-
Seicheamhú Imdhíonta Chromatin (ChIP- seq)
Soláthraíonn ChIP-Seq próifíliú ar fud an ghéanóim ar spriocanna DNA le haghaidh modhnú histone, fachtóirí trascríobh, agus próitéiní eile a bhaineann le DNA.Comhcheanglaíonn sé roghnaíocht imdhíon-fhrasaíocht chromatin (ChIP) chun coimpléisc shonracha próitéin-DNA a aisghabháil, le cumhacht seicheamhú den chéad ghlúin eile (NGS) le haghaidh seicheamhú ard-thréchur an DNA aisghafa.Ina theannta sin, toisc go ndéantar na coimpléisc próitéin-DNA a aisghabháil ó chealla beo, is féidir suíomhanna ceangailteacha a chur i gcomparáid i gcineálacha cille agus fíocháin éagsúla, nó faoi choinníollacha éagsúla.Réimsíonn na hiarratais ó rialachán tras-scríbhinne go bealaí forbartha go meicníochtaí galair agus ina dhiaidh sin.
Ardán: Illumina NovaSeq Platform
-
Seicheamhú Metagenomic -NGS
Tagraíonn Metagenome do bhailiúchán d'ábhar géiniteach iomlán de phobal measctha orgánach, mar mheitigenome comhshaoil, meiteiginóim daonna, etc. Tá géanóim ann de mhiocrorgánaigh inshaothraithe agus neamhshaothraithe araon.Is uirlis mhóilíneach é seicheamhú metagenomic a úsáidtear chun anailís a dhéanamh ar na hábhair ghéanómacha measctha a bhaintear as samplaí comhshaoil, a sholáthraíonn faisnéis mhionsonraithe maidir le héagsúlacht agus raidhse speiceas, struchtúr daonra, caidreamh fylogenetic, géinte feidhmiúla agus líonra comhghaoil le fachtóirí comhshaoil.
Ardán:Ardán Illumina NovaSeq
-
Seicheamhú Metagenomic-Nanópóir
Is uirlis mhóilíneach é Metagenomics a úsáidtear chun anailís a dhéanamh ar na hábhair ghéanómacha measctha a bhaintear as samplaí comhshaoil, a sholáthraíonn faisnéis mhionsonraithe maidir le héagsúlacht agus raidhse speiceas, struchtúr daonra, caidreamh phylogenetic, géinte feidhme agus líonra comhghaoil le fachtóirí comhshaoil, etc. Tá ardáin seicheamhaithe Nanopore tugtha isteach le déanaí le staidéir mheitigenomic.Chuir a fheidhmíocht den scoth maidir le fad léite go mór le hanailís mheitigenómach síos-srutha, go háirithe cóimeáil meitigenóim.Ag baint leasa as fad léimh, tá staidéar meitigenómach bunaithe ar Nana-Pór in ann cóimeáil níos leanúnaí a bhaint amach i gcomparáid le meiteiginómaíocht gunna gráin.Foilsíodh gur éirigh le meitigenomics bunaithe ar Nanópóir géanóim iomlána agus dúnta baictéaracha a ghiniúint ó mhicribhithóim (Moss, EL, et. al,Biotech Dúlra, 2020)
Ardán:Nanopore PromethION P48
-
Seicheamh iomlán bisulfíte genome
Tá tionchar bunúsach ag meitilation DNA ag an gcúigiú suíomh i cytosine (5-mC) ar léiriú géine agus ar ghníomhaíocht cheallacha.Tá baint ag patrúin neamhghnácha meitile le roinnt riochtaí agus galair, mar ailse.Is é WGBS an caighdeán óir chun staidéar a dhéanamh ar mheitiliú ar fud an ghéanóim ag taifeach aon bhonn.
Ardán: Illumina NovaSeq Platform
-
Measúnú ar Chrómatin Inrochtana Trasposáis le Seicheamhú Ard-Tréchur (ATAC-seq)
Is modh seicheamhaithe ard-tréchur é ATAC-seq chun anailís a dhéanamh ar inrochtaineacht chromatin ar fud an ghéanóim, rud atá tábhachtach le haghaidh rialú epigenetic domhanda ar léiriú géine.Cuirtear cuibheoirí seicheamhaithe isteach i réigiúin oscailte chromatin trí transposase hipirghníomhach Tn5.Tar éis aimpliú PCR, tógtar leabharlann seicheamhaithe.Is féidir na réigiúin chromatin oscailte go léir a fháil faoi choinníoll spás-ama ar leith, ní hamháin teoranta do shuíomhanna ceangailteach fachtóir trascríobh, nó réigiún modhnaithe histone áirithe.
-
16S/18S/ITS Seicheamhú Amplicon-PacBio
Is méarlorg móilíneach foirfe é an fo-aonad ar rRNA 16S agus 18S ina bhfuil réigiúin an-chaomhnaithe agus hipear-athróg araon chun orgánaigh prócarótacha agus eocaryotic a shainaithint.Agus leas á bhaint as seicheamhú, is féidir díriú ar na haimpléisc seo bunaithe ar na codanna caomhnaithe agus is féidir na réigiúin hipearathróg a shainiú go hiomlán maidir le sainaithint mhiocróbach a chuireann le staidéir a chlúdaíonn anailís ar éagsúlacht mhiocróbach, tacsanomaíocht, fíolaigine, etc. Fíor-ama aon-mhóilín (SMRT ) cuireann seicheamhú ardán PacBio ar chumas léite fada thar a bheith cruinn a fháil, a d'fhéadfadh aimpliáin lánfhad a chlúdach (thart ar 1.5 Kb).Chuir an dearcadh leathnaithe ar an réimse géiniteach go mór le réiteach anótála speiceas i bpobal baictéir nó fungais.
