પેસિફિક બાયોસાયન્સિસ (PacBio) આઇસોફોર્મ સિક્વન્સિંગ ડેટાને ઇનપુટ તરીકે લેતા, આ એપ્લિકેશન પૂર્ણ-લંબાઈના ટ્રાન્સક્રિપ્ટ સિક્વન્સ (એસેમ્બલી વિના) ઓળખવામાં સક્ષમ છે.સંદર્ભ જિનોમ સામે પૂર્ણ-લંબાઈના સિક્વન્સને મેપ કરીને, ટ્રાન્સક્રિપ્ટ્સને જાણીતા જનીનો, ટ્રાન્સક્રિપ્ટ્સ, કોડિંગ પ્રદેશો વગેરે દ્વારા ઑપ્ટિમાઇઝ કરી શકાય છે. આ કિસ્સામાં, mRNA સ્ટ્રક્ચર્સની વધુ સચોટ ઓળખ, જેમ કે વૈકલ્પિક સ્પ્લિસિંગ વગેરે, પ્રાપ્ત કરી શકાય છે.NGS ટ્રાન્સક્રિપ્ટમ સિક્વન્સિંગ ડેટા સાથેનું સંયુક્ત વિશ્લેષણ ટ્રાન્સક્રિપ્ટ સ્તરે અભિવ્યક્તિમાં વધુ વ્યાપક એનોટેશન અને વધુ સચોટ પરિમાણને સક્ષમ કરે છે, જે મોટાભાગે ડાઉનસ્ટ્રીમ ડિફરન્સિયલ એક્સપ્રેશન અને ફંક્શનલ એનાલિસિસને લાભ આપે છે.