Produtos

Secuenciación de ARN dun só núcleo

O avance na captura dunha soa célula e na técnica de construción de bibliotecas individuais que se combina coa secuenciación de alto rendemento permite estudos de expresión xénica célula por célula.Permite unha análise do sistema máis profunda e completa en poboacións celulares complexas, na que evita en gran medida o enmascaramento da súa heteroxeneidade ao tomar a media de todas as células.

Non obstante, algunhas células non son adecuadas para converterse en suspensión unicélula, polo que se necesitan outros métodos de preparación de mostras: a extracción do núcleo dos tecidos, é dicir, o núcleo extrae directamente dos tecidos ou células e prepárase en suspensión dun só núcleo para un único núcleo. secuenciación celular.

BMK ofrece un servizo de secuenciación de ARN unicelular baseado en Genomics ChromiumTM 10 veces.Este servizo foi moi utilizado en estudos sobre estudos relacionados con enfermidades, como a diferenciación de células inmunitarias, a heteroxeneidade do tumor, o desenvolvemento de tecidos, etc.

Chip de transcriptoma espacial: 10× Genómica

Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq

Contacta connosco

Detalles do servizo

Bioinformática

Resultados da demostración

Principio técnico

O illamento dos núcleos conséguese mediante 10× Genomics ChromiumTM, que consiste en un sistema microfluídico de oito canles con dobres cruzamentos.Neste sistema, unhas esferas de xel con códigos de barras e imprimación, encimas e un só núcleo están encapsulados nunha gota de aceite do tamaño dun nanolitro, xerando Gel Bead-in-Emulsion (GEM).Unha vez que se forman os GEM, realízase a lise celular e a liberación de códigos de barras en cada GEM.O ARNm transcríbense inversamente en moléculas de ADNc con códigos de barras 10× e UMI, que están ademais suxeitos á construción de bibliotecas de secuenciación estándar.

O tecido non é apto para a preparación dunha suspensión celular

Célula/Tecido	Razón
Tecido conxelado non fresco	Non se poden obter organizacións novas ou gardadas desde hai moito tempo
Célula muscular, megacariocito, graxa...	O diámetro da cela é demasiado grande para entrar no instrumento
Fígado…	Demasiado fráxil para romper, incapaz de distinguir células individuais
Célula neuronal, cerebro...	Máis sensible, fácil de estresar, cambiará os resultados da secuenciación
Páncreas, Tiroides...	Rico en enzimas endóxenas, que afectan á produción de suspensión celular única

Núcleo único vs

Un único núcleo	Monocélula
Diámetro celular ilimitado	Diámetro celular: 10-40 μm
O material pode ser tecido conxelado	O material debe ser tecido fresco
Baixo estrés das células conxeladas	O tratamento con enzimas pode provocar reaccións de estrés celular
Non é necesario eliminar glóbulos vermellos	Os glóbulos vermellos deben ser eliminados
Nuclear expresa bioinformación	Toda a célula expresa bioinformación