Single-nucleus RNA Sequencing

De foarútgong yn it fêstlizzen fan ien sel en technyk foar yndividuele bibleteekbou, kombineare mei sequencing mei hege trochput, makket geneekspresjestúdzjes mooglik op sel-foar-sel basis.It makket in djippere en folsleine systeemanalyse mooglik op komplekse selpopulaasjes, wêryn it foar in grut part maskering fan har heterogeniteit foarkomt troch it gemiddelde fan alle sellen te nimmen.

Guon sellen binne lykwols net geskikt om te wurde makke yn ien-sel-suspensie, dus oare metoaden foar tarieding fan monsters - kearnekstraksje út weefsels binne nedich, dat is, kearn wurdt direkt ekstrahearre út weefsels as sel en taret yn ienkearnsuspensje foar single- sel sequencing.

BMK jout 10 × Genomics Chromium TM basearre single-cell RNA sequencing tsjinst.Dizze tsjinst is in protte brûkt yn stúdzjes oer sykte-relatearre stúdzjes, lykas differinsjaasje fan ymmúnsellen, tumorheterogeniteit, weefselûntwikkeling, ensfh.

Romtlike transkriptoomchip: 10 × Genomics

Platfoarm: Illumina NovaSeq Platfoarm

Kontakt mei ús opnimme

Service Details

Bioinformatika

Demo Results

Technysk prinsipe

De isolemint fan kearnen wurdt berikt troch 10 × Genomics Chromium TM, dy't bestiet út acht-kanaal microfluidics systeem mei dûbele krusingen.Yn dit systeem, in gel kralen mei barcodes en primer, enzymen en in inkele kearn wurde ynkapsele yn nanoliter-sized oalje drop, generearje Gel Bead-in-Emulsion (GEM).Sadree't GEM binne foarme, sel lysis en frijlitting fan barcodes wurde útfierd yn elke GEM.mRNA wurde omkearde transkribearre yn cDNA-molekulen mei 10 × barcodes en UMI, dy't fierder ûnderwurpen binne oan standert sequencing-biblioteekkonstruksje.

Tissue is net geskikt foar tarieding fan single-cell suspension

Sel / Tissue	Reden
Unfresh beferzen weefsel	Net mooglik om frisse of lang bewarre organisaasjes te krijen
Spiersel, Megakaryozyten, Fet ...	Seldiameter is te grut om it ynstrumint yn te gean
Lever…	Te kwetsber om te brekken, net yn steat om inkele sellen te ûnderskieden
Neuronsel, brein ...	Mear gefoelich, maklik te stressjen, sil de resultaten fan sequencing feroarje
Pankreas, schildklier ...	Ryk yn endogene enzymen, dy't ynfloed hawwe op 'e produksje fan iensellige suspensie

Single-nucleus vs Single-cell

Single-kearn	Single-cell
Unbeheinde seldiameter	Sel diameter: 10-40 μm
It materiaal kin beferzen weefsel wêze	It materiaal moat frisse weefsel wêze
Lege stress fan beferzen sellen	Enzymbehanneling kin sel-stressreaksje feroarsaakje
Gjin reade bloedsellen hoege te ferwiderjen	Reade bloedsellen moatte fuortsmiten wurde
Nuclear drukt bioynformaasje út	De hiele sel drukt bioynformaasje út