-
Seicheamh RNA niuclas singilte
Tha an t-adhartas ann an glacadh cealla singilte agus dòigh togail leabharlainn fa leth a’ tighinn còmhla ri sreath àrd-threòrachadh a’ ceadachadh sgrùdaidhean faireachdainn gine air bunait cealla air cealla.Tha e a’ comasachadh mion-sgrùdadh siostam nas doimhne agus nas coileanta air àireamhan cealla iom-fhillte, anns am bi e gu ìre mhòr a’ seachnadh falach an ioma-ghnèitheachd le bhith a’ toirt cuibheasachd de na ceallan gu lèir.
Ach, chan eil cuid de cheallan freagarrach airson a bhith air an dèanamh a-steach do chasg aon-chealla, agus mar sin tha feum air dòighean ullachaidh sampall eile - toirt a-mach niuclas bho fhigheagan, is e sin, tha niuclas air a thoirt a-mach gu dìreach bho fhigheagan no cealla agus air ullachadh a-steach do chasg aon-niùclas airson aon-nuclas. seicheamh cealla.
Bidh BMK a’ toirt seachad seirbheis seicheamh RNA aon-chealla stèidhichte air 10 × Genomics ChromiumTM.Chaidh an t-seirbheis seo a chleachdadh gu farsaing ann an sgrùdaidhean air sgrùdaidhean co-cheangailte ri galair, leithid eadar-dhealachadh cheallan dìon, ioma-ghnèitheachd tumhair, leasachadh clò, msaa.
Sliseag tar-sgrìobhaidh spàsail: 10 × Genomics
Àrd-ùrlar: Àrd-ùrlar Illumina NovaSeq
-
Seicheamh genoma slàn planntrais / ainmhidhean
Tha ath-sheicheamh genome slàn, ris an canar cuideachd WGS, a’ comasachadh mùthaidhean cumanta agus tearc a nochdadh air an genoma gu lèir a’ toirt a-steach Polymorphism Nucleotide Singilte (SNP), Cur às do chuir a-steach (InDel), Atharrachadh structar (SV), agus Atharrachadh Àireamh Leth-bhreac (CNV). ).Tha SVn a’ dèanamh suas cuibhreann nas motha den bhunait atharrachaidh na SNPn agus tha buaidh nas motha aca air an genoma, aig a bheil buaidh mhòr air fàs-bheairtean beò.Tha ath-leanmhainn le leughadh fada a’ ceadachadh pìosan mòra agus atharrachaidhean iom-fhillte a chomharrachadh nas mionaidiche leis gu bheil leughaidhean fada ga dhèanamh fada nas fhasa a dhol thairis air cromosomal thairis air roinnean toinnte leithid ath-chraolaidhean tandem, roinnean làn GC / AT, agus roinnean hyper-caochlaideach.
Àrd-ùrlar: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Tar-sgrìobhadh Spàsail BMKMANU S1000
Tha transcriptomics spàsail aig fìor thoiseach ùr-ghnàthachadh saidheansail, a’ toirt cumhachd do luchd-rannsachaidh sgrùdadh a dhèanamh air pàtrain faireachdainn gine toinnte taobh a-staigh figheagan fhad ‘s a tha iad a’ gleidheadh an co-theacsa spàsail aca.Am measg diofar àrd-ùrlaran, tha BMKGene air an BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip a leasachadh, a’ bòstadhrùn leasaichtede 5µM, a’ ruighinn an raon subcellular, agus a’ comasachadhsuidheachaidhean fuasglaidh ioma-ìre.Bidh a’ chip S1000, anns a bheil timcheall air 2 mhillean spot, a’ cleachdadh microwells air an còmhdachadh le grìogagan air an luchdachadh le probes glacaidh còd-barra spàsail.Tha leabharlann cDNA, air a bheairteachadh le còdan-bàr spàsail, air ullachadh bhon chip S1000 agus air a leantainn air àrd-ùrlar Illumina NovaSeq.Bidh an cothlamadh de shamhlaichean le còd-barra spàsail agus UMIan a’ dèanamh cinnteach gu bheil an dàta a chaidh a chruthachadh ceart agus sònraichte.Tha feart sònraichte a’ chip BMKManu S1000 na laighe anns an sùbailteachd aige, a ’tabhann suidheachaidhean fuasglaidh ioma-ìre a dh’ fhaodar a ghleusadh gu grinn ri diofar fhigheagan agus ìrean mion-fhiosrachaidh.Tha an sùbailteachd seo a’ suidheachadh a’ chip mar roghainn air leth airson diofar sgrùdaidhean tar-sgrìobhaidh farsaingeachd, a’ dèanamh cinnteach gu bheil cruinneachadh spàsail mionaideach le glè bheag de dh’ fhuaim.
