-
BSA
A plataforma de análise de segregación masiva consta dunha análise estándar dun paso e unha análise avanzada cunha configuración de parámetros personalizada.BSA é unha técnica empregada para identificar rapidamente marcadores xenéticos asociados ao fenotipo.O fluxo de traballo principal de BSA contén: 1. seleccionar dous grupos de individuos con fenotipos extremadamente opostos;2. xuntar o ADN, ARN ou SLAF-seq (desenvolvido por Biomarker) de todos os individuos para formar dúas masas de ADN;3. identificar secuencias diferenciais contra o xenoma de referencia ou entre elas, 4. predicir rexións candidatas ligadas mediante o algoritmo de índice ED e SNP;5. Análise funcional e enriquecemento de xenes en rexións candidatas, etc. Tamén están dispoñibles minería máis avanzada en datos, incluíndo a selección de marcadores xenéticos e o deseño de cebadores.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
A plataforma Amplicon (16S/18S/ITS) desenvólvese con anos de experiencia na análise de proxectos de diversidade microbiana, que contén análise básica estandarizada e análise personalizada: a análise básica abrangue o contido da análise principal da investigación microbiana actual, o contido da análise é rico e completo, e os resultados da análise preséntanse en forma de informes de proxectos;O contido da análise personalizada é diverso.As mostras pódense seleccionar e os parámetros pódense establecer de forma flexible segundo o informe de análise básico e o propósito da investigación, para realizar requisitos personalizados.Sistema operativo Windows, sinxelo e rápido.
-
Xenética evolutiva
A xenética evolutiva é un servizo de secuenciación completo deseñado para ofrecer unha interpretación completa da información evolutiva de materiais determinados baseada en variacións xenéticas, incluíndo SNP, InDels, SV e CNV.Ofrece todas as análises fundamentais necesarias para describir os cambios evolutivos e as características xenéticas das poboacións, como a estrutura da poboación, a diversidade xenética, as relacións filoxenéticas, etc. Tamén contén estudos sobre o fluxo xenético, que permite a estimación do tamaño efectivo da poboación e do tempo de diverxencia.
-
Xenómica comparada
A xenómica comparada significa literalmente comparar as secuencias e estruturas xenómicas completas de diferentes especies.Esta disciplina ten como obxectivo revelar a evolución das especies, a función dos xenes, o mecanismo regulador dos xenes a nivel do xenoma identificando as estruturas de secuencias e os elementos que se conservaron ou se diferenciaron en diferentes especies.O estudo típico de xenómica comparativa inclúe análises en familia de xenes, desenvolvemento evolutivo, duplicación do xenoma completo, presión selectiva, etc.
-
Xenética evolutiva
A plataforma de análise xenética poboacional e evolutiva establécese sobre a base da enorme experiencia acumulada no equipo de I+D de BMK durante anos.É unha ferramenta fácil de usar especialmente para investigadores que non se especializan en bioinformática.Esta plataforma permite análises básicas relacionadas coa xenética evolutiva básica, incluíndo a construción de árbores filoxenéticas, análise de desequilibrio de enlaces, avaliación da diversidade xenética, análise de varrido selectivo, análise de parentesco, PCA, análise da estrutura da poboación, etc.
-
Asemblea xenómica baseada en Hi-C
Hi-C é un método deseñado para capturar a configuración cromosómica combinando interaccións baseadas na sondaxe de proximidade e secuenciación de alto rendemento.Crese que a intensidade destas interaccións está correlacionada negativamente coa distancia física nos cromosomas.Polo tanto, os datos Hi-C poderían guiar a agrupación, ordenación e orientación de secuencias ensambladas nun xenoma borrador e ancoralas nun determinado número de cromosomas.Esta tecnoloxía potencia un conxunto de xenomas a nivel cromosómico en ausencia dun mapa xenético baseado na poboación.Cada xenoma necesita un Hi-C.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq / DNBSEQ
-
Plant/Animal De Novo Genome Sequencing
De NovoA secuenciación refírese á construción do xenoma completo dunha especie mediante tecnoloxías de secuenciación, por exemplo, PacBio, Nanopore, NGS, etc., en ausencia dun xenoma de referencia.A notable mellora na lonxitude de lectura das tecnoloxías de secuenciación de terceira xeración trouxo novas oportunidades na ensamblaxe de xenomas complexos, como aqueles con alta heterocigosidade, alta proporción de rexións repetitivas, poliploides, etc. Con lonxitude de lectura a nivel de decenas de quilobases, estas lecturas de secuenciación permiten resolución de elementos repetitivos, rexións con contidos anormais de GC e outras rexións moi complexas.
