જીનોમ ઇવોલ્યુશન, પેનજેનોમ
પાન-જીનોમ શું છે?
સંચિત પુરાવા દર્શાવે છે કે એક પ્રજાતિની વિવિધ જાતો વચ્ચેનો તફાવત વિશાળ હોઈ શકે છે.એક જ જિનોમ એક જ પ્રજાતિની આનુવંશિક માહિતીનું સંપૂર્ણ ચિત્ર મેળવવા માટે પૂરતું નથી.પાન-જીનોમ અભ્યાસનો હેતુ પ્રજાતિનો વધુ વ્યાપક જીનોમિક ગ્રાફ મેળવવાનો છે અને અસંખ્ય જાતોના જીનોમ ડી નોવો એસેમ્બલીનું સંચાલન કરીને લક્ષણો અને આનુવંશિક કોડ વચ્ચેના સંબંધોને ડીકોડ કરવાનો છે, જે વિવિધતાઓના ઊંડા અને વ્યાપક ખાણકામને મંજૂરી આપે છે.
પાન-જીનોમ અભ્યાસના વલણો
આકૃતિ 1 પાન-જીનોમના પ્રકાશિત સંશોધન પેપરના વલણો.
નોંધ: આકૃતિ કુદરત, સેલ અને સાયન્સ શ્રેણી જર્નલમાં પ્રકાશિત થયેલા લેખોના શીર્ષકો શોધવા માટે મુખ્ય શબ્દ તરીકે "પાન-જીનોમ" લેવાનું પરિણામ દર્શાવે છે.
aબહુવિધ નમૂનાઓમાંથી વાંચન સંદર્ભ સાથે સંરેખિત કરવામાં આવે છે અને અસંબંધિતને નવલકથા કોન્ટિગ્સમાં એસેમ્બલ કરવામાં આવે છે.મૂળ સંદર્ભ ક્રમમાં આ નવલકથા કોન્ટિગ્સ ઉમેરીને, પેન્જેનોમ સંદર્ભ બનાવી શકાય છે.પેન્જેનોમ પરના તમામ રીડને મેપિંગના આધારે ડિસ્પેન્સેબલ પ્રદેશો નક્કી કરવામાં આવે છે.
bબહુવિધ એક્સેસન્સના જિનોમ્સની ડી નોવો એસેમ્બલી, ડિસ્પેન્સેબલ જીનોમિક પ્રદેશોને ઓળખવા માટે સમગ્ર જિનોમ સંરેખણ અભિગમોને મંજૂરી આપે છે.
cએક પાન-જીનોમ ગ્રાફ સમગ્ર જીનોમ સંરેખણમાંથી અથવા ડી નોવો ગ્રાફ એસેમ્બલી દ્વારા બનાવી શકાય છે, જે ગ્રાફ દ્વારા અનન્ય પાથ તરીકે ડિસ્પેન્સેબલ પ્રદેશોની વિવિધ માહિતીને કાર્યક્ષમ રીતે સંગ્રહિત કરે છે.
પાન-જીનોમ કેવી રીતે બનાવવો?
આકૃતિ 2 પાન-જીનોમ અભિગમોની સરખામણી1
aબહુવિધ નમૂનાઓમાંથી વાંચન સંદર્ભ સાથે સંરેખિત કરવામાં આવે છે અને અસંબંધિતને નવલકથા કોન્ટિગ્સમાં એસેમ્બલ કરવામાં આવે છે.મૂળ સંદર્ભ ક્રમમાં આ નવલકથા કોન્ટિગ્સ ઉમેરીને, પેન્જેનોમ સંદર્ભ બનાવી શકાય છે.પેન્જેનોમ પરના તમામ રીડને મેપિંગના આધારે ડિસ્પેન્સેબલ પ્રદેશો નક્કી કરવામાં આવે છે.
bબહુવિધ એક્સેસન્સના જિનોમ્સની ડી નોવો એસેમ્બલી, ડિસ્પેન્સેબલ જીનોમિક પ્રદેશોને ઓળખવા માટે સમગ્ર જિનોમ સંરેખણ અભિગમોને મંજૂરી આપે છે.
cએક પાન-જીનોમ ગ્રાફ સમગ્ર જીનોમ સંરેખણમાંથી અથવા ડી નોવો ગ્રાફ એસેમ્બલી દ્વારા બનાવી શકાય છે, જે ગ્રાફ દ્વારા અનન્ય પાથ તરીકે ડિસ્પેન્સેબલ પ્રદેશોની વિવિધ માહિતીને કાર્યક્ષમ રીતે સંગ્રહિત કરે છે.
