●Àrd-ùrlaran:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq , HiSeq X Ten agus BGI-DNB-T7
●Modhan sreathachaidh:PE50, PE100, PE150, PE250
●Smachd càileachd leabharlannan mus tèid an òrdugh
●Seicheamh lìbhrigeadh dàta agus QC:lìbhrigeadh aithisg QC agus dàta amh ann an cruth fastq às deidh a bhith a’ demultiplexing agus a ’sìoladh leughaidhean Q30.
●Iom-fhillteachd nan seirbheisean seicheamhachaidh:faodaidh an neach-ceannach roghnachadh sreath a rèir sreath, cealla sruthadh no meud dàta.
●Iom-fhillteachd àrd-ùrlaran:Faodar leabharlannan DNB a ghluasad gu àrd-ùrlaran Illumina
●Eòlas farsaing air àrd-ùrlar sreath Illumina:le mìltean de phròiseactan dùinte le diofar ghnèithean.
●Lìbhrigeadh aithisg QC sreath:le meatrach càileachd, cruinneas dàta agus coileanadh iomlan a’ phròiseict sreathachaidh.
●Pròiseas leanmhainn aibidh:le ùine tionndaidh goirid.
●Smachd càileachd teann: bidh sinn a’ cur an gnìomh riatanasan QC teann gus dèanamh cinnteach gun tèid toraidhean àrd-inbhe a lìbhrigeadh gu cunbhalach.
Meud an dàta (X) | dùmhlachd (qPCR/nM) | Toirt |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nm | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nm | ≥ 20 μl |
Àrd-ùrlar | dùmhlachd (qPCR/nM) | Toirt |
HiSeq X Deich | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1.5 nm | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1.5 nm | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1.5 nm | ≥ 25 μl |
A bharrachd air dùmhlachd agus suim iomlan, tha feum air pàtran stùc iomchaidh cuideachd.
Tha aithisg air càileachd an leabharlainn air a thoirt seachad mus tèid a chur an òrdugh, a' measadh meud an leabharlainn, agus a' briseadh sìos.
Clàr 1. Staitistigean air dàta sreathachaidh.
ID sampall | BMKID | Tha amh a' leughadh | Dàta amh (bp) | Leughadh glan (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Figear 1. Sgaoileadh càileachd an cois leughaidhean anns gach sampall
Figear 2. Sgaoileadh susbaint bunaiteach
Figear 3. Sgaoileadh susbaint leughaidh ann an dàta sreathachaidh