A’ cleachdadh chip BMKManu S1000 agus teicneòlasan tar-sgrìobhaidh spàsail eile, faodaidh luchd-rannsachaidh tuigse nas fheàrr fhaighinn air eagrachadh spàsail cheallan agus na h-eadar-obrachaidhean moileciuil iom-fhillte a tha a’ tachairt taobh a-staigh fhigheagan, a’ toirt seachad seallaidhean luachmhor air na h-innealan a tha mar bhunait air pròiseasan bith-eòlasach ann an raon farsaing de raointean, a’ gabhail a-steach oncology, neur-saidheans, bith-eòlas leasachaidh, imdhun-eòlas agus sgrùdaidhean luibh-eòlais.
Àrd-ùrlar: chip BMKManu S1000 agus Illumina NovaSeq
-
Tar-sgrìobhadh Spàsail Genomics Visium 10x
Is e teicneòlas ùr-nodha a th’ ann an transcriptomics spàsail a leigeas le luchd-rannsachaidh sgrùdadh a dhèanamh air pàtrain faireachdainn gine taobh a-staigh figheagan fhad ‘s a tha iad a’ gleidheadh an co-theacsa spàsail aca.Is e aon àrd-ùrlar cumhachdach san raon seo 10x Genomics Visium còmhla ri sreath Illumina.Tha prionnsapal 10X Visium na laighe air sliseag sònraichte le àite glacaidh ainmichte far a bheil earrannan clò air an cur.Anns an raon glacaidh seo tha spotan le còd-barra, gach fear a rèir àite sònraichte taobh a-staigh an stuth.Tha na moileciuilean RNA a chaidh a ghlacadh bhon stuth an uairsin air an ainmeachadh le aithnichearan moileciuil gun samhail (UMIs) tron phròiseas tar-sgrìobhaidh cùil.Tha na spotan còd-barra seo agus UMIan a’ comasachadh mapadh spàsail mionaideach agus tomhas abairt gine aig rùn aon-chealla.Bidh an cothlamadh de shamhlaichean le còd-barra spàsail agus UMIan a’ dèanamh cinnteach gu bheil an dàta a chaidh a chruthachadh ceart agus sònraichte.Le bhith a’ cleachdadh an teicneòlas Spatial Transcriptomics seo, faodaidh luchd-rannsachaidh tuigse nas doimhne fhaighinn air eagrachadh spàsail cheallan agus na h-eadar-obrachaidhean moileciuil iom-fhillte a tha a’ tachairt taobh a-staigh nèapraigean, a’ tabhann seallaidhean luachmhor air na h-innealan a tha mar bhunait air pròiseasan bith-eòlasach ann an grunn raointean, a’ gabhail a-steach oncology, neur-saidheans, bith-eòlas leasachaidh, imdhun-eòlas. , agus sgrùdaidhean luibh-eòlais.
Àrd-ùrlar: 10X Genomics Visium agus Illumina NovaSeq
-
Seicheamh mRNA làn-fhad-Nanopore
Fhad ‘s a tha sreath mRNA stèidhichte air NGS na inneal ioma-ghnìomhach airson tomhas abairt gine, tha a bhith an urra ri leughaidhean goirid a’ cuingealachadh cho èifeachdach sa tha e ann am mion-sgrùdaidhean tar-sgrìobhaidh iom-fhillte.Tha seicheamh Nanopore, air an làimh eile, a’ cleachdadh teicneòlas fad-leughaidh, a’ comasachadh tar-sgrìobhaidhean mRNA làn-ùine a leantainn.Tha an dòigh-obrach seo a’ comasachadh sgrùdadh coileanta air splicing eile, fusions gine, poly-adenylation, agus tomhas isoforms mRNA.
