-
Secuenciación metagenómica (NGS)
Metaxenoma refírese a unha colección de material xenético total dunha comunidade mixta de organismos, como o metaxenoma ambiental, o metaxenoma humano, etc. Contén xenomas de microorganismos cultivables e non cultivables.A secuenciación metaxenómica é unha ferramenta molecular utilizada para analizar os materiais xenómicos mixtos extraídos de mostras ambientais, que proporciona información detallada sobre a diversidade e abundancia de especies, a estrutura da poboación, a relación filoxenética, os xenes funcionais e a rede de correlación cos factores ambientais.
Plataforma:Illumina NovaSeq6000
-
Secuenciación metagenómica-Nanoporo
A metaxenómica é unha ferramenta molecular utilizada para analizar os materiais xenómicos mixtos extraídos de mostras ambientais, que proporciona información detallada sobre diversidade e abundancia de especies, estrutura da poboación, relación filoxenética, xenes funcionais e rede de correlación con factores ambientais, etc. Recentemente presentáronse plataformas de secuenciación de nanoporos. aos estudos metaxenómicos.O seu excelente rendemento en lonxitude de lectura mellorou en gran medida a análise metaxenómica en curso abaixo, especialmente a montaxe do metaxenoma.Aproveitando as vantaxes da lonxitude de lectura, o estudo metaxenómico baseado en Nanopore é capaz de lograr unha montaxe máis continua en comparación coa metaxenómica de escopeta.Publicouse que a metaxenómica baseada en Nanopore xerou con éxito xenomas bacterianos completos e pechados a partir de microbiomas (Moss, EL, et al.Nature Biotech, 2020)
Plataforma:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
A subunidade do ARNr 16S e 18S que contén rexións altamente conservadas e hipervariables é unha pegada molecular perfecta para a identificación de organismos procariotas e eucariotas.Aproveitando a secuenciación, estes amplicóns pódense orientar en función das partes conservadas e as rexións hipervariables poden caracterizarse totalmente para a identificación microbiana, contribuíndo a estudos que abranguen a análise da diversidade microbiana, a taxonomía, a filoxenia, etc. Molécula única en tempo real (SMRT). ) a secuenciación da plataforma PacBio permite obter lecturas longas de alta precisión, que poderían cubrir amplicóns de lonxitude total (aprox. 1,5 Kb).A visión máis ampla do campo xenético mellorou moito a resolución na anotación de especies na comunidade de bacterias ou fungos.
Plataforma:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
A secuenciación de amplicóns 16S/18S/ITS ten como obxectivo revelar a filoxenia, a taxonomía e a abundancia de especies nunha comunidade microbiana mediante a investigación de produtos de PCR de marcadores xenéticos domésticos que conteñen partes moi conversadas e hipervariables.A introdución destas pegadas moleculares perfectas por Woeses et al, (1977) permite a elaboración de perfiles de microbiomas sen illamento.A secuenciación do 16S (bacterias), 18S (fungos) e do espaciador interno transcrito (ITS, fungos) permite a identificación tanto de especies abundantes como de especies raras e non identificadas.Esta tecnoloxía converteuse nunha ferramenta amplamente aplicada e importante para identificar a composición microbiana diferencial en diversos ambientes, como boca humana, intestinos, feces, etc.
Plataforma:Illumina NovaSeq6000
-
Resecuenciación do xenoma total de bacterias e fungos
A resecuenciación do xenoma completo de bacterias e fungos é unha ferramenta fundamental para completar os xenomas de bacterias e fungos coñecidos, así como para comparar varios xenomas ou mapear xenomas de novos organismos.É de gran importancia secuenciar xenomas enteiros de bacterias e fungos para xerar xenomas de referencia precisos, facer a identificación microbiana e outros estudos comparativos do xenoma.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Xenoma de fungos
Biomarker Technologies proporciona estudos do xenoma, xenoma fino e xenoma completo de fungos dependendo do obxectivo específico da investigación.A secuenciación, a ensamblaxe e a anotación funcional do xenoma pódense conseguir combinando a secuenciación de próxima xeración + a secuenciación de terceira xeración para conseguir unha ensamblaxe de xenoma de alto nivel.Tamén se pode empregar a tecnoloxía Hi-C para facilitar a ensamblaxe do xenoma a nivel cromosómico.
Plataforma:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Xenoma completo de bacterias
Biomarker Technologies ofrece servizo de secuenciación na construción de xenoma completo de bacterias con brecha cero.O fluxo de traballo principal da construción do xenoma completo de bacterias inclúe a secuenciación de terceira xeración, a montaxe, a anotación funcional e a análise bioinformática avanzada que cumpren obxectivos de investigación específicos.Un perfil máis completo do xenoma das bacterias permite revelar os mecanismos fundamentais subxacentes aos seus procesos biolóxicos, o que tamén podería proporcionar unha referencia valiosa para investigacións xenómicas en especies eucariotas superiores.
Plataforma:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio Sequel II
