાયોટેકનોલોજી જર્નલ | બે ઉગાડવામાં આવતી શણની જાતોના સંદર્ભ જીનોમ |
| 2021 | પ્લાન્ટ બાયોટેકનોલોજી જર્નલ | ગ્લુકોસિનોલેટ્સના સંચયને નિયંત્રિત કરતી વનસ્પતિ અને તેલીબિયાં એલોપોલીપ્લોઇડ બ્રાસીકાજુન્સિયા અને આનુવંશિક સ્થાનની જીનોમિક હસ્તાક્ષર |
| 2019 | મોલેક્યુલર પ્લાન્ટ | રેપસીડ એક્સેસન્સના વિશ્વવ્યાપી સંગ્રહનું સંપૂર્ણ-જીનોમ અનુકરણ તેમના ઇકોટાઇપ વિચલનનો આનુવંશિક આધાર દર્શાવે છે |
| 2022 | બાગાયત સંશોધન | જીનોમ-વાઇડ એસોસિએશન વિશ્લેષણ તરબૂચના બીજના કદની કુદરતી વિવિધતામાં પરમાણુ આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે |
| 2021 | જર્નલ ઓફ એક્સપેરિમેન્ટલ બોટની | જીનોમ-વાઇડ એસોસિએશન અભ્યાસ GhSAD1 ના પ્રકારોને ઓળખે છે જે કપાસમાં ઠંડા સહનશીલતા આપે છે |
| 2021 | જર્નલ ઓફ એક્સપેરિમેન્ટલ બોટની | જીનોમ-વાઇડ એસોસિએશન અભ્યાસ અને ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સરખામણી નવલકથા QTL અને ઉમેદવાર જનીનો દર્શાવે છે જે રેપસીડમાં પાંખડીના કદને નિયંત્રિત કરે છે |
