Seicheamh iomlán tras-scríofa – Illumina
Gnéithe
● Dé-leabharlann chun an tras-scríbhinn iomlán a chur in ord: ídiú rRNA agus ullmhúchán leabharlainne PE150 agus roghnú méide ina dhiaidh sin ullmhú leabharlainne SE50
● Anailís bhithfhaisnéisíochta a chríochnú ar mRNA, lncRNA, circRNA agus miRNA i dtuarascálacha bithfhaisnéise ar leith
● Comh-anailís ar gach slonn RNA sa tuairisc chomhcheangailte, lena n-áirítear anailís ar líonraí ceRNA.
Buntáistí Seirbhíse
●Anailís dhomhain ar líonraí rialála: cumasaítear anailís líonra ceRNA trí sheicheamhú comhpháirteach mRNA, lncRNA, circRNA agus miRNA agus trí shreabhadh oibre bithfhaisnéiseach uileghabhálach.
●Anótáil Chuimsitheach: bainimid úsáid as bunachair shonraí iolracha chun na Géin a Léirítear go Difreálach (DEGanna) a anótáil go feidhmiúil agus chun an anailís saibhrithe chomhfhreagrach a dhéanamh, ag soláthar léargais ar na próisis cheallacha agus mhóilíneacha is bun leis an bhfreagra tras-scríbhinne.
●Saineolas Fairsing: a bhfuil cuntas teiste acu ar os cionn 2000 tionscadal tras-scríbhinne iomlán a dhúnadh go rathúil i réimsí éagsúla taighde, tugann ár bhfoireann saibhreas taithí do gach tionscadal.
●Rialú Cáilíochta dian: cuirimid croíphointí rialaithe i bhfeidhm thar gach céim, ó ullmhú samplach agus leabharlainne go seicheamhú agus bithfhaisnéisíocht.Cinntíonn an mhonatóireacht mhionsonraithe seo go seachadtar torthaí ar ardchaighdeán go seasta.
● Anótáil Chuimsitheach: bainimid úsáid as bunachair shonraí iolracha chun na Géin a Léirítear go Difreálach (DEGanna) a anótáil go feidhmiúil agus chun an anailís saibhrithe chomhfhreagrach a dhéanamh, ag soláthar léargais ar na próisis cheallacha agus mhóilíneacha is bun leis an bhfreagra tras-scríbhinne.
●Tacaíocht Iar-Dhíolacháin: Síneann ár dtiomantas níos faide ná críochnú an tionscadail le tréimhse seirbhíse 3 mhí tar éis an díola.Le linn an ama seo, cuirimid gníomhaíochtaí leantacha tionscadail, cúnamh fabhtcheartaithe, agus seisiúin ceisteanna agus freagraí ar fáil chun dul i ngleic le haon cheisteanna a bhaineann leis na torthaí
Riachtanais Samplacha agus Seachadadh
| Leabharlann | Straitéis seicheamhaithe | Sonraí molta | Rialú Cáilíochta |
| rRNA laghdaithe | Illumina PE150 | 16 GB | Q30≥85% |
| Méid roghnaithe | Illumina SE50 | 10-20M léann |
Riachtanais Shamplacha:
Núicléatídí:
| Conc.(ng/μl) | Méid (μg) | Íonachta | Ionracas |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Éilliú próitéine nó DNA teoranta nó gan aon a thaispeáint ar fhoirmiú. | Plandaí: RIN≥6.5 Ainmhí: RIN≥7.0 5.0≥28S/18S≥1.0; ingearchló bunlíne teoranta nó gan aon |
Seachadadh Samplach Molta
Coimeádán:
Feadán lártheifneoir 2 ml (ní mholtar scragall stáin)
Lipéadú samplach: Grúpa+ a mhacasamhlú m.sh. A1, A2, A3;B1, B2, B3...
Loingsiú:
1.Dry-oighear: Ní mór samplaí a phacáil i málaí agus a chur faoi oighear tirim.
Feadáin 2.RNAstable: Is féidir samplaí RNA a thriomú i bhfeadán cobhsaíochta RNA (m.sh. RNAstable®) agus a sheoladh i dteocht an tseomra.
Sreabhadh Oibre Seirbhíse
Dearadh turgnaimh
Seachadadh samplach
eastóscadh RNA
Tógáil leabharlainne
Seicheamhú
Anailís sonraí
Seirbhísí iar-díola
Bithfhaisnéisíocht
Forbhreathnú léiriú RNA
Géinte a chuirtear in iúl go difreálach
anailís ceRNA
miRNAs in iúl go difreálach agus RNAs gaolmhara
Déan iniúchadh ar na dul chun cinn taighde atá éascaithe ag seirbhísí seicheamhaithe tras-scríbhinní iomlána BMKGene trí bhailiúchán coimeádaithe foilseachán.
Dai, Y. et al.(2022) 'Próifílí slonn cuimsitheach mRNAs, lncRNAs agus miRNAs i ngalar Kashin-Beck a aithníodh trí sheicheamhú RNA', Omics Mhóilíneach, 18(2), lgh. 154-166.doi: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. nan et al.(2022) 'Anailís tras-scríbhinní fad iomlán ar fhriotaíocht fhuar Apis cerana i Sliabh Changbai le linn tréimhse geimhridh.', Gene, 830, lgh. 146503–146503.do: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ et al.(2022) 'Tosaíocht Il-Omics-Bhunaithe ar Chomhtháthú ar Líonraí Rialaithe RNA Endogenous Iomaíoch in Ailse Scamhóg Cille Beaga: Tréithe Móilíneacha agus Iarrthóirí Drugaí', Teorainneacha in Oinceolaíocht, 12, lch.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al.(2022) 'Nochtann anailís chomhtháite ar phróifílí slonn lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA léargais nua ar mheicníochtaí féideartha mar fhreagra ar néimeatóidí fréimhe snaidhm i bpónairí', Géanómaíocht BMC, 23(1), lgh. 1–12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
Yan, Z. et al.(2022) 'Aibhsíonn seicheamhú RNA tras-iomlán iomlán na meicníochtaí móilíneacha a bhaineann le cáilíocht iargharbhaithe a chothabháil i brocailí trí ionradaíocht LED dearg', Postharvest Biology and Technology, 188, lch.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
