-
Secuenciación metaxenómica -NGS
Metaxenoma refírese a unha colección de material xenético total dunha comunidade mixta de organismos, como o metaxenoma ambiental, o metaxenoma humano, etc. Contén xenomas de microorganismos cultivables e non cultivables.A secuenciación metaxenómica é unha ferramenta molecular utilizada para analizar os materiais xenómicos mixtos extraídos de mostras ambientais, que proporciona información detallada sobre a diversidade e abundancia de especies, a estrutura da poboación, a relación filoxenética, os xenes funcionais e a rede de correlación cos factores ambientais.
Plataforma:Plataforma Illumina NovaSeq
-
Secuenciación metagenómica-Nanoporo
A metaxenómica é unha ferramenta molecular utilizada para analizar os materiais xenómicos mixtos extraídos de mostras ambientais, que proporciona información detallada sobre diversidade e abundancia de especies, estrutura da poboación, relación filoxenética, xenes funcionais e rede de correlación con factores ambientais, etc. Recentemente presentáronse plataformas de secuenciación de nanoporos. aos estudos metaxenómicos.O seu excelente rendemento en lonxitude de lectura mellorou en gran medida a análise metaxenómica en curso abaixo, especialmente a montaxe do metaxenoma.Aproveitando as vantaxes da lonxitude de lectura, o estudo metaxenómico baseado en Nanopore é capaz de lograr unha montaxe máis continua en comparación coa metaxenómica de escopeta.Publicouse que a metaxenómica baseada en Nanopore xerou con éxito xenomas bacterianos completos e pechados a partir de microbiomas (Moss, EL, et. al.Nature Biotech, 2020)
Plataforma:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
A subunidade do ARNr 16S e 18S que contén rexións altamente conservadas e hipervariables é unha pegada molecular perfecta para a identificación de organismos procariotas e eucariotas.Aproveitando a secuenciación, estes amplicóns pódense orientar en función das partes conservadas e as rexións hipervariables poden caracterizarse totalmente para a identificación microbiana, contribuíndo a estudos que abranguen a análise da diversidade microbiana, a taxonomía, a filoxenia, etc. Molécula única en tempo real (SMRT). ) a secuenciación da plataforma PacBio permite obter lecturas longas de alta precisión, que poderían cubrir amplicóns de lonxitude total (aprox. 1,5 Kb).A visión máis ampla do campo xenético mellorou moito a resolución na anotación de especies na comunidade de bacterias ou fungos.
Plataforma:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
A secuenciación de amplicóns 16S/18S/ITS ten como obxectivo revelar a filoxenia, a taxonomía e a abundancia de especies nunha comunidade microbiana mediante a investigación de produtos de PCR de marcadores xenéticos domésticos que conteñen partes moi conversadas e hipervariables.A introdución destas pegadas moleculares perfectas por Woeses et al, (1977) potencia o perfil do microbioma sen illamento.A secuenciación do 16S (bacterias), 18S (fungos) e do espaciador interno transcrito (ITS, fungos) permite a identificación tanto de especies abundantes como de especies raras e non identificadas.Esta tecnoloxía converteuse nunha ferramenta amplamente aplicada e importante para identificar a composición microbiana diferencial en diversos ambientes, como boca humana, intestinos, feces, etc.
Plataforma:Plataforma Illumina NovaSeq
-
Re-secuenciación do xenoma total de bacterias e fungos
A resecuenciación do xenoma completo de bacterias e fungos é unha ferramenta fundamental para completar os xenomas de bacterias e fungos coñecidos, así como para comparar varios xenomas ou mapear xenomas de novos organismos.É de gran importancia secuenciar xenomas completos de bacterias e fungos para xerar xenomas de referencia precisos, facer identificación microbiana e outros estudos comparativos do xenoma.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
-
Secuenciación de metatranscriptomas
A secuenciación do metatranscriptoma identifica a expresión xénica de microbios (tanto eucariotas como procariotas) dentro de ambientes naturais (é dicir, solo, auga, mar, feces e intestino). En concreto, este servizo permítelle obter un perfil de expresión xénica completa de comunidades microbianas complexas, análise taxonómica. de especies, análise de enriquecemento funcional de xenes expresados de forma diferente e moito máis.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
-
Xenoma de fungos
Biomarker Technologies proporciona estudos do xenoma, xenoma fino e xenoma completo de fungos dependendo do obxectivo específico da investigación.A secuenciación, a ensamblaxe e a anotación funcional do xenoma pódense conseguir combinando a secuenciación de próxima xeración + a secuenciación de terceira xeración para conseguir unha ensamblaxe de xenoma de alto nivel.Tamén se pode empregar a tecnoloxía Hi-C para facilitar a ensamblaxe do xenoma a nivel cromosómico.
Plataforma:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Plataforma Illumina NovaSeq
-
Xenoma completo de bacterias
Biomarker Technologies ofrece un servizo de secuenciación na construción de xenoma completo de bacterias con brecha cero.O fluxo de traballo principal da construción do xenoma completo de bacterias inclúe a secuenciación de terceira xeración, a montaxe, a anotación funcional e a análise bioinformática avanzada que cumpren obxectivos de investigación específicos.Un perfil máis completo do xenoma das bacterias permite revelar os mecanismos fundamentais subxacentes aos seus procesos biolóxicos, o que tamén podería proporcionar unha referencia valiosa para investigacións xenómicas en especies eucariotas superiores.
Plataforma:Plataforma Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq
PacBio Sequel II
