BMKCloud Log in
条形banner-03

Produtos

Secuenciación de ADN/ARN - Secuenciador de nanoporos

A secuenciación ONT é unha tecnoloxía de secuenciación de sinal eléctrico en tempo real de molécula única baseada en nanoporos, o principio de secuenciación de cada plataforma é o mesmo.O ADN/ARN de dobre cadea unirase á proteína nanoporosa incrustada na biopelícula e desenrolarase baixo o liderado da proteína motora, baixo a acción da diferenza de voltaxe de ambos os dous lados da biopelícula, as cadeas de ADN/ARN pasan a través da proteína da canle de nanoporos nun determinado momento. taxa.Debido ás diferenzas nas propiedades químicas das diferentes bases da cadea de ADN/ARN, cando unha soa base ou molécula de ADN pasa pola canle de nanoporos, provocará o cambio de diferentes sinais eléctricos.Ao detectar e corresponder a estes sinais, pódense calcular os tipos de bases correspondentes e completar a detección en tempo real da secuencia.


Detalles do servizo

Resultado Demo

Detalles do servizo Características

Plataforma

Tamaño da biblioteca

Rendemento de datos teóricos (por cela)

Precisión de base única

Aplicacións

Nanoporo

8Kb, 10kb, 20kb, ultralongo, cDNA-PCR

70-90 Gb/celular

85-92 %

Llamada SV, De novo, Secuenciación de lonxitude completa, Iso-Seq, Anotación xenética, Detección de metilación do ADN

Vantaxes do servizo

● Máis de 5 anos de experiencia na plataforma de secuenciación PacBio con miles de proxectos pechados con varias especies.
● BMKGENE é socio oficial de Oxford Nanopore, con certificación ARN/ADN de plataforma dual.
● Existen modelos principais de secuenciadores con equipos completos e un rendemento de secuenciación suficiente.
● Baseándose na plataforma Nanopore, publicáronse máis de 10 investigacións de Denovo en animais e plantas en revistas de renome internacional.

Requisitos de mostra


Tipo de mostra

Cantidade

Concentración (Qubit ®)

Volume

Pureza

Outros

ADN xenómico

Depende da esixencia de datos

 ≥20 ng/μl

≥15 μl

OD260/280=1,7-2,2;

OD260/230≥1,5;

Pico claro a 260 nm, sen contaminación

A concentración debe medirse mediante Qubit e Qubit/Nanopore ≤ 2

ARN total

≥1,2 μg

≥100μg/μl

≥15 μl

OD260/280=1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5; sen contaminación

Valor RIN ≥7,5

 

Fluxo de traballo do servizo

preparación da mostra

Preparación da mostra

Preparación da biblioteca

Construción da biblioteca

Secuenciación

Secuenciación

Análise de datos

Análise de datos

QC de mostra

Entrega do proxecto


  • Anterior:
  • Seguinte:

  • Avaliación da calidade dos datos da mostra de ADN

    Táboa 1. Estatísticas sobre datos limpos.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    limpaN50Len

    limpaN90Len

    cleanMeanLen

    cleanMaxLen

    cleanMeanQual

    DNA_BMK01

    1.218.239

    26.37

    1.121.736

    25.90

    28.014

    15.764

    23.090

    143.181

    9

    Avaliación da calidade dos datos da mostra de ARN

    Táboa 1. Estatísticas sobre datos limpos.

    Nome de arquivo

    ID de cliente

    ReadNúm

    BaseNúm

    N50

    Lonxitude media

    Lonxitude máxima

    Puntuación media

    RNA_BMK001

    C2

    8.947.708

    4.047.230.083

    398

    452

    129.227

    Q12

    Figura 1. Distribución da lonxitude de lectura

    A3

    Figura 2. Distribución da puntuación de calidade dos datos limpos

    A4

    Figura 3. Distribución da lonxitude e da puntuación de calidade dos datos limpos

    A5

    obter unha cotización

    Escribe aquí a túa mensaxe e envíanolo

    Envíanos a túa mensaxe: