BMKCloud Log in
条形 bratach-03

Naidheachdan

GENOME

Nàdar_Conaltradh_Logo

Co-chruinneachadh agus mion-sgrùdadh air sgèile chromosome air bàrr bith-thomaid Genome Miscanthus lutarioriparius

Seicheamhan nanopore |Illumina |Hi-C |RNA-sreath |Phylogeny

Anns an sgrùdadh seo, thug Biomarker Technologies seachad taic theicnigeach air sreath Nanopore, co-chruinneachadh genome de novo, co-chruinneachadh le taic Hi-C, msaa.

Abradh

Miscanthus, lus maireannach rhizomatous, le comas mòr airson cinneasachadh bith-lùth airson a bhith-thomaid àrd agus fulangas cuideam.Bidh sinn ag aithris co-chruinneachadh sgèile chromosome deMiscanthus lutarioripariusgenome le bhith a’ cothlamadh sreath Oxford Nanopore agus teicneòlasan Hi-C.Tha an co-chruinneachadh 2.07-Gb a’ còmhdach 96.64% den genoma, le contig N50 de 1.71 Mb.Tha na sreathan centromere agus telomere air an cruinneachadh airson a h-uile cromosoma 19 agus cromosoma 10, fa leth.Tha tùs Allotetraploid den M. lutarioriparius air a dhearbhadh le bhith a’ cleachdadh ath-chraolaidhean saideal centromeric.Tha structar genome tetraploid agus grunn ath-rèiteachaidhean chromosomal an coimeas ri sorghum air an sealltainn gu soilleir.Tandem ginean dùblaichte deM. lutarioripariusa tha beairteach ann an gnìomh chan ann a-mhàin a thaobh freagairt cuideam, ach biosynthesis balla cealla.Tha teaghlaichean gine co-cheangailte ri strì an aghaidh ghalaran, biosynthesis balla cealla agus còmhdhail ian meatailt air an leudachadh gu mòr agus air an leasachadh.Dh’ fhaodadh leudachadh nan teaghlaichean sin a bhith na bhunait genomic cudromach airson a bhith ag adhartachadh feartan iongantach deM. lutarioriparius.

Prìomh staitistig co-chruinneachadh genome

naidheachdan-1
naidheachdan-2

Figear.Sealladh farsaing air co-chruinneachadh genoma M. lutarioriparius

Naidheachdan agus Prìomh thachartasan ag amas air na cùisean soirbheachail as ùire a cho-roinn le Biomarker Technologies, a’ glacadh euchdan saidheansail ùr-nodha a bharrachd air dòighean follaiseach a chaidh a chuir an sàs tron ​​​​sgrùdadh.


Ùine puist: Faoilleach-05-2022

Cuir do theachdaireachd thugainn: