-
Secuenciación de inmunoprecipitación de cromatina (ChIP-seq)
ChIP-Seq proporciona un perfil de todo o xenoma de dianas de ADN para a modificación de histonas, factores de transcrición e outras proteínas asociadas ao ADN.Combina a selectividade da inmunoprecipitación da cromatina (ChIP) para recuperar complexos proteína-ADN específicos, co poder da secuenciación de próxima xeración (NGS) para a secuenciación de alto rendemento do ADN recuperado.Ademais, debido a que os complexos proteína-ADN son recuperados de células vivas, os sitios de unión pódense comparar en diferentes tipos celulares e tecidos, ou en diferentes condicións.As aplicacións van desde a regulación transcripcional ata as vías de desenvolvemento ata os mecanismos da enfermidade e máis aló.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
-
Secuenciación metaxenómica -NGS
Metaxenoma refírese a unha colección de material xenético total dunha comunidade mixta de organismos, como o metaxenoma ambiental, o metaxenoma humano, etc. Contén xenomas de microorganismos cultivables e non cultivables.A secuenciación metaxenómica é unha ferramenta molecular utilizada para analizar os materiais xenómicos mixtos extraídos de mostras ambientais, que proporciona información detallada sobre a diversidade e abundancia de especies, a estrutura da poboación, a relación filoxenética, os xenes funcionais e a rede de correlación cos factores ambientais.
Plataforma:Plataforma Illumina NovaSeq
-
Secuenciación metagenómica-Nanoporo
A metaxenómica é unha ferramenta molecular utilizada para analizar os materiais xenómicos mixtos extraídos de mostras ambientais, que proporciona información detallada sobre diversidade e abundancia de especies, estrutura da poboación, relación filoxenética, xenes funcionais e rede de correlación con factores ambientais, etc. Recentemente presentáronse plataformas de secuenciación de nanoporos. aos estudos metaxenómicos.O seu excelente rendemento en lonxitude de lectura mellorou en gran medida a análise metaxenómica en curso abaixo, especialmente a montaxe do metaxenoma.Aproveitando as vantaxes da lonxitude de lectura, o estudo metaxenómico baseado en Nanopore é capaz de lograr unha montaxe máis continua en comparación coa metaxenómica de escopeta.Publicouse que a metaxenómica baseada en Nanopore xerou con éxito xenomas bacterianos completos e pechados a partir de microbiomas (Moss, EL, et. al.Nature Biotech, 2020)
Plataforma:Nanopore PromethION P48
-
Secuenciación de bisulfitos do xenoma completo
A metilación do ADN na quinta posición na citosina (5-mC) ten unha influencia fundamental na expresión dos xenes e na actividade celular.Os patróns de metilación anormais asociáronse con varias condicións e enfermidades, como o cancro.WGBS converteuse no patrón de ouro para estudar a metilación de todo o xenoma con resolución de base única.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
-
Ensaio de cromatina accesible á transposase con secuenciación de alto rendemento (ATAC-seq)
ATAC-seq é un método de secuenciación de alto rendemento para a análise da accesibilidade da cromatina en todo o xenoma, que é importante para o control epixenético global da expresión xénica.Os adaptadores de secuenciación insírense en rexións abertas de cromatina mediante a transposase Tn5 hiperactiva.Despois da amplificación por PCR, constrúese unha biblioteca de secuenciación.Todas as rexións abertas de cromatina pódense obter baixo unhas condicións espazo-temporais específicas, non só limitadas aos sitios de unión dun factor de transcrición ou a unha determinada rexión modificada por histonas.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
A subunidade do ARNr 16S e 18S que contén rexións altamente conservadas e hipervariables é unha pegada molecular perfecta para a identificación de organismos procariotas e eucariotas.Aproveitando a secuenciación, estes amplicóns pódense orientar en función das partes conservadas e as rexións hipervariables poden caracterizarse totalmente para a identificación microbiana, contribuíndo a estudos que abranguen a análise da diversidade microbiana, a taxonomía, a filoxenia, etc. Molécula única en tempo real (SMRT). ) a secuenciación da plataforma PacBio permite obter lecturas longas de alta precisión, que poderían cubrir amplicóns de lonxitude total (aprox. 1,5 Kb).A visión máis ampla do campo xenético mellorou moito a resolución na anotación de especies na comunidade de bacterias ou fungos.
