-
Seicheamhú Géanóim Gléasra/Ainmhithe
De nuatagraíonn seicheamhú do thógáil géanóm iomlán speicis ag baint úsáide as teicneolaíochtaí seicheamhaithe, m.sh. PacBio, Nanópóir, NGS, etc., in éagmais géanóm tagartha.Mar gheall ar an bhfeabhsú suntasach ar fhad léite na dteicneolaíochtaí seicheamhaithe tríú glúin tá deiseanna nua ann maidir le géanóim choimpléascacha a chur le chéile, mar iad siúd a bhfuil ard-heitrisigeachas acu, cóimheas ard de réigiúin athchleachtacha, polaplóidigh, etc. Le fad léite ag leibhéal na ndeicheanna kilobases, cumasaíonn na léann seicheamhaithe seo. gnéithe athchleachtach a réiteach, réigiúin ina bhfuil ábhar neamhghnácha GC agus réigiúin an-chasta eile.
Ardán: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq6000
-
Tionól Genome bunaithe ar Hi-C
Is modh é Hi-C atá deartha chun cumraíocht chromosóim a ghabháil trí idirghníomhaíochtaí fiafraithe bunaithe ar ghaireacht agus seicheamhú ard-thréchuir a chomhcheangal.Creidtear go bhfuil comhghaol diúltach idir déine na n-idirghníomhaíochtaí seo agus achar fisiceach ar chrómasóim.Mar sin, d’fhéadfadh sonraí Hi-C cnuasú, ordú agus treoshuíomh seicheamh cóimeáilte i ndréacht-ghéanóm a threorú agus iad siúd a dhaingniú ar líon áirithe crómasóim.Cumhachtaíonn an teicneolaíocht seo cóimeáil géanóm ar leibhéal crómasóim in éagmais léarscáile géiniteach daonra-bhunaithe.Teastaíonn Hi-C ó gach géanóm.
Ardán: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Géineolaíocht Éabhlóideach
Is seirbhís sheicheamhaithe pacáilte í géineolaíocht éabhlóideach atá deartha chun léirmhíniú cuimsitheach a sholáthar ar fhaisnéis éabhlóideach ábhar tugtha bunaithe ar éagsúlachtaí géiniteacha, lena n-áirítear SNPanna, InDels, SVanna agus CNVanna.Soláthraíonn sé gach anailís bhunúsach a theastaíonn chun cur síos a dhéanamh ar athruithe éabhlóideacha agus gnéithe géiniteacha daonraí, mar struchtúr daonra, éagsúlacht ghéiniteach, caidrimh phylogeny, etc. Tá staidéir ann freisin ar shreabhadh géine, a chumasaíonn meastachán ar mhéid daonra éifeachtach, am éagsúlachta.
-
Géanóm Chomparáideach
Ciallaíonn géanóm chomparáideach go litriúil comparáid a dhéanamh idir seichimh agus struchtúir iomlána an ghéanóim de speicis éagsúla.Tá sé mar aidhm ag an disciplín seo éabhlóid speiceas, feidhm ghéine, meicníocht rialála géine a nochtadh ar leibhéal an ghéanóim trí na struchtúir seichimh agus na heilimintí a chaomhnaigh nó a dhifreáil thar speicis éagsúla a shainaithint.Áirítear le gnáth-staidéar géanóm comparáideach anailísí i dteaghlach géine, forbairt éabhlóideach, dúbailt genome iomlán, brú roghnach, etc.
-
Anailís Bulcáilte Deighilteach
Teicníc is ea anailís dheighilteach toirtithe (BSA) a úsáidtear chun marcóirí géiniteacha a bhaineann le feinitíopa a shainaithint go tapa.Is éard atá i bpríomhshreabhadh oibre BSA ná dhá ghrúpa daoine aonair a roghnú a bhfuil feinitíopaí an-fhreasúracha acu, DNA gach duine aonair a chomhthiomsú chun dhá thromlach DNA a chruthú, ag aithint seichimh dhifreálach idir dhá linn.Baineadh leas go forleathan as an teicníc seo chun marcóirí géiniteacha a bhfuil baint láidir acu le géinte spriocdhírithe i ngéanóim plandaí/ainmhithe a shainaithint.
