BMKCloud Log in
条形banner-03

Novas

XENOMA

Logo_de_Comunicacións_Natureza

Ensamblaxe e análise a escala cromosómica do xenoma de Miscanthus lutarioriparius de cultivos de biomasa

Secuenciación de nanoporos |Ilumina |Ola-C |secuenciación de ARN |Filoxenia

Neste estudo, Biomarker Technologies proporcionou soporte técnico na secuenciación de Nanopore, ensamblaxe de xenoma de novo, montaxe asistida por Hi-C, etc.

Resumo

Miscanthus, unha planta perenne rizomatosa, ten un gran potencial para a produción de bioenerxía pola súa alta biomasa e tolerancia ao estrés.Informamos dun conxunto cromosómico a escala deMiscanthus lutarioripariusxenoma combinando a secuenciación de Oxford Nanopore e as tecnoloxías Hi-C.O conxunto de 2,07 Gb cobre o 96,64% do xenoma, cun contig N50 de 1,71 Mb.As secuencias do centrómero e dos telómeros están ensambladas para os 19 cromosomas e o cromosoma 10, respectivamente.A orixe alotetraploide de M. lutarioriparius confírmase mediante repeticións de satélite centroméricas.A estrutura do xenoma tetraploide e varios reordenamentos cromosómicos relativos ao sorgo están claramente demostrados.Xenes duplicados en tándem deM. lutarioripariusestán enriquecidos funcionalmente non só en termos relacionados coa resposta ao estrés, senón na biosíntese da parede celular.As familias de xenes relacionadas coa resistencia ás enfermidades, a biosíntese da parede celular e o transporte de ións metálicos están moi expandidas e evolucionadas.A expansión destas familias pode ser unha base xenómica importante para a mellora de trazos notables deM. lutarioriparius.

Estatísticas clave do ensamblaxe do xenoma

noticias-1
noticias-2

Figura.Visión xeral do conxunto do xenoma de M. lutarioriparius

Novidades e Destacados ten como obxectivo compartir os últimos casos exitosos con Biomarker Technologies, capturando novos logros científicos, así como técnicas destacadas aplicadas durante o estudo.


Hora de publicación: 05-xan-2022

Envíanos a túa mensaxe: