● Iomadh ro-innleachdan sreathachaidh rim faighinn airson diofar amasan rannsachaidh
● Bacteria genome iomlan le 0 Gap cinnteach.
● Eòlas fìor mhath ann an co-chruinneachadh genome bacteria le còrr air 10,000 genome iomlan air a chruinneachadh.
● Sgioba taic theicnigeach às dèidh reic proifeasanta a 'coileanadh feumalachdan rannsachaidh nas sònraichte.
SeicheamhRo-innleachd | Leabharlann | Càileachd cinnteach | An ùine tionndaidh tuairmseach |
Nanopore 100X + Illumina 50X | Nanopore 20K PE150 | 0 Beàrn | 30 Làithean |
PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
● Raw dàta smachd càileachd
● Co-chruinneachadh genome
● Mion-sgrùdadh co-phàirtean genome
● Nota gnìomh gine
● Mion-sgrùdadh genomic coimeasach
AirsonDNA earrannan:
Seòrsa Sampall | Suim | dùmhlachd | Purity |
DNA earrannan | > 2 g | > 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
Airson sampallan clò:
Seòrsa sampall | Làimhseachadh sampall air a mholadh | Eisimpleirean de stòradh agus lìbhrigeadh |
Bacteria | Thoir sùil air bacteria fo mhiocroscop agus cruinnich bacteria anns an ìre eas-chruthach aca Cuir a-mach cultar bacteria (anns a bheil timcheall air 3-4.5e9 ceallan) gu eppendorf 1.5 no 2 ml.(Cum air deigh) Centrifuge an tiùb airson 1 min aig 14000 g gus bacteria a chruinneachadh agus an supernatant a thoirt air falbh gu faiceallach Ròin an tiùb agus reothadh na bacteria ann an nitrigin leaghaidh airson co-dhiù 30 mionaid.Stèidhich an tiùb ann am frids -80 ℃. | Reothaich na sampallan ann an nitrigin leaghaidh airson 3-4 uairean agus stòr ann an nitrigin leaghaidh no -80 ceum gu glèidheadh fad-ùine.Tha feum air lìbhrigeadh sampall le deigh tioram. |
1.Circos de genome bacteria
2.Coding gine ro-innse
Mion-sgrùdadh genomics 3.Comparative: craobh phylogenetic