BMKCloud Log in
条形meirge-03

Nuacht

T2T GENOME TIONÓL, GENOME SAOR BÁNACH

1stDhá Ghéanóim Rís1

Teideal: Cruinniú agus Bailíochtú Dhá Ghéanóm Tagartha Gan Bearna do Xian/Indica Nochtann Rice Léargais ar Ailtireacht Plant Centromere

doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073

Am Postáilte: 01 Eanáir, 2021.

Institiúid: Ollscoil Talmhaíochta Huazhong, an tSín

Ábhair

O. sativa xian/indicacineálacha ríse 'Zhenshan 97 (ZS97)' agus 'Minghui 63 (MH63)

Straitéis seicheamhaithe

Léann NGS + Léann HiFi + Léann CLR + BioNano + Hi-C

Sonraí:

ZS97: 8.34 Gb (~23x) Léann HiFi + 48.39 Gb (~131x ) Léann CLR + 25 Gb(~69x) NGS + 2 chealla BioNano Irys

MH63: 37.88 Gb (~103x) Léann HiFi + 48.97 Gb (~132x) CLR ag léamh + 28 Gb(~76x) NGS + 2 chealla BioNano Irys

Fíor-1

Fíor 1 Dhá ghéanóm ríse gan bhearna (MH63 agus ZS97)

2ndGéanóm Banana2

Teideal: Crómasóm gan bhearna Telomere-go-telomere banana ag baint úsáide as seicheamhú nana-póir

doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017

Am Postáilte: 17 Aibreán, 2021.

Institiúid: Université Paris-Saclay, An Fhrainc

Ábhair

Haploid dhúbailteMusa acuminatasppmalaccensis(DH-Pahang)

Straitéis agus sonraí seicheamhaithe:

Modh HiSeq2500 PE250 + MinION/PromethION (93Gb,~200X )+ Léarscáil optúil (DLE-1+BspQ1)

Tábla 1 Comparáid idir tionóil genome Musa acuminata (DH-Pahang).

Tábla1-Comparáid-de-GRCh38-agus-T2T-CHM13-tionóil-genome-daonna
Figiúr-Musa-genomes-ailtireacht-comparáid

Figiúr 2 Comparáid ailtireacht ghéanóim Musa

3rdGéineóm Phaeodactylum tricornutum3

Teideal: Tionól genome Telomere-to-telomere ofP
haeodactylum tricornutum

doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596

Am Postáilte: 04 Bealtaine, 2021

Institiúid: Ollscoil an Iarthair, Ceanada

Ábhair

Phaeodactylum tricornutum(Bailiúchán Cultúir Algaí agus Protozoa CCAP 1055/1)

Straitéis agus sonraí seicheamhaithe:

1 cill sreafa mionion Oxford Nanopore + aschur lár-deireadh péireáilte 2×75 NextSeq 550 rith

Fíor-Sreabhadh Oibre-do-telomere-go-telomere-genome-tionól-1-1024x740

Fíor 3 Sreabhadh oibre do thionól genome telomere-go-telomere

4thGéineóm CHM13 daonna4

Teideal: Seicheamh iomlán de ghéanóm daonna

doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798

Am Postáilte: 27 Bealtaine 2021

Institiúid: Na hInstitiúidí Náisiúnta Sláinte (NIH), SAM

Ábhair: líne chill CHM13

Straitéis agus sonraí seicheamhaithe:

Seicheamh comhdhearcadh ciorclach 30 × PacBio (HiFi), seicheamh léamh ultra-fhada 120 × Oxford Nanopore , seicheamhú 100 × Illumina PCR-Free (ILMN), 70 × Illumina / Arima Genomics Hi-C (Hi-C), léarscáileanna optúla BioNano, agus Strand-seq

Tábla 2 Comparáid idir tionóil ghéanóim daonna GRCh38 agus T2T-CHM13

Comhthionóil Tábla-Comparáid-de-Musa-acuminata-DH-Pahang-genome-

Tagairt

1.Sergey Nurk et al.Seicheamh iomlán de ghéanóm daonna.bioRxiv 2021.05.26.445798;doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798

2.Caroline Belser et al.Crómasóm gan bhearna Telomere-go-telomere banana ag baint úsáide as seicheamhú nana-póir.bioRxiv 2021.04.16.440017;doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017

3.Daniel J. Giguere et al.Comhthionól genome Telomere-go-telomere de Phaeodactylum tricornutum.bioRxiv 2021.05.04.442596;doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596

4.Jia-Ming Song et al.Dhá Ghéanóm Tagartha Gan Bearna a Chomhthionól agus a Bhailíochtú do Xian/Indica Rice Nochtann Léargas ar Ailtireacht Planda Centromere.bioRxiv 2020.12.24.424073;doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073


Am postála: Jan-06-2022

Seol do theachtaireacht chugainn: