BMKGENE proporcionou servizos de secuenciación de transcriptoma espacial para o estudo "STEEL enables high-resolution delineation of spatiotemporal transcriptomic data", que foi publicado en Briefings in Bioinformatics.
Este estudo propuxo un algoritmo non supervisado e baseado na aprendizaxe múltiple, o Spatial Transcriptome Cell typE clustering (STEEL), que identifica dominios do transcriptoma espacial agrupando perlas que presentan perfís de expresión xenética moi similares e unha distancia espacial próxima a modo de gráficos.
Unha avaliación exhaustiva de STEEL en conxuntos de datos de transcriptómica espaciais da plataforma 10X Visium demostra que non só logra unha alta resolución para caracterizar estruturas finas do cerebro do rato, senón que tamén permite a integración de múltiples láminas de tecidos analizadas individualmente nunha máis grande.
Co avance das tecnoloxías de transcriptoma espacial, o noso método terá unha gran aplicabilidade na identificación de dominios e na reconstrución de atlas de expresión xénica.
Fai clicaquípara saber máis sobre este estudo.
Hora de publicación: 20-Oct-2023