Ardán:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Seicheamhú Amplicon-NGS
16S/18S/ITS is é is aidhm do sheicheamhú aimpliónna fíolaigine, tacsanomaíocht, agus flúirse speiceas a nochtadh i bpobal miocróbach trí imscrúdú a dhéanamh ar tháirgí PCR marcóirí géiniteacha coimeádta ina bhfuil codanna an-chomhtháite agus hipear-inathraithe araon.Cumasaíonn tabhairt isteach na méarloirg mhóilíneach foirfe seo le Woeses et al,(1977) próifíliú micribhithóim gan aonrú.Ligeann seicheamhú 16S (baictéir), 18S (fungais) agus spásaire tras-scríofa Inmheánach (ITS, fungais) speicis fhlúirseacha chomh maith le speicis neamhchoitianta agus neamhaitheanta a shainaithint.Tá an teicneolaíocht seo tar éis éirí ina uirlis mhór i bhfeidhm go forleathan chun comhdhéanamh miocróbach difreálach a aithint i dtimpeallachtaí éagsúla, mar shampla béal an duine, intestines, feces, etc.
Ardán:Ardán Illumina NovaSeq
-
Athsheicheamhú Géanóim Iomlán Baictéarach agus Fungal
Uirlis ríthábhachtach is ea athsheicheamhú géanóim iomláin bhaictéarach agus fhungach chun géanóim na mbaictéar agus na bhfungas aitheanta a chomhlánú, chomh maith le géanóim iolracha a chur i gcomparáid nó le géanóim na n-orgánach nua a mhapáil.Tá sé thar a bheith tábhachtach géanóim iomlána na mbaictéar agus na bhfungas a chur in ord d'fhonn géineomaí tagartha cruinne a ghiniúint, sainaithint mhiocróbach agus staidéir chomparáideacha eile ar ghéanóim a dhéanamh.
Ardán: Illumina NovaSeq Platform
-
PacBio-Fad iomlán 16S/18S/ITS Seicheamh Amplicon
Forbraítear ardán Amplicon (16S/18S/ITS) le blianta de thaithí ar anailís tionscadal éagsúlachta miocróbach, ina bhfuil anailís bhunúsach chaighdeánaithe agus anailís phearsantaithe: clúdaíonn anailís bhunúsach ábhar anailíse príomhshrutha an taighde miocróbach reatha, tá an t-ábhar anailíse saibhir agus cuimsitheach, agus cuirtear torthaí anailíse i láthair i bhfoirm tuarascálacha tionscadail;Tá ábhar na hanailíse pearsantaithe éagsúil.Is féidir samplaí a roghnú agus is féidir paraiméadair a shocrú go solúbtha de réir na tuarascála anailíse bunúsacha agus na críche taighde, chun riachtanais phearsantaithe a bhaint amach.Córas oibriúcháin Windows, simplí agus tapa.
-
Trascríobh lánfhad PacBio (Neamhthagairt)
Ag glacadh le sonraí seicheamhaithe Isoform Pacific Biosciences (PacBio) mar ionchur, tá an Feidhmchlár seo in ann seichimh tras-scríofa lánfhad a aithint (gan cóimeáil).Trí sheichimh lánfhad a mhapáil i gcoinne géanóm tagartha, is féidir athscríbhinní a bharrfheabhsú trí ghéinte aitheanta, tras-scríbhinní, réigiúin códaithe, etc. Sa chás seo, is féidir struchtúir mRNA a shainaithint níos cruinne, mar shampla splicing malartach, etc.Cumasaíonn comh-anailís le sonraí seicheamhaithe tras-traipíneacha NGS anótáil níos cuimsithí agus cainníochtú níos cruinne i slonn ag leibhéal na tras-scríofa, rud a théann chun sochair don chuid is mó le léiriú difreálach iartheachtach agus anailís fheidhmiúil.
-
Seicheamhú Déshulfite Léirithe Laghdaithe (RRBS)
Bhí taighde meitilation DNA ina ábhar te i gcónaí i dtaighde galair, agus tá dlúthbhaint aige le léiriú géine agus tréithe feinitíopúla.Is modh cruinn, éifeachtach agus eacnamaíoch é RRBS le haghaidh taighde meitilation DNA.Soláthraíonn saibhriú réigiún tionscnóra agus oileán CpG trí scoilteacht einsímeach (Msp I), in éineacht le seicheamhú Bisulfite, braite meitilation DNA ardtaifeach.
Ardán: Illumina NovaSeq Platform
-
Seicheamh mRNA procaryotic
Cumasaíonn seicheamhú mRNA próifíliú cuimsitheach a dhéanamh ar gach tras-scríbhinn mRNA laistigh de chealla faoi choinníollacha sonracha.Feidhmíonn an teicneolaíocht cheannródaíoch seo mar uirlis chumhachtach, ag nochtadh próifílí casta géine in iúl, struchtúir ghéinte, agus meicníochtaí móilíneacha a bhaineann le próisis bhitheolaíocha éagsúla.Glacadh go forleathan leis i mbuntaighde, diagnóisic chliniciúil, agus forbairt drugaí, cuireann seicheamhú mRNA léargais ar fáil ar chasta dhinimic cheallacha agus rialáil ghéiniteach.Tá ár bpróiseáil sampla mRNA prócarótach curtha in oiriúint do thras-scríbhinní prócarótacha, lena mbaineann ídiú rRNA agus ullmhúchán treo-leabharlainne.
Ardán: Illumina NovaSeq X
