● Eòlas fìor mhath: Chaidh còrr air 200,000 sampall a phròiseasadh ann am BMK a ’còmhdach diofar sheòrsaichean sampall, a’ toirt a-steach cultar cealla, clò, lionn bodhaig, msaa agus còrr air 7,000 pròiseact mRNA-Seq dùinte a ’còmhdach diofar raon rannsachaidh.
● Siostam smachd càileachd teann: Bithear a’ cumail sùil gheur air prìomh phuingean smachd càileachd tro gach ceum a’ gabhail a-steach ullachadh sampall, ullachadh leabharlainn, òrdugh agus bioinformatics gus toraidhean àrd-inbhe a lìbhrigeadh.
● Ioma stòran-dàta rim faighinn airson comharrachadh gnìomh agus sgrùdaidhean beairteachaidh gus diofar amasan rannsachaidh a choileanadh.
● Seirbheisean às dèidh reic: Seirbheisean às dèidh reic dligheach airson 3 mìosan às deidh crìoch a’ phròiseict, a’ toirt a-steach leantainn phròiseactan, fuasgladh dhuilgheadasan, toraidhean Q&A, msaa.
Leabharlann | Ro-innleachd sreathach | Dàta air a mholadh | Smachd Càileachd |
Poly A beairteachadh | Illumina airson PE 150 | 6 Gb | Q30≥85% |
Nucleotides:
Conc.(ng/μl) | Suim (μg) | Purity | Ionracas |
≥20 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Pròtain cuibhrichte no gun truailleadh DNA air a nochdadh air gel. | Airson lusan: RIN≥6.5; Airson beathaichean: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; àrdachadh bun-loidhne cuingealaichte no gun a bhith ann |
Meud: Cuideam (tioram):≥1 g
* Airson clò nas lugha na 5 mg, tha sinn a’ moladh sampall clò reòta (ann an nitrogen leaghaidh) a chuir.
Crochadh cealla:Cunntas cealla = 3 × 106- 1 × 107
* Tha sinn a’ moladh lysate cealla reòta a chuir air falbh.Ma tha an cealla sin nas lugha na 5 × 105.
Samhlaidhean fuil:Meud ≥ 1 ml
Microorganism:Aifreann ≥ 1 g
Container: tiùb centrifuge 2 ml (chan eilear a’ moladh foil staoin)
Bileag sampaill: Buidheann + ath-riochdachadh me A1, A2, A3;B1, B2, B3......
Gluasad:
Bith-fiosrachadh
Eukaryotic sruth-obrach mion-sgrùdadh sreath mRNA
Bith-fiosrachadh
ØSmachd càileachd dàta amh
ØCo-thaobhadh genome iomraidh
ØMion-sgrùdadh structar tar-sgrìobhaidh
ØMeudachadh abairt
ØMion-sgrùdadh abairt eadar-dhealaichte
ØComharrachadh gnìomh agus beairteachadh
1.mRNA lùb sùghaidh dàta
2.Mion-sgrùdadh faireachdainn eadar-dhealaichte - cuilbheart bholcàno
3.Nota KEGG air DEGs
4.Seòrsachadh GO air DEGs