-
Mion-sgrùdadh Comann Genome-wide
Tha sgrùdadh comann air feadh genome (GWAS) ag amas air caochlaidhean ginteil (genotype) a chomharrachadh a tha co-cheangailte ri feartan sònraichte (phenotype).Bidh sgrùdadh GWAS a’ sgrùdadh comharran ginteil a ’dol thairis air genoma iomlan de àireamh mhòr de dhaoine fa-leth agus a’ ro-innse comainn genotype-phenotype le mion-sgrùdadh staitistigeil aig ìre sluaigh.Chaidh a chleachdadh gu farsaing ann an rannsachadh air galairean daonna agus mèinneadh gine gnìomh air feartan iom-fhillte de bheathaichean no lusan.
-
Seicheamh genoma slàn planntrais / ainmhidhean
Tha ath-sheicheamh genome slàn, ris an canar cuideachd WGS, a’ comasachadh mùthaidhean cumanta agus tearc a nochdadh air an genoma gu lèir a’ toirt a-steach Polymorphism Nucleotide Singilte (SNP), Cur às do chuir a-steach (InDel), Atharrachadh structar (SV), agus Atharrachadh Àireamh Leth-bhreac (CNV). ).Tha SVn a’ dèanamh suas cuibhreann nas motha den bhunait atharrachaidh na SNPn agus tha buaidh nas motha aca air an genoma, aig a bheil buaidh mhòr air fàs-bheairtean beò.Tha ath-leanmhainn le leughadh fada a’ ceadachadh pìosan mòra agus atharrachaidhean iom-fhillte a chomharrachadh nas mionaidiche leis gu bheil leughaidhean fada ga dhèanamh fada nas fhasa a dhol thairis air cromosomal thairis air roinnean toinnte leithid ath-chraolaidhean tandem, roinnean làn GC / AT, agus roinnean hyper-caochlaideach.
Àrd-ùrlar: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Gintinneachd mean-fhàs
Tha gintinneachd mean-fhàs na sheirbheis seicheamhachaidh làn a chaidh a dhealbhadh gus mìneachadh farsaing a thoirt seachad air fiosrachadh mean-fhàs de stuthan sònraichte stèidhichte air caochlaidhean ginteil, a’ toirt a-steach SNPn, InDels, SVn agus CNVn.Tha e a 'toirt seachad a h-uile mion-sgrùdadh bunaiteach a dh' fheumar airson cunntas a thoirt air atharrachaidhean mean-fhàs agus feartan ginteil àireamhan, leithid structar sluaigh, iomadachd ginteil, dàimhean phylogeny, msaa.
-
Genomics coimeasach
Tha genomics coimeasach gu litireil a’ ciallachadh coimeas a dhèanamh eadar sreathan genome iomlan agus structaran de dhiofar ghnèithean.Tha an smachd seo ag amas air a bhith a’ nochdadh mean-fhàs gnè, gnìomh gine, uidheamachd riaghlaidh gine aig ìre genome le bhith a’ comharrachadh nan structaran sreath agus eileamaidean a ghlèidh no a dh’ eadar-dhealachadh thar diofar ghnèithean.Tha sgrùdadh genomics coimeasach àbhaisteach a’ toirt a-steach mion-sgrùdaidhean ann an teaghlach gine, leasachadh mean-fhàs, dùblachadh genoma slàn, cuideam roghnach, msaa.
-
Seanadh Genome stèidhichte air Hi-C
Is e dòigh a th’ ann an Hi-C a tha air a dhealbhadh gus rèiteachadh chromosome a ghlacadh le bhith a’ cothlamadh eadar-obrachaidhean stèidhichte air faisg air làimh agus sreath àrd-threabhaidh.Thathas a’ creidsinn gu bheil dlùth-cheangal nan eadar-obrachaidhean sin co-cheangailte gu àicheil ri astar fiosaigeach air cromosoman.Mar sin, dh’ fhaodadh dàta Hi-C stiùireadh a thoirt do chruinneachadh, òrdachadh agus stiùireadh sreathan cruinnichte ann an dreach genome agus an fheadhainn sin a cheangal air àireamh sònraichte de chromosomes.Tha an teicneòlas seo a’ toirt cumhachd do cho-chruinneachadh genoma aig ìre chromosome às aonais mapa ginteil stèidhichte air àireamh-sluaigh.Feumaidh gach genoma Hi-C.
Àrd-ùrlar: Àrd-ùrlar Illumina NovaSeq / DNBSEQ
-
Seicheamh Genome Lusan / Ainmhidhean De Novo
De Novotha seicheamhachadh a’ toirt iomradh air togail genoma gnè gu lèir a’ cleachdadh teicneòlasan sreathachaidh, me PacBio, Nanopore, NGS, msaa, às aonais genoma iomraidh.Tha an leasachadh iongantach ann am fad leughaidh de theicneòlasan sreath treas ginealach air cothroman ùra a thoirt seachad ann a bhith a’ cur ri chèile genomes iom-fhillte, leithid an fheadhainn le heterozygosity àrd, co-mheas àrd de roinnean ath-aithris, polyploids, msaa. fuasgladh eileamaidean ath-aithris, roinnean le susbaint GC neo-àbhaisteach agus roinnean eile a tha gu math toinnte.
Àrd-ùrlar: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Àrd-ùrlar Illumina NovaSeq
-
Seicheamh Duine Iomlan Exome
Tha seicheamh iomlan exome (WES) air a mheas mar ro-innleachd seicheamh cosgais-èifeachdach airson a bhith a’ comharrachadh mùthaidhean a dh’ adhbhraicheas galair.Ged nach toir exons ach mu 1.7% den genoma gu lèir, tha e a’ riochdachadh ìomhaigh gnìomhachd pròtain iomlan gu dìreach.Ann an genoma daonna, chaidh aithris gu bheil còrr air 85% de mhùthaidhean co-cheangailte ri galair a’ tachairt ann an sgìre còdaidh pròtain.
Tha BMKGENE a’ tabhann seirbheisean sreath coileanta agus sùbailte daonna iomlan le diofar ro-innleachdan glacaidh exon rim faighinn gus diofar amasan rannsachaidh a choileanadh.
Àrd-ùrlar: Àrd-ùrlar Illumina NovaSeq
-
Seicheamh bloigh Meudaichte le Locus Sònraichte (SLAF-Seq)
Tha genotyping àrd-thoradh, gu h-àraidh air àireamh-sluaigh mòr, na cheum bunaiteach ann an sgrùdaidhean co-cheangail ginteil, a tha a 'toirt seachad bunait ginteil airson lorg gine gnìomhach, mion-sgrùdadh mean-fhàs, msaa. ) air a thoirt a-steach gus cosgais sreathachaidh gach sampall a lughdachadh, fhad ‘s a chumas e èifeachdas reusanta air lorg comharran ginteil.Tha seo mar as trice air a choileanadh le bhith a’ toirt a-mach criomag cuibhreachaidh taobh a-staigh raon meud sònraichte, ris an canar leabharlann riochdachaidh lùghdaichte (RRL).Is e ro-innleachd fèin-leasaichte airson genotyping SNP le no às aonais genoma iomraidh a th’ ann an sreath criomag meudaichte le locus sònraichte (SLAF-Seq).
Àrd-ùrlar: Àrd-ùrlar Illumina NovaSeq
