ઉત્પાદનો

*અહીં દર્શાવેલ ડેમો પરિણામો બધા જ બાયોમાર્કર ટેક્નોલોજી સાથે પ્રકાશિત થયેલ જીનોમમાંથી છે

1.Hi-C ક્રિયાપ્રતિક્રિયા ગરમી નકશોકેમ્પટોથેકા એક્યુમિનાટાજીનોમનકશા પર બતાવ્યા પ્રમાણે, ક્રિયાપ્રતિક્રિયાઓની તીવ્રતા રેખીય અંતર સાથે નકારાત્મક રીતે સંકળાયેલી છે, જે અત્યંત સચોટ રંગસૂત્ર-સ્તરની એસેમ્બલી સૂચવે છે.(એન્કરિંગ રેશિયો: 96.03%)

કાંગ એમ એટ અલ.,નેચર કોમ્યુનિકેશન્સ, 2021

2.Hi-C વચ્ચેના વ્યુત્ક્રમોની માન્યતાને સરળ બનાવે છેગોસીપિયમ હિરસુટમL. TM-1 A06 અનેજી. આર્બોરિયમChr06

યાંગ ઝેડ એટ અલ.,નેચર કોમ્યુનિકેશન્સ, 2019

3. કસાવા જીનોમ SC205 ની એસેમ્બલી અને બાયલેલિક ભિન્નતા.હાઈ-સી હીટમેપ હોમોલોગસ રંગસૂત્રોમાં સ્પષ્ટ વિભાજન દર્શાવે છે.

હુ ડબલ્યુ એટ અલ.,મોલેક્યુલર પ્લાન્ટ, 2021

4. બે ફિકસ પ્રજાતિઓના જીનોમ એસેમ્બલી પર હાઇ-સી હીટમેપ:F.microcarpa(એન્કરિંગ રેશિયો: 99.3%) અનેF.hispida (એન્કરિંગ રેશિયો: 99.7%)

ઝાંગ એક્સ એટ અલ.,કોષ, 2020

BMK કેસ

વડના વૃક્ષ અને પરાગરજ ભમરીના જીનોમ્સ ફિગ-ભમરી સહઉત્ક્રાંતિની આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે

પ્રકાશિત: કોષ, 2020

અનુક્રમ વ્યૂહરચના:

એફ. માઇક્રોકાર્પા જીનોમ: આશરે.84 X PacBio RSII (36.87 Gb) + Hi-C (44 Gb)

એફ. હિસ્પીડાજીનોમ: આશરે.97 X PacBio RSII (36.12 Gb) + Hi-C (60 Gb)

યુપ્રિસ્ટિના વર્ટીસીલાટાજીનોમ: આશરે.170 X PacBio RSII (65 Gb)

મુખ્ય પરિણામો

1. બે વડના ઝાડના જીનોમ અને એક પરાગ રજક ભમરી જીનોમ PacBio સિક્વન્સિંગ, Hi-C અને લિન્કેજ મેપનો ઉપયોગ કરીને બનાવવામાં આવ્યા હતા.
(1)એફ. માઇક્રોકાર્પાજિનોમ: 426 Mb (અંદાજિત જિનોમ કદના 97.7%) ની એસેમ્બલી 908 Kb ના કોન્ટિગ N50, 95.6% ના BUSCO સ્કોર સાથે સ્થાપિત કરવામાં આવી હતી.Hi-C દ્વારા કુલ 423 Mb સિક્વન્સને 13 રંગસૂત્રો સાથે લંગરવામાં આવ્યા હતા.જીનોમ એનોટેશનથી 29,416 પ્રોટીન-કોડિંગ જનીનો પ્રાપ્ત થયા.
(2)એફ. હિસ્પીડાજિનોમ: 360 Mb (અંદાજિત જિનોમ કદના 97.3%) ની એસેમ્બલી 492 Kb ના કોન્ટિગ N50 અને 97.4% ના BUSCO સ્કોર સાથે ઉપજ હતી.કુલ 359 Mb સિક્વન્સ હાઇ-સી દ્વારા 14 રંગસૂત્રો પર લંગરવામાં આવ્યા હતા અને ઉચ્ચ ઘનતાના જોડાણ નકશા સાથે ખૂબ સમાન હતા.
(3)યુપ્રિસ્ટિના વર્ટીસીલાટાજિનોમ: 387 Mb (અંદાજિત જિનોમ કદ: 382 Mb) ની એસેમ્બલી 3.1 Mb ના કોન્ટિગ N50 અને 97.7% ના BUSCO સ્કોર સાથે સ્થાપિત કરવામાં આવી હતી.

2. તુલનાત્મક જિનોમિક્સ પૃથ્થકરણથી બે વચ્ચે મોટી સંખ્યામાં સંરચનામાં ભિન્નતા જોવા મળે છેફિકસજીનોમ, જે અનુકૂલનશીલ ઉત્ક્રાંતિ અભ્યાસ માટે અમૂલ્ય આનુવંશિક સંસાધન પ્રદાન કરે છે.આ અભ્યાસ, પ્રથમ વખત, જીનોમિક-સ્તરે ફિગ-ભમરી સહ ઉત્ક્રાંતિની આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે.

બેના જીનોમિક લક્ષણો પર સર્કોસ ડાયાગ્રામફિકસજીનોમ્સ, જેમાં રંગસૂત્રો, સેગમેન્ટલ ડુપ્લિકેશન્સ (SDs), ટ્રાન્સપોસોન્સ (LTR, TEs, DNA TEs), જનીન અભિવ્યક્તિ અને સિન્ટેનીનો સમાવેશ થાય છે

Y રંગસૂત્ર અને જાતિ નિર્ધારણ ઉમેદવાર જનીનની ઓળખ