Baintear leithlisiú na núicléis amach le 10 × Genomics ChromiumTM, arb é atá ann córas micrfhliúitice ocht gcainéal le trasrianta dúbailte.Sa chóras seo, déantar coirníní glóthacha le barrachóid agus primer, einsímí agus núicléas amháin a chuimsiú i titim ola ar mhéid nanoliter, rud a ghineann Glóthach Bead-in-Eiblesion (GEM).Chomh luath agus a fhoirmítear GEM, déantar lysis cille agus scaoileadh barrachóid i ngach GEM.Déantar mRNA a thras-scríobh ar ais i móilíní cDNA le barrachóid 10 × agus UMI, atá faoi réir ag tógáil leabharlainne seicheamhaithe caighdeánach.
Cill / Fíochán | Cúis |
Fíochán reoite gan úr | Ní féidir eagraíochtaí úra nó fada-shábháil a fháil |
Ceall matán, meigeicaryocyte, saill… | Tá trastomhas cille ró-mhór chun dul isteach san ionstraim |
ae… | Ró-leochaileach a bhriseadh, in ann idirdhealú a dhéanamh idir cealla aonair |
Cill néaróin, inchinn… | Athróidh níos íogaire, éasca le strus, na torthaí seicheamhaithe |
briseán, thyroid… | Saibhir in einsímí endogenous, a dhéanann difear do tháirgeadh fionraí aonchealla |
Aon-núicléas | Aonchealla |
Trastomhas cille gan teorainn | Trastomhas cille: 10-40 μm |
Is féidir an t-ábhar a reoite fíocháin | Caithfidh an t-ábhar a bheith fíocháin úr |
Strus íseal de chealla reoite | D'fhéadfadh cóireáil einsím a bheith ina chúis le imoibriú strus cille |
Ní gá aon chealla fola dearga a bhaint | Ní mór cealla fola dearga a bhaint |
Cuireann núicléach bithfhaisnéis in iúl | Cuireann an chill iomlán bithfhaisnéis in iúl |
Leabharlann | Straitéis seicheamhaithe | Toirt Sonraí | Riachtanais Shamplacha | Fíochán |
Leabharlann aon núicléas géanómaíochta 10 × | Géanóm 10x -Illumina PE150 | 100,000 léann/timpeall cille.100-200 Gb | Uimhir chill: >2×105 cill conc.ag 700-1,200 cill/μL | ≥ 200 mg |
Le haghaidh tuilleadh sonraí ar threoir ullmhúcháin samplach agus sreabhadh oibre seirbhíse, bíodh leisce ort labhairt le asaineolaí BMKGENE
cnuasach 1.Spot
2.Marker léiriú raidhse léarscáil teasa cnuasaithe
Dáileadh géine 3.Maker i mbraislí éagsúla
Anailís trajectory 4.Cell / pseudotime