Tha sreath nanopore an urra ri comharran dealain fìor-ùine aon-moileciuil nanopore.Air a threòrachadh le pròtanan motair, bidh DNA dà-shreath a’ ceangal ri pròtanan nanopore freumhaichte ann am biofilm, a’ leigeil às fhad ‘s a tha e a’ dol tron t-sianal nanopore fo eadar-dhealachadh bholtachd.Tha na comharran dealain sònraichte air an cruthachadh le diofar bhunaitean air an t-sreath DNA air an lorg agus air an seòrsachadh ann an àm fìor, a’ comasachadh sreath nucleotide neo-mhearachdach agus leantainneach.Tha an dòigh ùr-ghnàthach seo a’ faighinn thairis air crìochan le leughadh goirid agus a’ toirt seachad àrd-ùrlar fiùghantach airson mion-sgrùdadh genomic toinnte, a’ toirt a-steach sgrùdaidhean tar-sgrìobhaidh iom-fhillte.
Àrd-ùrlar: Nanopore Promethion P48
-
Seicheamh mRNA làn-fhad -PacBio
Fhad ‘s a tha seicheamh mRNA stèidhichte air NGS na inneal ioma-ghnìomhach airson a bhith a’ tomhas faireachdainn gine, tha a bhith an urra ri leughaidhean goirid a ’cuingealachadh a bhith ga chleachdadh ann an mion-sgrùdaidhean tar-sgrìobhaidh iom-fhillte.Tha sreath PacBio (Iso-Seq), air an làimh eile, a’ cleachdadh teicneòlas fad-leughaidh, a’ comasachadh tar-sgrìobhaidhean mRNA làn-ùine a leantainn.Tha an dòigh-obrach seo a’ comasachadh sgrùdadh farsaing air splicing eile, fusions gine agus poly-adenylation ged nach e seo am prìomh roghainn airson tomhas abairt gine, air sgàth an ìre àrd de dhàta a tha a dhìth.
Tha teicneòlas sreathachaidh PacBio an urra ri seicheamh aon-molecule, fìor-ùine (SMRT), a’ toirt buannachd shònraichte ann a bhith a’ glacadh tar-sgrìobhaidhean mRNA làn-ùine.Tha an dòigh-obrach ùr-ghnàthach seo a’ toirt a-steach a bhith a’ cleachdadh stuadhan-tonn modh neoni (ZMWs), tobraichean microfabricated a leigeas le bhith a’ coimhead ann an àm fìor air gnìomhachd DNA polymerase aig àm an t-sreath.Taobh a-staigh na ZMWn sin, bidh DNA polymerase PacBio a’ co-chur sreathan co-phàirteach de DNA, a’ gineadh leughaidhean fada a tha a’ cuairteachadh tar-sgrìobhaidhean mRNA gu h-iomlan.Bidh gnìomhachd PacBio ann am modh sreathachaidh Co-aonta Cearcallach (CCS) ag àrdachadh cruinneas le bhith a’ leantainn an aon mholacile a-rithist.Tha cruinneas aig na leughaidhean HiFi a chaidh a chruthachadh an coimeas ri NGS, a’ cur tuilleadh ri mion-sgrùdadh coileanta agus earbsach air feartan tar-sgrìobhaidh iom-fhillte.Àrd-ùrlar: PacBio Sequel II
-
Sequencing mRNA eukaryotic-Illumina
Tha òrdugh mRNA a’ toirt cumhachd do phròifil coileanta a dhèanamh air a h-uile tar-sgrìobhadh mRNA taobh a-staigh cheallan fo chumhachan sònraichte.Tha an teicneòlas ùr-nodha seo a’ frithealadh mar inneal làidir, a’ nochdadh pròifilean faireachdainn gine toinnte, structaran gine, agus uidheamachdan moileciuil co-cheangailte ri pròiseasan bith-eòlasach eadar-mheasgte.Air a chleachdadh gu farsaing ann an rannsachadh bunaiteach, breithneachadh clionaigeach, agus leasachadh dhrogaichean, tha sreath mRNA a’ toirt sealladh dhuinn air iom-fhillteachd daineamaigs cealla agus riaghladh ginteil.
Àrd-ùrlar: Illumina NovaSeq X
-
Sequencing-Illumina mRNA neo-iomradh
Tha òrdugh mRNA a’ toirt cumhachd do phròifil coileanta a dhèanamh air a h-uile tar-sgrìobhadh mRNA taobh a-staigh cheallan fo chumhachan sònraichte.Tha an teicneòlas ùr-nodha seo a’ frithealadh mar inneal làidir, a’ nochdadh pròifilean faireachdainn gine toinnte, structaran gine, agus uidheamachdan moileciuil co-cheangailte ri pròiseasan bith-eòlasach eadar-mheasgte.Air a chleachdadh gu farsaing ann an rannsachadh bunaiteach, breithneachadh clionaigeach, agus leasachadh dhrogaichean, tha sreath mRNA a’ toirt sealladh dhuinn air iom-fhillteachd daineamaigs cealla agus riaghladh ginteil.
