●Ardáin:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq , HiSeq X Ten agus BGI-DNB-T7
●Modhanna seicheamhaithe:PE50, PE100, PE150, PE250
●Rialú cáilíochta ar leabharlanna roimh sheicheamhú
●Seachadadh sonraí agus QC a sheicheamhú:seachadadh tuairisce QC agus sonraí amh i bhformáid fastq tar éis léamha C30 a dhí-ilphléacsú agus a scagadh.
●Ilghnéitheacht seirbhísí seicheamhaithe:féadfaidh an custaiméir seicheamh a dhéanamh de réir lána, sreabhadh cille nó méid sonraí.
●Ilchineálacht na n-ardán:Is féidir leabharlanna DNB a aistriú chuig ardáin Illumina
●Taithí fhairsing ar ardán seicheamhaithe Illumina:leis na mílte tionscadal dúnta le speicis éagsúla.
●Seachadadh tuarascáil QC seicheamhaithe:le méadracht cháilíochta, cruinneas sonraí agus feidhmíocht fhoriomlán an tionscadail seicheamhaithe.
●Próiseas seicheamhaithe aibí:le ham slánúcháin gearr.
●Rialú Cáilíochta dian: cuirimid ceanglais dhian QC i bhfeidhm chun seachadadh torthaí ardchaighdeáin comhsheasmhach a ráthú.
Méid na Sonraí (X) | Tiúchan (qPCR/nM) | Toirt |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nm | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nm | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nm | ≥ 20 μl |
Ardán | Tiúchan (qPCR/nM) | Toirt |
HiSeq X Deich | ≥ 2 nm | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1.5 nm | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1.5 nm | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1.5 nm | ≥ 25 μl |
Chomh maith le tiúchan agus méid iomlán, tá gá le patrún buaic oiriúnach freisin.
Cuirtear tuairisc ar cháilíocht na leabharlainne ar fáil sula ndéantar seicheamhú, measúnú ar mhéid na leabharlainne agus ar an scoilteadh.
Tábla 1. Staitisticí ar shonraí seicheamhaithe.
ID Samplach | BMKID | Léann amh | Sonraí Amha (bp) | Léamh glan (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Fíor 1. Dáileadh cáilíochta feadh léite i ngach sampla
Fíor 2. Dáileadh ábhar bonn
Fíor 3. Dáileadh an ábhair léite i sonraí seicheamhaithe