Secuenciación de bisulfito de representación reducida (RRBS)
Especificacións do servizo
Plataforma: plataforma NovaSeq, PE150
Tipo de biblioteca: biblioteca de ADN tratada con bisulfito de inserción de 200-400 pb
Estratexia de secuenciación: Paired-End 150 pb
Saída de datos recomendada: 10 Gb de datos brutos/mostra
Requisitos de mostra
Cantidade de ADN: ≥ 2 ug
Concentración de ADN: ≥ 20 ng/μl.
Pureza: OD260/280 = 1,8 a 2,0 sen degradación ou contaminación por ARN
Análise bioinformática
Fluxo de traballo do servizo
Entrega da mostra
Construción da biblioteca
Secuenciación
Análise de datos
Servizos posvenda
a.Estatísticas de aliñamento do xenoma de referencia
Estatística de lecturas de mapeo
Sestatísticas de profundidade de secuenciación e cobertura do sitio C
Acobertura acumulada
Deficiencia de dixestión de cada mostra
b.Detección de sitios de metilación
Lista de niveis de metilación no sitio C
Bconversión S
Mcitosina etilada
Distribución do nivel de metilación
c.Mapa de metilación
Gen todo o enoma
Gelemento enoma
d.Comparación dos niveis de metilación entre mostras
PAirwise Correlación da metilación do CG
PMetilación CA-CG
Cbrillo da metilación CG
d.Análise de metilación diferencial
Sestatísticas de DMR
Distribución de lonxitudes DMR
Hcomer mapa
DDistribución de MR na rexión de destino