Àrd-ùrlar: Illumina NovaSeq X
-
Sreath fada neo-chòdachadh-Illumina
Tha RNAn neo-chòdachadh fada (lncRNAn) nan RNAn nas fhaide na 200 nucleotides aig a bheil glè bheag de chomas còdaidh agus a tha nan eileamaidean bunaiteach taobh a-staigh RNA neo-chòdachadh.Air a lorg anns a’ niuclas agus an cytoplasm, tha pàirt deatamach aig na RNAn sin ann an riaghladh epigenetic, tar-sgrìobhaidh, agus iar-tar-sgrìobhaidh, a’ daingneachadh cho cudromach sa tha iad ann a bhith a’ cumadh phròiseasan ceallach is moileciuil.Tha seicheamh LncRNA na inneal cumhachdach ann an eadar-dhealachadh cealla, Ontogenesis, agus galairean daonna.
Àrd-ùrlar: Illumina NovaSeq
-
Seicheamh RNA beag - Illumina
Tha moileciuilean beaga RNA (sRNA), mar as trice fo 200 nucleotides de dh'fhaid, a’ toirt a-steach microRNAs (miRNAs), RNAn eadar-theachd beaga (siRNAs), agus RNAn eadar-ghnìomhach piwi (piRNAs).Nam measg sin, tha miRNAn, timcheall air 20-24 nucleotides a dh’ fhaid, gu sònraichte sònraichte airson na prìomh dhleastanasan riaghlaidh aca ann an grunn phròiseasan cealla.Le pàtrain faireachdainn sònraichte agus ìre-ìre, tha miRNAn a’ taisbeanadh glèidhteachas àrd thar diofar ghnèithean.
Àrd-ùrlar: Illumina NovaSeq
-
seicheamh circRNA-Illumina
Is e seicheamh cearcallach RNA (circRNA-seq) ìomhaigh agus sgrùdadh a dhèanamh air RNAn cruinn, clas de mholacilean RNA a bhios a’ cruthachadh lùban dùinte mar thoradh air tachartasan splicing neo-chananach, a’ toirt barrachd seasmhachd don RNA sin.Fhad ‘s a chaidh sealltainn gu bheil cuid de circRNAn mar spongan microRNA, a’ leantainn microRNAn agus gan casg bho bhith a ’riaghladh na mRNAn targaid aca, faodaidh circRNAn eile eadar-obrachadh le pròtanan, atharrachadh faireachdainn gine, no dreuchdan a bhith aca ann am pròiseasan cealla.Tha mion-sgrùdadh abairt circRNA a’ toirt seachad seallaidhean air dreuchdan riaghlaidh nam moileciuilean sin agus an cudromachd ann an grunn phròiseasan cealla, ìrean leasachaidh, agus suidheachaidhean galair, a’ cur ri tuigse nas doimhne air iom-fhillteachd riaghladh RNA ann an co-theacsa abairt gine.
-
Sreath tar-sgrìobhaidh slàn - Illumina
Tha sreath tar-sgrìobhaidh slàn a’ tabhann dòigh-obrach coileanta airson a bhith a’ dèanamh ìomhaigh de mholacilean RNA eadar-mheasgte, a’ gabhail a-steach an dà chuid còdadh (mRNA) agus RNAn neo-chòdadh (lncRNA, circRNA, agus miRNA).Bidh an dòigh seo a’ glacadh an tar-sgrìobhadh iomlan de cheallan sònraichte aig àm sònraichte, a’ toirt cothrom airson tuigse iomlan air pròiseasan cealla.Canar cuideachd “sreath iomlan RNA,” tha e ag amas air lìonraidhean riaghlaidh toinnte fhoillseachadh aig ìre tar-sgrìobhaidh, a’ comasachadh mion-sgrùdadh domhainn leithid RNA endogenous farpaiseach (ceRNA) agus mion-sgrùdadh RNA còmhla.Tha seo a’ comharrachadh a’ chiad cheum a dh’ionnsaigh caractar gnìomh, gu sònraichte ann a bhith a’ fuasgladh nan lìonraidhean riaghlaidh anns a bheil eadar-obrachaidhean ceRNA stèidhichte air circRNA-miRNA-mRNA.