Plataforma: PacBio Sequel II/Nanopore PromethION P48/Illumina NovaSeq Platform
-
Secuenciación do exoma total humano
A secuenciación do exoma completo (WES) considérase unha estratexia de secuenciación rendible para identificar mutacións que causan enfermidades.Aínda que os exóns só ocupan aproximadamente o 1,7% de todo o xenoma, representa directamente o perfil das funcións das proteínas totais.No xenoma humano, informouse de que máis do 85% das mutacións relacionadas coa enfermidade ocorren na rexión codificante das proteínas.
BMKGENE ofrece servizos completos e flexibles de secuenciación de exomas humanos completos con diferentes estratexias de captura de exóns dispoñibles para cumprir varios obxectivos de investigación.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
-
Secuenciación de fragmentos amplificados de locus específicos (SLAF-Seq)
O xenotipado de alto rendemento, especialmente na poboación a gran escala, é un paso fundamental nos estudos de asociación xenética, que proporciona unha base xenética para o descubrimento de xenes funcionais, a análise evolutiva, etc. ) introdúcese para minimizar o custo de secuenciación por mostra, mantendo unha eficiencia razoable no descubrimento de marcadores xenéticos.Isto conséguese habitualmente extraendo fragmentos de restrición dentro do intervalo de tamaño determinado, que se denomina biblioteca de representación reducida (RRL).A secuenciación de fragmentos amplificados de locus específicos (SLAF-Seq) é unha estratexia desenvolvida por si mesmo para o xenotipado de SNP con ou sen xenoma de referencia.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq -
Illumina e BGI
A tecnoloxía de secuenciación Illumina, baseada na Secuenciación por Síntese (SBS), é unha innovación de NGS adoptada a nivel mundial, responsable de xerar máis do 90% dos datos de secuenciación do mundo.O principio de SBS implica a obtención de imaxes de terminadores reversibles marcados con fluorescencia a medida que se engade cada dNTP, e posteriormente escindida para permitir a incorporación da seguinte base.Cos catro dNTP reversibles unidos ao terminador presentes en cada ciclo de secuenciación, a competencia natural minimiza o sesgo de incorporación.Esta tecnoloxía versátil admite bibliotecas de lectura única e de pares, atendendo a unha variedade de aplicacións xenómicas.As capacidades de alto rendemento e a precisión da secuenciación de Illumina sitúana como pedra angular na investigación xenómica, o que permite aos científicos desentrañar as complejidades dos xenomas cun detalle e unha eficiencia inigualables.
DNBSEQ, desenvolvido por BGI, é outra tecnoloxía NGS innovadora que conseguiu diminuír aínda máis os custos de secuenciación e aumentar o rendemento.A preparación das bibliotecas DNBSEQ implica a fragmentación do ADN, a preparación de ssDNA e a amplificación do círculo rodante para obter as nanobolas de ADN (DNB).Estes son entón cargados nunha superficie sólida e posteriormente secuenciados mediante a síntese combinatoria de sonda-áncora (cPAS).
O noso servizo de secuenciación de bibliotecas prefabricados facilita aos clientes a preparación das súas bibliotecas de secuenciación a partir de fontes diversas (ARNm, xenoma completo, amplicón, entre outras).Posteriormente, estas bibliotecas pódense enviar aos nosos centros de secuenciación para o control de calidade e a secuenciación en plataformas Illumina ou BGI.
