-
Secuenciación de inmunoprecipitación de cromatina (ChIP-seq)
ChIP-Seq proporciona un perfil de todo o xenoma de dianas de ADN para a modificación de histonas, factores de transcrición e outras proteínas asociadas ao ADN.Combina a selectividade da inmunoprecipitación da cromatina (ChIP) para recuperar complexos proteína-ADN específicos, co poder da secuenciación de próxima xeración (NGS) para a secuenciación de alto rendemento do ADN recuperado.Ademais, debido a que os complexos proteína-ADN son recuperados de células vivas, os sitios de unión pódense comparar en diferentes tipos celulares e tecidos, ou en diferentes condicións.As aplicacións van desde a regulación transcripcional ata as vías de desenvolvemento ata os mecanismos da enfermidade e máis aló.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
-
Secuenciación de bisulfitos do xenoma completo
A metilación do ADN na quinta posición na citosina (5-mC) ten unha influencia fundamental na expresión dos xenes e na actividade celular.Os patróns de metilación anormais asociáronse con varias condicións e enfermidades, como o cancro.WGBS converteuse no patrón de ouro para estudar a metilación de todo o xenoma con resolución de base única.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
-
Ensaio de cromatina accesible á transposase con secuenciación de alto rendemento (ATAC-seq)
ATAC-seq é un método de secuenciación de alto rendemento para a análise da accesibilidade da cromatina en todo o xenoma, que é importante para o control epixenético global da expresión xénica.Os adaptadores de secuenciación insírense en rexións abertas de cromatina mediante a transposase Tn5 hiperactiva.Despois da amplificación por PCR, constrúese unha biblioteca de secuenciación.Todas as rexións abertas de cromatina pódense obter baixo unhas condicións espazo-temporais específicas, non só limitadas aos sitios de unión dun factor de transcrición ou a unha determinada rexión modificada por histonas.
-
Secuenciación de bisulfito de representación reducida (RRBS)
A investigación da metilación do ADN sempre foi un tema candente na investigación de enfermidades, e está moi relacionada coa expresión dos xenes e os trazos fenotípicos.RRBS é un método preciso, eficiente e económico para a investigación da metilación do ADN.O enriquecemento das rexións insulares do promotor e CpG por escisión enzimática (Msp I), combinado coa secuenciación de bisulfito, proporciona a detección da metilación do ADN de alta resolución.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
