Tras-scríbhinn Spásúil Géanómaíocht 10x Visium
Gnéithe
● Taifeach: 100 µM
● Trastomhas Spota: 55 µM
● Líon na spotaí: 4992
● Limistéar gabhála: 6.5 x 6.5 mm
● Tá gach láthair barrachóidithe luchtaithe le primers comhdhéanta de 4 chuid:
- eireaball polai(dT) le haghaidh priming mRNA agus sintéis cDNA
- Aitheantóir Móilíneach Uathúil (UMI) chun laofacht aimpliúcháin a cheartú
- Barrachóid spáis
- Seicheamh ceangailteach de pháirtléamh 1 primer seicheamhaithe
● smáthú H&E na gcodanna
Buntáistí
●Seirbhís aon-stad: comhtháthaíonn sé gach céim taithí agus scil-bhunaithe, lena n-áirítear crió-ghearradh, staining, barrfheabhsú fíocháin, barrachódú spásúil, ullmhú leabharlainne, seicheamhú agus bithfhaisnéisíocht.
● Foireann theicniúil ardoilte: le taithí ar bhreis is 250 cineál fíocháin agus 100+ speiceas lena n-áirítear daoine, lucha, mamach, iasc agus plandaí.
●Nuashonrú fíor-ama ar an tionscadal iomlán: le smacht iomlán ar dhul chun cinn turgnamhach.
●Bithfhaisnéisíocht chaighdeánach chuimsitheach:Áirítear sa phacáiste 29 anailís agus 100+ figiúr ardcháilíochta.
●Anailís agus léirshamhlú sonraí saincheaptha: ar fáil le haghaidh iarratais taighde éagsúla.
●Comh-anailís roghnach le seicheamh mRNA aonchealla
Sonraíochtaí
| Riachtanais Shamplacha | Leabharlann | Straitéis seicheamhaithe | Sonraí molta | Rialú Cáilíochta |
| Samplaí cryo leabaithe OCT, samplaí FFPE (Trastomhas is fearr: thart ar 6x6x6 mm3) 3 bhloc in aghaidh an tsampla | Leabharlann 10X Visium cDNA | Illumina PE150 | Léann 50K PE in aghaidh an spota (60Gb) | RIN>7 |
Le haghaidh tuilleadh sonraí ar threoir ullmhúcháin samplach agus ar shreabhadh oibre seirbhíse, bíodh leisce ort labhairt le asaineolaí BMKGENE
Sreabhadh Oibre Seirbhíse
Sa chéim ullmhúcháin sampla, déantar triail eastósctha RNA mórchóir tosaigh chun a chinntiú gur féidir RNA ardcháilíochta a fháil.Sa chéim optamaithe fíocháin déantar na hailt a dhaite agus a léirshamhlú agus déantar na coinníollacha tréscaoilteachta maidir le scaoileadh mRNA ó fhíocháin a bharrfheabhsú.Cuirtear an prótacal optamaithe i bhfeidhm ansin le linn tógáil na leabharlainne, agus déantar seicheamhú agus anailís ar shonraí ina dhiaidh sin.
Is éard atá i gceist le sreabhadh oibre iomlán na seirbhíse ná nuashonruithe fíor-ama agus deimhnithe cliant chun lúb aiseolais sofhreagrach a choinneáil, rud a chinntíonn go gcuirfear tionscadail i gcrích go réidh.
Áirítear leis an anailís seo a leanas:
Rialú Cáilíochta Sonraí:
o Aschur sonraí agus dáileadh scór cáilíochta
o Brath géine in aghaidh an spota
o Clúdach fíocháin
Anailís samplach laistigh:
o Saibhreas géine
o Cnuasú spota, lena n-áirítear anailís toise laghdaithe
o Anailís difreálach ar léiriú idir braislí: sainaithint géinte marcála
o Anótáil feidhme agus saibhriú géinte marcála
Anailís idirghrúpa
o Athcheangail de spotaí ón dá shampla (eg. galair agus rialaithe) agus ath-chnuasach
o Géinte marcála a shainaithint do gach braisle
o Anótáil feidhme agus saibhriú géinte marcála
o Cur in iúl difreálach an bhraisle chéanna idir grúpaí
Anailís Samplach Istigh
Cnuasú spota
Sainaithint géinte marcóra agus dáileadh spásúil
Anailís Idirghrúpa
Comhcheangal sonraí ón dá ghrúpa agus ath-chnuasach
Géinte marcála de bhraislí nua
Déan iniúchadh ar na dul chun cinn atá éascaithe ag seirbhís tras-scríbhinne spásúlachta BMKGene le 10X Visium Sna foilseacháin seo a leanas:
Chen, D. et al.(2023) 'Tá mthl1, homalóg ionchasach Drosophila de GPCRanna greamaitheachta mamaigh, páirteach i bhfrithghníomhartha antitumor ar chealla oncogenic insteallta i gcuileoga', Imeachtaí Acadamh Náisiúnta Eolaíochtaí Stáit Aontaithe Mheiriceá, 120(30), lch.e2303462120.doi: /10.1073/pnas.2303462120
Chen, Y. et al.(2023) 'Cumasaíonn CRUACH sonraí tras-amaimiúla tras-ama a shainiú ardtaifigh', Briefings in Bioinformatics, 24(2), lgh. 1–10.Uimh.: 10.1093/BIB/BBAD068.
Liu, C. et al.(2022) 'Atlas spásúil d'orgánaigineas i bhforbairt bláthanna magairlíní', Taighde Aigéid Núicléacha, 50(17), lgh. 9724–9737.doi: 10.1093/NAR/GKAC773.
Wang, J. et al.(2023) 'Ag Comhtháthú Trascriptómaíochta Spásúlachta agus Seicheamhú RNA núicléas Aonair Nochtann na Straitéisí Teiripeacha Féideartha le haghaidh Leiomyoma Útarach', Iris Idirnáisiúnta na nEolaíochtaí Bitheolaíochta, 19(8), lgh. 2515–2530.doi: 10.7150/IJBS.83510.
