Ardán | Méid na Leabharlainne | Toradh Sonraí Teoiriciúla (In aghaidh na Cille) | Cruinneas Aonair | Feidhmchláir |
Nanópóir | 8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR | 70-90Gb/Cill | 85-92% | Glaonna SV, De novo, Seicheamh lánfhad, Iso-Seq, Nóta géine, Brath meitilation DNA |
● Níos mó ná 5 bliana de thaithí ar ardán seicheamhaithe PacBio leis na mílte tionscadal dúnta le speicis éagsúla.
● Is comhpháirtí oifigiúil de chuid Oxford Nanopore é BMKGENE, le deimhniú RNA/DNA dé-ardáin.
● Tá múnlaí príomhshrutha seicheamhóirí ann le trealamh iomlán agus dóthain tréchur seicheamhaithe.
● Bunaithe ar an ardán Nanopore, tá níos mó ná 10 taighde ainmhithe agus plandaí Denovo foilsithe in irisí a bhfuil cáil idirnáisiúnta orthu.
Cineál Samplach | Méid | Tiúchan(Qubit ®) | Toirt | Íonachta | Daoine eile |
DNA genomic | Ag brath ar Riachtanas Sonraí | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.2; OD260/230≥1.5; Buaic shoiléir ag 260 nm, gan aon éilliú | Ní mór an tiúchan a thomhas le Qubit agus Qubit/Nanopore ≤ 2 |
RNA iomlán | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.5; OD260/230=0.5-2.5 ;gan aon éilliú | Luach RIN ≥7.5 |
Measúnú Cáilíochta Sonraí ar Sampla DNA
Tábla 1. Staitisticí ar shonraí glana.
BMKID | amhSeqNum | amhSumBase | glanSeqNum | glanSumBase | glanN50Len | glanN90Len | glanMeanLen | glanMaxLen | glanMeanQual |
DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
Measúnú Cáilíochta Sonraí ar Shamplach RNA
Tábla 1. Staitisticí ar shonraí glana.
Ainm comhaid | ID an Chliaint | LéamhNum | Bunuimhir | N50 | Meánfhad | Uasfhad | MeánQscore |
RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | C12 |
Fíor 1. Léigh dáileadh fad
Fíor 2. Dáileadh scór cáilíochta sonraí glan
Fíor 3. Fad agus dáileadh scór cáilíochta na sonraí glan