-
Secuenciación de ARNm de lonxitude completa-Nanopore
A secuenciación do ARN foi unha ferramenta inestimable para a análise completa do transcriptoma.Sen dúbida, a secuenciación de lectura curta tradicional logrou un importante desenvolvemento aquí.Non obstante, a miúdo atopa limitacións nas identificacións de isoformas de lonxitude completa, a cuantificación e o sesgo da PCR.
A secuenciación de nanoporos distínguese doutras plataformas de secuenciación, xa que os nucleótidos lense directamente sen a síntese de ADN e xeran lecturas longas a decenas de quilobases.Isto permite a lectura directa cruzando transcricións completas e abordar os retos dos estudos a nivel de isoformas.
Plataforma:Nanopore PromethION
Biblioteca:cDNA-PCR
-
Secuenciación de transcriptoma de novo de lonxitude completa -PacBio
De novosecuenciación de transcriptoma de lonxitude completa, tamén coñecida comoDe novoIso-Seq aproveita as vantaxes do secuenciador PacBio na lonxitude de lectura, que permite a secuenciación de moléculas de ADNc de lonxitude total sen interrupcións.Isto evita completamente os erros xerados nos pasos de montaxe da transcrición e constrúe conxuntos uníxenos con resolución de nivel de isoforma.Este conxunto uníxeno proporciona información xenética poderosa como "xenoma de referencia" a nivel de transcriptoma.Ademais, combinado con datos de secuenciación de próxima xeración, este servizo permite unha cuantificación precisa da expresión a nivel de isoformas.
Plataforma: PacBio Sequel IIBiblioteca: SMRT bell library -
Secuenciación de ARNm eucariotas-Illumina
A secuenciación do ARNm permite o perfil de todos os ARNm transcritos das células en condicións específicas.É unha tecnoloxía poderosa para revelar o perfil de expresión xénica, as estruturas xénicas e os mecanismos moleculares de certos procesos biolóxicos.Ata a data, a secuenciación do ARNm empregouse amplamente na investigación fundamental, diagnóstico clínico, desenvolvemento de fármacos, etc.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Secuenciación de ARNm non baseada en referencias-Illumina
A secuenciación do ARNm adopta a técnica de secuenciación de próxima xeración (NGS) para capturar o ARN mensaxeiro (ARNm) da forma eucariota nun período específico no que algunhas funcións especiais están activando.A transcrición máis longa empalmada chamouse "Unigene" e utilizouse como secuencia de referencia para a análise posterior, o que é un medio eficaz para estudar o mecanismo molecular e a rede reguladora da especie sen referencia.
Despois da montaxe de datos do transcriptoma e da anotación funcional uníxena
(1)Preformarase análise SNP, análise SSR, predición de CDS e estrutura xenética.
(2) Realizarase a cuantificación da expresión uníxena en cada mostra.
(3) Descubriranse uníxenos expresados de forma diferencial entre mostras (ou grupos) en función da expresión uníxeno
(4) Realizarase a agrupación, anotación funcional e análise de enriquecemento de uníxenos expresados diferencialmente.
-
Secuenciación longa non codificante-Illumina
Os ARN longos non codificantes (lncRNAs) son un tipo de moléculas de ARN cunha lonxitude superior a 200 nt, que se caracterizan por un potencial de codificación extremadamente baixo.O LncRNA, como membro clave nos ARN non codificantes, atópase principalmente no núcleo e no plasma.O desenvolvemento da tecnoloxía de secuenciación e da bioinformática permite identificar numerosos lncRNA novos e asocialos con funcións biolóxicas.As evidencias acumuladas suxiren que o lncRNA está moi implicado na regulación epixenética, na regulación da transcrición e na regulación posterior á transcrición.
-
Secuenciación de ARN pequeno-Illumina
O ARN pequeno refírese a unha clase de moléculas de ARN non codificantes que adoitan ter menos de 200 nt de lonxitude, incluíndo micro ARN (miRNA), pequeno ARN de interferencia (siRNA) e ARN que interactúa con piwi (piRNA).
O microARN (miARN) é unha clase de ARN pequeno endóxeno cunha lonxitude duns 20-24nt, que desempeña unha variedade de funcións reguladoras importantes nas células.miARN implicado en moitos procesos vitais que revelan a expresión específica do tecido -específico e estadio- e moi conservado en diferentes especies.
-
Secuenciación de circRNA-Illumina
A secuenciación de transcriptomas completos está deseñada para perfilar todo tipo de moléculas de ARN, incluídos os ARN codificantes (ARNm) e non codificantes (incluíndo ARNlnc, ARN circular e miARN) que son transcritos por células específicas nun momento determinado.A secuenciación do transcriptoma completo, tamén coñecida como "secuenciación do ARN total" ten como obxectivo revelar redes reguladoras completas a nivel de transcriptoma.Aproveitando a tecnoloxía NGS, están dispoñibles secuencias de produtos de transcriptoma completos para a análise de ARN ceRNA e análise de ARN conxunto, o que proporciona o primeiro paso cara á caracterización funcional.Revelando a rede reguladora do ceRNA baseado en circRNA-miRNA-mRNA.
-
Secuenciación de transcriptoma completo - Illumina
A secuenciación de transcriptomas completos está deseñada para perfilar todo tipo de moléculas de ARN, incluídos os ARN codificantes (ARNm) e non codificantes (incluíndo ARNlnc, ARN circular e miARN) que son transcritos por células específicas nun momento determinado.A secuenciación do transcriptoma completo, tamén coñecida como "secuenciación do ARN total" ten como obxectivo revelar redes reguladoras completas a nivel de transcriptoma.Aproveitando a tecnoloxía NGS, están dispoñibles secuencias de produtos de transcriptoma completos para a análise de ARN ceRNA e análise de ARN conxunto, o que proporciona o primeiro paso cara á caracterización funcional.Revelando a rede reguladora do ceRNA baseado en circRNA-miRNA-mRNA.
-
Secuenciación de ARN procariota
A secuenciación de ARN procariota utiliza a secuenciación de próxima xeración (NGS) para revelar a presenza e a cantidade de ARN nun momento dado, mediante a análise do transcriptoma celular cambiante.A secuenciación de ARN procariota da nosa empresa ten como obxectivo específico os procariotas con xenomas de referencia, proporcionándolle perfís de transcriptoma, análise de estruturas xenéticas, etc. Aplicouse amplamente á investigación científica básica, á investigación e desenvolvemento de fármacos, etc.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Secuenciación de metatranscriptomas
A secuenciación do metatranscriptoma identifica a expresión xénica de microbios (tanto eucariotas como procariotas) dentro de ambientes naturais (é dicir, solo, auga, mar, feces e intestino). En concreto, este servizo permítelle obter un perfil de expresión xénica completa de comunidades microbianas complexas, análise taxonómica. de especies, análise de enriquecemento funcional de xenes expresados de forma diferente e moito máis.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
