GENOME
Cóimeáil agus anailís ar scála crómasóim ar bharr bithmhaise Miscanthus lutarioriparius genome
Seicheamhú nanapóir |Illumina |Hi-C |Seicheamhú RNA |Phylogeny
Sa staidéar seo, chuir Biomarker Technologies tacaíocht theicniúil ar fáil maidir le seicheamhú Nanopore, tionól genome de novo, tionól cúnamh Hi-C, etc.
Teibí
Miscanthus, planda ilbhliantúil rhizomatous, tá acmhainneacht mhór le haghaidh táirgeadh bithfhuinnimh mar gheall ar a lamháltas ard bithmhais agus strus.Tuairiscímid cóimeáil ar scála crómasóim deMiscanthus lutarioripariusgenome trí sheicheamhú Oxford Nanopore agus teicneolaíochtaí Hi-C a chomhcheangal.Clúdaíonn an tionól 2.07-Gb 96.64% den genome, agus contig N50 de 1.71 Mb.Cuirtear na seichimh centromere agus telomere le chéile do gach 19 crómasóim agus crómasóim 10, faoi seach.Deimhnítear bunús allotetraploid an M. lutarioriparius trí úsáid a bhaint as athchraoltaí satailít lárionadaigh.Léirítear go soiléir struchtúr géanóm tetraploid agus roinnt athshocruithe crómasómacha i gcoibhneas le sorgwm.Géinte dúblacha tandem deM. lutarioripariussaibhrítear feidhmiúil ní hamháin i dtéarmaí a bhaineann le freagairt ar strus, ach bithsintéis balla cille.Tá leathnú agus forbairt mhór tagtha ar theaghlaigh ghéine a bhaineann le friotaíocht galair, bithsintéis balla cille agus iompar ian miotail.D’fhéadfadh leathnú na dteaghlach seo a bheith ina bhunús géanómach tábhachtach chun tréithe suntasacha a fheabhsúM. lutarioriparius.
Príomhstaitisticí maidir le cóimeáil genome
Fíor.Forbhreathnú ar an tionól genome M. lutarioriparius....
Nuacht agus Buaicphointí Tá sé mar aidhm aige na cásanna rathúla is déanaí a roinnt le Biomarker Technologies, gnóthachtálacha eolaíocha úra a ghabháil chomh maith leis na teicníochtaí suntasacha a cuireadh i bhfeidhm le linn an staidéir.
Am postála: Jan-05-2022