MICROBIANO
A compatibilidade bacteriana e a inmobilización con biocarbón melloraron a degradación do tebuconazol, a composición e o funcionamento do microbioma do solo
Secuenciación de amplicones 16S de lonxitude completa |PacBio HiFi |Diversidade alfa |Diversidade beta
Neste estudo, a secuenciación de amplicóns 16S de lonxitude completa por PacBio e a análise bioinformática foron proporcionadas por Biomarker Technologies.
Destacados
Bacterias degradadoras de tebuconazol inmobilizadas con biocarbón, Alcaligenes faecalis WZ-2 estudouse sobre a eficacia da biodegradación e os efectos sobre o solo contaminado con tebuconazol en comparación coa cepa de degradación libre WZ-2.
1. O WZ-2 inmobilizado con biochar mostrou unha degradación máis eficiente no tebuconazol en comparación co WZ-2 libre ao reducir a vida media do tebuconazol no solo de 18,7 días a 13,3 días.
2. O WZ-2 inmobilizado con biochar foi capaz de restaurar as actividades enzimáticas microbianas nativas do solo, incluíndo urease, deshidroxenase e invertase, etc.
3. O perfil microbiano do solo tratado con WZ-2 inmobilizado con biocarbón determinado mediante a secuenciación 16S de lonxitude total apoiaba firmemente que este sistema podería restaurar a saúde do solo mellorando a estrutura da comunidade bacteriana baixo a contaminación por tebuconazol.
Experiencia (relacionada coa secuenciación)
Agrupación: CK: Solo natural;T: solo enriquecido con tebuconazol;S: Tebuconazol contiña solo con cepa libre WZ-2;BC: Tebuconazol contiña solo con biocarbón;BCS: solo contiña tebuconazol con WZ-2 inmobilizado con biocarbón.
Mostraxe: extracción total de ADN do solo amplificada por cebadores de ADNr 16S
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) e 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),representando ADNr 16S de lonxitude completa
Plataforma de secuenciación: PacBio RS II
Estratexia de secuenciación: lecturas CCS HIFI
Análise de datos:BMKCloudAs plataformas bioinformáticas fan do peixe dourado un excelente sistema de modelos xenéticos para a fisioloxía e a evolución dos peixes.
Resultado
A estrutura da comunidade microbiana do solo determinouse mediante a secuenciación do ADNr 16S.Avaliáronse os índices de riqueza e diversidade alfa de OTU, incluíndo os índices de Chao1, Ace, Shannon e Simpson para revelar a diversidade de especies en cada sistema.Despois de 60 días de incubación, todos os índices mostraron unha tendencia similar, é dicir, o tebuconazol podería inducir a redución da riqueza e diversidade de especies no solo.Non obstante, ao engadir a cepa WZ-2, a comunidade de bacterias do solo foi parcialmente recuperada en termos de riqueza e diversidade.Observouse diferenzas limitadas entre BC, BCS e CK, o que indica que o biocarbón e o WZ-2 inmobilizado con biocarbón poderían restaurar eficazmente a saúde biolóxica do solo.
Neste estudo aplicouse o método de grupos de parellas non ponderados con medias aritméticas (UPGMA) para mostrar a diversidade beta entre os grupos.Como se mostra na seguinte figura, BC, BSC e CK compartían un patrón de composición microbiana máis similar en comparación co grupo T e S, o que indicaba ademais que a introdución de biocarbón na biorremediación de solos contaminados con tebuconazol podería facilitar en gran medida a recuperación da comunidade microbiana no solo.
Figura.Agrupación UPGMA da comunidade bacteriana a nivel de filo baixo diferentes tratamentos
Referencia
Sun, Tong, et al."A compatibilidade bacteriana e a inmobilización con biocarbón melloraron a degradación do tebuconazol, a composición e o funcionamento do microbioma do solo".Revista de materiais perigosos398 (2020): 122941.
Novidades e Destacados ten como obxectivo compartir os últimos casos exitosos con Biomarker Technologies, capturando novos logros científicos, así como técnicas destacadas aplicadas durante o estudo.
Hora de publicación: Xaneiro-08-2022