-
PacBio-Full-length Transcriptome (non referencia)
A plataforma Amplicon (16S/18S/ITS) desenvólvese con anos de experiencia na análise de proxectos de diversidade microbiana, que contén análise básica estandarizada e análise personalizada: a análise básica abrangue o contido da análise principal da investigación microbiana actual, o contido da análise é rico e completo, e os resultados da análise preséntanse en forma de informes de proxectos;O contido da análise personalizada é diverso.As mostras pódense seleccionar e os parámetros pódense establecer de forma flexible segundo o informe de análise básico e o propósito da investigación, para realizar requisitos personalizados.Sistema operativo Windows, sinxelo e rápido.
-
PacBio-Full-length Transcriptome (non referencia)
Tomando datos de secuenciación de isoformas de Pacific Biosciences (PacBio) como entrada, esta aplicación é capaz de identificar secuencias de transcrición completa (sen montaxe).Ao mapear secuencias de lonxitude completa contra o xenoma de referencia, as transcricións pódense optimizar mediante xenes coñecidos, transcricións, rexións codificantes, etc. Neste caso, pódese conseguir unha identificación máis precisa das estruturas do ARNm, como o splicing alternativo, etc.A análise conxunta cos datos de secuenciación do transcriptoma NGS permite unha anotación máis completa e unha cuantificación máis precisa da expresión a nivel de transcrición, o que beneficia en gran medida á expresión diferencial e á análise funcional posterior.
-
Caixas de ferramentas
BMKCloud é unha plataforma bioinformática líder que ofrece unha solución única para programas xenómicos, na que os investigadores confían amplamente en varios ámbitos, incluíndo médicos, agrícolas, ambientais, etc. BMKCloud comprométese a proporcionar servizos integrados, fiables e eficientes, incluíndo plataformas e ferramentas de análise bioinformática. , recursos informáticos, bases de datos públicas, cursos en liña de bioinformática, etc. BMKCloud ten varias ferramentas bioinformáticas de uso frecuente que inclúen anotación de xenes, ferramentas xenéticas evolutivas, ARNnc, control de calidade dos datos, montaxe, aliñamento, extracción de datos, mutacións, estatísticas, xerador de figuras, secuencia análise, etc.
-
ARN pequeno
Os ARN pequenos son tipos de ARN curtos non codificantes cunha lonxitude media de 18-30 nt, incluíndo miARN, siRNA e piRNA.Estes pequenos ARNs están implicados masivamente en diversos procesos biolóxicos como a degradación do ARNm, a inhibición da tradución, a formación de heterocromatina, etc. A plataforma de análise de secuenciación consiste en análise estándar e minería de datos avanzada.Baseándose nos datos de ARN-seq, a análise estándar pode lograr a identificación e predición de miARN, a predición do xene obxectivo de miARN, a análise de anotación e expresión.A análise avanzada permite a busca e extracción personalizadas de miARN, a xeración de diagramas de Venn, o miARN e a creación de redes de xenes obxectivo.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS é unha plataforma de análise de re-secuenciación do xenoma enteira, que se desenvolve en base á rica experiencia en tecnoloxías de biomarcadores.Esta plataforma fácil de usar permite o envío rápido dun fluxo de traballo de análise integrado simplemente establecendo algúns parámetros básicos, que se adaptan aos datos de secuenciación de ADN xerados tanto desde a plataforma Illumina como na plataforma de secuenciación BGI.Esta plataforma está implantada nun servidor informático de alto rendemento, que permite unha análise de datos altamente eficiente nun tempo moi limitado.A minería de datos personalizada está dispoñible en base a análise estándar, incluíndo consulta de xenes mutados, deseño de cebadores de PCR, etc.
-
ARNm (referencia)
O transcriptoma é o vínculo entre a información xenética xenómica e o proteoma da función biolóxica.A regulación do nivel transcripcional é o modo de regulación dos organismos máis importante e máis estudado.A secuenciación do transcriptoma pode secuenciar o transcriptoma en calquera momento ou en calquera condición, cunha resolución precisa para un só nucleótido. Pode reflectir dinámicamente o nivel de transcrición xenética, identificar e cuantificar simultaneamente transcricións raras e normais e proporcionar a información estrutural de transcricións específicas de mostra.
Na actualidade, a tecnoloxía de secuenciación do transcriptoma utilizouse amplamente en agronomía, medicina e outros campos de investigación, incluíndo a regulación do desenvolvemento animal e vexetal, a adaptación ambiental, a interacción inmune, a localización de xenes, a evolución xenética de especies e a detección de enfermidades xenéticas e de tumores.
-
Metaxenómica (NGS)
Esta plataforma de análise está deseñada para a análise de datos metaxenómicos de escopeta en base a anos de experiencia.Consiste en un fluxo de traballo integrado que contén varias análises de metaxenómica que se necesitan habitualmente, incluíndo o procesamento de datos, estudos a nivel de especie, estudos a nivel de función xenética, agrupación de metaxenomas, etc. Ademais, están dispoñibles ferramentas de extracción de datos personalizadas mediante o fluxo de traballo de análise estándar, incluíndo consultas de xenes e especies. , configuración de parámetros, xeración de figuras personalizadas, etc.
-
LncRNA
Os ARN longos non codificantes (ARNlnc) son un tipo de transcricións cunha lonxitude superior a 200 nt, que non poden codificar proteínas.A evidencia acumulada suxire que é moi probable que a maioría dos lncRNA sexan funcionais.As tecnoloxías de secuenciación de alto rendemento e as ferramentas de análise bioinformática permítennos revelar secuencias de lncRNA e información de posicionamento de forma máis eficiente e lévannos a descubrir lncRNAs con funcións reguladoras cruciais.BMKCloud ten o orgullo de ofrecer aos nosos clientes unha plataforma de análise de secuenciación de lncRNA para lograr unha análise de lncRNA rápida, fiable e flexible.
-
GWAS
O estudo de asociación de todo o xenoma (GWAS) ten como obxectivo identificar variantes xenéticas (xenotipo) que se asocian con trazos específicos (fenotipo).Os estudos de GWA investigan os marcadores xenéticos que cruzan o xenoma completo dun gran número de individuos e predín asociacións xenotipo-fenotipo mediante análises estatísticas a nivel poboacional.A resecuenciación do xenoma completo pode descubrir todas as variantes xenéticas.Xunto con datos fenotípicos, o GWAS pódese procesar para identificar SNP, QTL e xenes candidatos relacionados con fenotipos, o que apoia con forza a creación moderna de animais/plantas.SLAF é unha estratexia de secuenciación do xenoma simplificada desenvolvida por si mesmo, que descobre marcadores distribuídos en todo o xenoma, SNP.Estes SNP, como marcadores xenéticos moleculares, pódense procesar para estudos de asociación con trazos dirixidos.É unha estratexia rendible para identificar trazos complexos asociados ás variacións xenéticas.
-
Nanopore Transcriptómica de lonxitude completa
As isoformas alternativas complexas e variables nos organismos son mecanismos xenéticos importantes para regular a expresión xénica e a diversidade de proteínas.A identificación precisa das estruturas de transcrición é a base para o estudo en profundidade dos patróns de regulación da expresión xénica.A plataforma de secuenciación Nanopore levou con éxito o estudo transcriptómico ao nivel de isoformas.Esta plataforma de análise está deseñada para analizar os datos de ARN-Seq xerados na plataforma Nanopore a partir do xenoma de referencia, que consegue análises cualitativas e cuantitativas tanto a nivel de xenes como de transcricións.