તાજેતરમાં પ્રકાશિત પાન-જીનોમ
● બળાત્કાર પાન-જીનોમ2
● ટામેટા પાન-જીનોમ 3
● ચોખા પાન -જીનોમ4
● સૂર્યમુખી પાન-જીનોમ5
● સોયાબીન પાન-જીનોમ 6
● ચોખા પાન-જીનોમ7
● જવ પાન-જીનોમ8
● ઘઉંનો પાન-જીનોમ9
● જુવાર પાન-જીનોમ10
● ફાયટોપ્લાંકટોન પાન-જીનોમ11
સંદર્ભ
1. Bayer PE, Golicz AA, Scheben A, Batley J, Edwards D. પ્લાન્ટ પાન-જીનોમ એ નવો સંદર્ભ છે.નેટ છોડ.2020;6(8):914-920.doi:10.1038/s41477-020-0733-0
2. ગીત JM, Guan Z, Hu J, et al.આઠ ઉચ્ચ-ગુણવત્તાવાળા જિનોમ્સ બ્રાસિકા નેપસના પાન-જીનોમ આર્કિટેક્ચર અને ઇકોટાઇપ ભિન્નતા દર્શાવે છે.નેટ છોડ.2020;6(1):34-45.doi:10.1038/s41477-019-0577-7
3. ગાઓ એલ, ગોંડા I, સન એચ, એટ અલ.ટામેટા પાન-જીનોમ નવા જનીનો અને ફળોના સ્વાદને નિયંત્રિત કરતા દુર્લભ એલીલને ઉજાગર કરે છે.નેટ જીનેટ.2019;51(6):1044-1051.doi:10.1038/s41588-019-0410-2
4. ઝાઓ ક્યૂ, ફેંગ ક્યૂ, લુ એચ, એટ અલ.પાન-જીનોમ પૃથ્થકરણ ખેતી અને જંગલી ચોખામાં જીનોમિક ભિન્નતાની હદને પ્રકાશિત કરે છે [પ્રકાશિત કરેક્શન નેટ જીનેટમાં દેખાય છે.2018 ઓગસ્ટ;50(8):1196].નેટ જીનેટ.2018;50(2):278-284.doi:10.1038/s41588-018-0041-z
5. Hübner S, Bercovich N, Todesco M, et al.સૂર્યમુખી પાન-જીનોમ વિશ્લેષણ દર્શાવે છે કે વર્ણસંકરીકરણથી જનીન સામગ્રી અને રોગ પ્રતિકારમાં ફેરફાર થાય છે.નેટ છોડ.2019;5(1):54-62.doi:10.1038/s41477-018-0329-0
6. લિયુ વાય, ડુ એચ, લિ પી, એટ અલ.જંગલી અને ખેતી કરેલ સોયાબીનનો પાન-જીનોમ.કોષ.2020;182(1):162-176.e13.doi:10.1016/j.cell.2020.05.023
7. કિન પી, લુ એચ, ડુ એચ, એટ અલ.33 આનુવંશિક રીતે વૈવિધ્યસભર ચોખાના જોડાણોનું પાન-જીનોમ વિશ્લેષણ છુપાયેલા જીનોમિક ભિન્નતાઓને જાહેર કરે છે [પ્રિન્ટ પહેલા, 2021 મે 25ના રોજ ઓનલાઈન પ્રકાશિત].કોષ.2021;S0092-8674(21)00581-X.doi:10.1016/j.cell.2021.04.046
8. જયકોડી એમ, પદ્મરાસુ એસ, હેબેર જી, એટ અલ.જવનો પાન-જીનોમ પરિવર્તન સંવર્ધનનો છુપાયેલ વારસો છતી કરે છે.કુદરત.2020;588(7837):284-289.doi:10.1038/s41586-020-2947-8
9. વોકોવિયાક એસ, ગાઓ એલ, મોનાટ સી, એટ અલ.ઘઉંના બહુવિધ જીનોમ આધુનિક સંવર્ધનમાં વૈશ્વિક વિવિધતા દર્શાવે છે.કુદરત.2020;588(7837):277-283.doi:10.1038/s41586-020-2961-x
10. તાઓ વાય, લુઓ એચ, ઝુ જે, એટ અલ.ખેતી અને જંગલી જુવારના પાન-જીનોમમાં વ્યાપક ભિન્નતા [પ્રિન્ટ પહેલા ઓનલાઈન પ્રકાશિત, 2021 મે 20].નેટ છોડ.2021;10.1038 / s41477-021-00925-x.doi:10.1038/s41477-021-00925-x
11. ફેન X, Qiu H, Han W, et al.ફાયટોપ્લાંકટોન પેન્જેનોમ વિવિધ કાર્યોના વ્યાપક પ્રોકાર્યોટિક આડી જીન ટ્રાન્સફરને દર્શાવે છે.સાયન્સ એડ્વ.2020;6(18):eaba0111.29 એપ્રિલ 2020 ના રોજ પ્રકાશિત. doi:10.1126/sciadv.aba0111
પોસ્ટ સમય: જાન્યુઆરી-04-2022