Plataforma:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
A secuenciación de amplicóns 16S/18S/ITS ten como obxectivo revelar a filoxenia, a taxonomía e a abundancia de especies nunha comunidade microbiana mediante a investigación de produtos de PCR de marcadores xenéticos domésticos que conteñen partes moi conversadas e hipervariables.A introdución destas pegadas moleculares perfectas por Woeses et al, (1977) potencia o perfil do microbioma sen illamento.A secuenciación do 16S (bacterias), 18S (fungos) e do espaciador interno transcrito (ITS, fungos) permite a identificación tanto de especies abundantes como de especies raras e non identificadas.Esta tecnoloxía converteuse nunha ferramenta amplamente aplicada e importante para identificar a composición microbiana diferencial en diversos ambientes, como boca humana, intestinos, feces, etc.
Plataforma:Plataforma Illumina NovaSeq
-
Re-secuenciación do xenoma total de bacterias e fungos
A resecuenciación do xenoma completo de bacterias e fungos é unha ferramenta fundamental para completar os xenomas de bacterias e fungos coñecidos, así como para comparar varios xenomas ou mapear xenomas de novos organismos.É de gran importancia secuenciar xenomas completos de bacterias e fungos para xerar xenomas de referencia precisos, facer identificación microbiana e outros estudos comparativos do xenoma.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
-
PacBio-Secuenciación de amplicones 16S/18S/ITS de lonxitude completa
A plataforma Amplicon (16S/18S/ITS) desenvólvese con anos de experiencia na análise de proxectos de diversidade microbiana, que contén análise básica estandarizada e análise personalizada: a análise básica abrangue o contido da análise principal da investigación microbiana actual, o contido da análise é rico e completo, e os resultados da análise preséntanse en forma de informes de proxectos;O contido da análise personalizada é diverso.As mostras pódense seleccionar e os parámetros pódense establecer de forma flexible segundo o informe de análise básico e o propósito da investigación, para realizar requisitos personalizados.Sistema operativo Windows, sinxelo e rápido.
-
PacBio-Full-length Transcriptome (non referencia)
Tomando datos de secuenciación de isoformas de Pacific Biosciences (PacBio) como entrada, esta aplicación é capaz de identificar secuencias de transcrición completa (sen montaxe).Ao mapear secuencias de lonxitude completa contra o xenoma de referencia, as transcricións pódense optimizar mediante xenes coñecidos, transcricións, rexións codificantes, etc. Neste caso, pódese conseguir unha identificación máis precisa das estruturas do ARNm, como splicing alternativo, etc.A análise conxunta cos datos de secuenciación do transcriptoma de NGS permite unha anotación máis completa e unha cuantificación máis precisa da expresión a nivel de transcrición, o que beneficia en gran medida á expresión diferencial e á análise funcional posterior.
-
Secuenciación de bisulfito de representación reducida (RRBS)
A investigación da metilación do ADN sempre foi un tema candente na investigación de enfermidades, e está moi relacionada coa expresión dos xenes e os trazos fenotípicos.RRBS é un método preciso, eficiente e económico para a investigación da metilación do ADN.O enriquecemento das rexións insulares do promotor e CpG por escisión enzimática (Msp I), combinado coa secuenciación de bisulfito, proporciona a detección da metilación do ADN de alta resolución.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
-
Secuenciación de ARNm procariotas
A secuenciación do ARNm permite o perfil completo de todos os transcritos de ARNm dentro das células en condicións específicas.Esta tecnoloxía de vangarda serve como unha potente ferramenta, revelando perfís de expresión xénica complexos, estruturas xenéticas e mecanismos moleculares asociados a diversos procesos biolóxicos.Amplamente adoptada na investigación fundamental, diagnóstico clínico e desenvolvemento de fármacos, a secuenciación de ARNm ofrece información sobre as complejidades da dinámica celular e da regulación xenética.O noso procesamento de mostras de ARNm procariotas está adaptado para transcriptomas procariotas, que implica o esgotamento do ARNr e a preparación de bibliotecas direccionais.
Plataforma: Illumina NovaSeq X
