● Réigiún Dírithe um Chódú Próitéin: trí réigiún códaithe próitéine a ghabháil agus a sheicheamhú, úsáidtear hWES chun leagan a bhaineann le struchtúr próitéine a nochtadh;
● Cruinneas Ard: le doimhneacht ard seicheamhaithe, éascaíonn hWES malairtí coitianta agus leaganacha neamhchoitianta a bhrath le minicíochtaí níos ísle ná 1%;
● Éifeachtach ó thaobh Costas: táirgeann hWES thart ar 85% de shócháin galair daonna ó 1% den ghéanóm daonna;
● Cúig nós imeachta QC dian a chlúdaíonn an próiseas iomlán agus Q30> 85% ráthaithe.
Ardán
| Leabharlann
| Straitéis Gabhála Exon
| Straitéis Seicheamhaithe a mholadh
|
Ardán Illumina NovaSeq
| PE150 | Agilent SureSelect Human All Exon V6 IDT xGen Exome Hyb Panel V2 | 5 Gb 10 Gb |
Cineál Samplach
| Méid( Qubit® )
| Toirt
| Tiúchan
| Purity(NanoDrop™) |
DNA genomic
| ≥ 300 ng | ≥ 15 μL | ≥ 20 ng/μL | OD260/280=1.8-2.0 gan aon díghrádú, gan aon éilliú
|
I gcás neamhoird Mendelian / galair neamhchoitianta: doimhneacht seicheamhaithe éifeachtach os cionn 50 ×
I gcás samplaí siadaí: doimhneacht seicheamhaithe éifeachtach os cionn 100 ×
Staitisticí 1.Alignment
Tábla 1 Staitisticí de thoradh léarscáile
Tábla 2 Staitisticí gabhála exome
Brath 2.Variation
Fíor 1 Staitisticí SNV agus InDel
Anailís 3.Advanced
Fíor 2 Plota ciorcos de SNV agus InDel díobhálach ar fud an Ghéanóim
Tábla 3 Scagadh ar ghéinte is cúis le galair