●Plataformas:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten e BGI-DNB-T7
●Modos de secuenciación:PE50, PE100, PE150, PE250
●Control de calidade das bibliotecas antes da secuenciación
●Entrega de datos de secuenciación e control de calidade:entrega de informe de control de calidade e datos en bruto en formato fastq despois de demultiplexar e filtrar as lecturas Q30.
●Versatilidade dos servizos de secuenciación:o cliente pode optar por secuenciar por carril, celda de fluxo ou cantidade de datos.
●Versatilidade das plataformas:As bibliotecas DNB pódense transferir ás plataformas Illumina
●Amplia experiencia na plataforma de secuenciación Illumina:con miles de proxectos pechados con diversas especies.
●Entrega do informe de QC de secuenciación:con métricas de calidade, precisión de datos e rendemento global do proxecto de secuenciación.
●Proceso de secuenciación madura:cun tempo de resposta curto.
●Control de Calidade Riguroso: implementamos estritos requisitos de control de calidade para garantir a entrega de resultados de alta calidade.
Cantidade de datos (X) | Concentración (qPCR/nM) | Volume |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Plataforma | Concentración (qPCR/nM) | Volume |
HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
Ademais da concentración e da cantidade total, tamén se require un patrón de pico adecuado.
Ofrécese un informe sobre a calidade da biblioteca antes da secuenciación, avaliar a cantidade da biblioteca e a fragmentación.
Táboa 1. Estatística sobre datos de secuenciación.
ID da mostra | BMKID | Lecturas cruas | Datos brutos (bp) | Lecturas limpas (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36,67 |
C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figura 1. Distribución da calidade ao longo das lecturas en cada mostra
Figura 2. Distribución do contido base
Figura 3. Distribución dos contidos lidos nos datos de secuenciación