Destacados
Neste seminario web de dúas horas, é o noso gran honor convidar a seis expertos en xenómica de cultivos.Os nosos relatores darán unha interpretación en profundidade de dous estudos xenómicos de Rye, que se publicaron recentemente enXenética da Natureza:
1. A ensamblaxe do xenoma a escala cromosómica proporciona información sobre a bioloxía, a evolución e o potencial agronómico do centeo
2. Un conxunto xenómico de alta calidade destaca as características xenómicas do centeo e os xenes de importancia agronómica
Ademais, estamos encantados de contar co científico sénior de I+D de Biomarker Technologies para compartir a súa experiencia na montaxe de novo xenoma.
Axenda
09:00 CET
Palabras de benvida
Zheng Hong-kun
Fundador e CEO de Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
Presidente da Escola de Ciencias Agrícolas Avanzadas da Universidade de Pequín
09:15h
Mellorar a mellora do centeo, o triticale e o trigo mediante o uso de secuencias do xenoma de referencia de alta calidade
Neste seminario web, o profesor Wang deunos actualizacións xerais sobre o estado actual da investigación xenómica de triticeae e demostrou o éxito e os avances dos dous traballos destacados sobre os estudos do xenoma do centeo, que se publicaron recentemente en Nature Genetics e que presentan toda a investigación. grupos liderando e contribuíndo nas obras.
09:25h
Xenomía de cereais @ IPK Gatesleben
As herbas cereais da tribo Triticeae foron unha importante fonte de alimento nas rexións temperadas, que durante moito tempo foron consideradas como un punto quente na mellora dos cultivos e na reprodución.Entre todas as especies cultivadas, esta tribo é famosa polas súas características xenómicas extremadamente complexas, incluíndo grandes tamaños de xenoma, alto contido de TEs, poliploidía, etc. Nesta sesión, o profesor Nils Stein fíxonos unha introdución xeral sobre IPK Gatesleben e o estado actual dos cereais. investigación xenómica@IPK Gatesleben.
09:35h
O ensamblaxe do xenoma a escala cromosómica proporciona información sobre a bioloxía, a evolución e o potencial agronómico do centeo
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Instituto Leibniz de Xenética Vexetal e Investigación de Plans de Cultivos (IPK)O centeo (Secale cereale L.) é un cultivo de cereal excepcionalmente resistente ao clima, utilizado extensivamente para producir variedades de trigo melloradas mediante hibridación introgresiva, e que posúe todo o repertorio de xenes necesarios para permitir a reprodución híbrida.O centeo é alógamo e só se domesticou recentemente, o que dá aos centeos cultivados acceso a un acervo xenético salvaxe diverso e explotable.Para mellorar aínda máis o potencial agronómico do centeo, producimos unha montaxe anotada a escala cromosómica do xenoma do centeo de 7,9 Mbp e validamos amplamente a súa calidade mediante un conxunto de recursos xenéticos moleculares.Demostramos as aplicacións deste recurso cunha ampla gama de investigacións.Presentamos achados sobre o illamento xenético incompleto do centeo cultivado de parentes silvestres, os mecanismos de evolución estrutural do xenoma, a resistencia a patóxenos, a tolerancia á baixa temperatura, os sistemas de control da fertilidade para a reprodución híbrida e os beneficios de rendemento das introgresións de centeo e trigo.
10:05h
Un conxunto xenómico de alta calidade destaca as características xenómicas do centeo e os xenes de importancia agronómica
O centeo é un valioso cultivo alimenticio e forraxeiro, un importante recurso xenético para a mellora do trigo e do triticale, e un material indispensable para estudos eficientes de xenómica comparativa en gramíneas.Aquí, secuenciamos o xenoma do centeo Weining, unha variedade de elite de centeo chinesa.Os contigs ensamblados (7,74 Gb) representaron o 98,47% do tamaño estimado do xenoma (7,86 Gb), cun 93,67% dos contigs (7,25 Gb) asignados a sete cromosomas.Os elementos repetitivos constituían o 90,31% do xenoma ensamblado.En comparación cos xenomas de Triticeae secuenciados previamente, os retrotransposóns de Daniela, Sumaya e Sumana mostraron unha forte expansión no centeo.Outras análises da montaxe de Weining arroxan nova luz sobre as duplicacións xenéticas de todo o xenoma e o seu impacto nos xenes da biosíntese do amidón, as organizacións físicas dos loci complexos de prolamina, as características de expresión xénica subxacentes ao trazo de cabeceira inicial e as supostas rexións cromosómicas e loci asociados á domesticación do centeo.Esta secuencia do xenoma promete acelerar os estudos xenómicos e de reprodución do centeo e dos cultivos de cereais relacionados.
10:35h
Retos, solucións e futuro para a montaxe de novo de xenoma
O xenoma de alta calidade é a base do estudo xenómico.Aínda que o rápido desenvolvemento da secuenciación e do algoritmo permitiu unha montaxe do xenoma moito máis simple e eficiente, os requisitos de precisión e integridade da ensamblaxe tamén están aumentando coa profundización dos obxectivos de investigación.Nesta charla falarei das tecnoloxías populares actuais en ensamblaxe de xenomas con varios casos exitosos e dar un ollo ao desenvolvemento futuro.
Hora de publicación: Xaneiro-08-2022